Doublet Group distance statistics: 55545

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.001, 0.004, 0.007, 0.007 max_d=0.007 avg_d=0.004 std_dev=0.003
C5	A	0, 0.003, 0.007, 0.012, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.007 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.002, 0.012, 0.022, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.012 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.002, 0.015, 0.027, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.015 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.003, 0.016, 0.028, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.016 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.002, 0.016, 0.029, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.016 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.003, 0.017, 0.031, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.017 std_dev=0.014
O2	A	0, 0.008, 0.034, 0.061, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.034 std_dev=0.026
O4	A	0, -0.005, 0.061, 0.127, 0.170 max_d=0.170 avg_d=0.061 std_dev=0.066
N9	B	0, 0.111, 0.268, 0.424, 0.396 max_d=0.396 avg_d=0.268 std_dev=0.157
C4	B	0, 0.084, 0.278, 0.473, 0.520 max_d=0.520 avg_d=0.278 std_dev=0.194
C5	B	0, 0.071, 0.282, 0.492, 0.499 max_d=0.499 avg_d=0.282 std_dev=0.210
C8	B	0, 0.072, 0.283, 0.494, 0.581 max_d=0.581 avg_d=0.283 std_dev=0.211
C1'	B	0, 0.178, 0.451, 0.724, 0.728 max_d=0.728 avg_d=0.451 std_dev=0.273
O4'	B	0, 0.140, 0.415, 0.689, 0.672 max_d=0.672 avg_d=0.415 std_dev=0.275
C6	B	0, 0.071, 0.347, 0.623, 0.651 max_d=0.651 avg_d=0.347 std_dev=0.276
N7	B	0, 0.137, 0.414, 0.691, 0.772 max_d=0.772 avg_d=0.414 std_dev=0.277
N1	B	0, 0.065, 0.346, 0.627, 0.769 max_d=0.769 avg_d=0.346 std_dev=0.281
N3	B	0, 0.155, 0.482, 0.810, 0.802 max_d=0.802 avg_d=0.482 std_dev=0.328
C2	B	0, 0.123, 0.478, 0.834, 0.846 max_d=0.846 avg_d=0.478 std_dev=0.356
O4'	A	0, 0.172, 0.528, 0.884, 0.881 max_d=0.881 avg_d=0.528 std_dev=0.356
O6	B	0, 0.190, 0.560, 0.931, 0.971 max_d=0.971 avg_d=0.560 std_dev=0.371
C2'	B	0, 0.260, 0.654, 1.048, 1.054 max_d=1.054 avg_d=0.654 std_dev=0.394
C2'	A	0, 0.186, 0.588, 0.990, 1.047 max_d=1.047 avg_d=0.588 std_dev=0.402
O2'	A	0, 0.139, 0.603, 1.068, 1.288 max_d=1.288 avg_d=0.603 std_dev=0.464
N2	B	0, 0.251, 0.729, 1.207, 1.224 max_d=1.224 avg_d=0.729 std_dev=0.478
C3'	B	0, 0.289, 0.829, 1.368, 1.329 max_d=1.329 avg_d=0.829 std_dev=0.540
O2'	B	0, 0.373, 0.928, 1.483, 1.409 max_d=1.409 avg_d=0.928 std_dev=0.555
C4'	A	0, 0.262, 0.837, 1.412, 1.447 max_d=1.447 avg_d=0.837 std_dev=0.575
O5'	B	0, 0.193, 0.796, 1.399, 1.495 max_d=1.495 avg_d=0.796 std_dev=0.603
P	A	0, 0.449, 1.062, 1.676, 1.436 max_d=1.436 avg_d=1.062 std_dev=0.614
C3'	A	0, 0.296, 0.930, 1.563, 1.564 max_d=1.564 avg_d=0.930 std_dev=0.633
C4'	B	0, 0.168, 0.802, 1.436, 1.604 max_d=1.604 avg_d=0.802 std_dev=0.634
O5'	A	0, 0.334, 0.974, 1.613, 1.759 max_d=1.759 avg_d=0.974 std_dev=0.639
OP1	A	0, 0.423, 1.157, 1.891, 1.923 max_d=1.923 avg_d=1.157 std_dev=0.734
O3'	B	0, 0.410, 1.148, 1.885, 1.848 max_d=1.848 avg_d=1.148 std_dev=0.737
P	B	0, 0.064, 0.831, 1.597, 2.073 max_d=2.073 avg_d=0.831 std_dev=0.767
OP2	B	0, 0.190, 0.978, 1.765, 2.179 max_d=2.179 avg_d=0.978 std_dev=0.787
OP2	A	0, 0.511, 1.387, 2.263, 2.418 max_d=2.418 avg_d=1.387 std_dev=0.876
O3'	A	0, 0.424, 1.305, 2.186, 2.200 max_d=2.200 avg_d=1.305 std_dev=0.881
C5'	B	0, 0.126, 1.102, 2.078, 2.523 max_d=2.523 avg_d=1.102 std_dev=0.976
OP1	B	0, 0.152, 1.132, 2.113, 2.700 max_d=2.700 avg_d=1.132 std_dev=0.981
C5'	A	0, 0.475, 1.527, 2.579, 2.539 max_d=2.539 avg_d=1.527 std_dev=1.052

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.09	0.24	0.76	0.45
C2	0.01	0.00	0.08	0.15	0.01	0.08	0.01	0.22	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.15	0.01	0.03	0.27	0.27	0.68	0.36
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.05	0.03	0.10	0.02	0.11	0.02	0.05	0.17	0.00	0.02	0.06	0.01	0.24	0.19	0.58	0.31
C3'	0.02	0.15	0.00	0.00	0.18	0.01	0.20	0.03	0.19	0.10	0.17	0.19	0.01	0.00	0.21	0.01	0.36	0.37	0.39	0.25
C4	0.01	0.01	0.05	0.18	0.00	0.16	0.01	0.36	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.22	0.00	0.02	0.43	0.28	0.48	0.23
C4'	0.00	0.08	0.03	0.01	0.16	0.00	0.18	0.00	0.15	0.08	0.13	0.06	0.06	0.02	0.19	0.01	0.01	0.10	0.52	0.23
C5	0.01	0.01	0.10	0.20	0.01	0.18	0.00	0.36	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.24	0.01	0.03	0.46	0.29	0.49	0.22
C5'	0.05	0.22	0.02	0.03	0.36	0.00	0.36	0.00	0.29	0.20	0.30	0.16	0.05	0.04	0.40	0.01	0.01	0.27	0.41	0.01
C6	0.01	0.01	0.11	0.19	0.00	0.15	0.00	0.29	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.21	0.01	0.03	0.39	0.29	0.66	0.31
N1	0.00	0.00	0.02	0.10	0.01	0.08	0.01	0.20	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.09	0.01	0.01	0.26	0.27	0.72	0.38
N3	0.01	0.00	0.05	0.17	0.00	0.13	0.01	0.30	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.19	0.01	0.02	0.35	0.28	0.59	0.30
O2	0.02	0.00	0.17	0.19	0.01	0.06	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00	0.15	0.22	0.01	0.05	0.20	0.25	0.71	0.39
O2'	0.02	0.08	0.00	0.01	0.04	0.06	0.08	0.05	0.08	0.03	0.05	0.15	0.00	0.05	0.05	0.05	0.10	0.13	0.56	0.28
O3'	0.00	0.15	0.02	0.00	0.22	0.02	0.24	0.04	0.21	0.09	0.19	0.22	0.05	0.00	0.26	0.01	0.34	0.57	0.21	0.26
O4	0.01	0.01	0.06	0.21	0.00	0.19	0.01	0.40	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.26	0.00	0.02	0.47	0.27	0.37	0.17
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.05	0.05	0.01	0.02	0.00	0.09	0.29	0.80	0.52
O5'	0.09	0.27	0.24	0.36	0.43	0.01	0.46	0.01	0.39	0.26	0.35	0.20	0.10	0.34	0.47	0.09	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.24	0.27	0.19	0.37	0.28	0.10	0.29	0.27	0.29	0.27	0.28	0.25	0.13	0.57	0.27	0.29	0.01	0.00	0.06	0.01
OP2	0.76	0.68	0.58	0.39	0.48	0.52	0.49	0.41	0.66	0.72	0.59	0.71	0.56	0.21	0.37	0.80	0.02	0.06	0.00	0.01
P	0.45	0.36	0.31	0.25	0.23	0.23	0.22	0.01	0.31	0.38	0.30	0.39	0.28	0.26	0.17	0.52	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.11	0.09	0.07	0.04	0.09	0.13	0.30	0.18	0.10	0.07	0.24	0.12	0.18	0.04	0.24	0.07	0.10	0.36	0.31	0.38	0.60	0.38
C2	0.09	0.16	0.06	0.09	0.05	0.11	0.13	0.35	0.18	0.11	0.05	0.32	0.15	0.19	0.05	0.19	0.05	0.08	0.35	0.33	0.39	0.59	0.39
C2'	0.13	0.17	0.11	0.20	0.19	0.16	0.27	0.36	0.32	0.24	0.26	0.18	0.15	0.30	0.18	0.06	0.13	0.15	0.32	0.42	0.30	0.52	0.31
C3'	0.23	0.23	0.20	0.27	0.29	0.25	0.38	0.43	0.40	0.37	0.32	0.21	0.23	0.42	0.29	0.12	0.20	0.25	0.44	0.49	0.42	0.63	0.44
C4	0.08	0.26	0.03	0.15	0.08	0.19	0.09	0.48	0.07	0.13	0.18	0.38	0.20	0.19	0.06	0.13	0.10	0.08	0.36	0.22	0.44	0.63	0.44
C4'	0.09	0.10	0.03	0.12	0.15	0.12	0.26	0.35	0.30	0.25	0.18	0.17	0.10	0.32	0.15	0.13	0.06	0.12	0.40	0.42	0.41	0.64	0.43
C5	0.08	0.23	0.03	0.14	0.07	0.18	0.10	0.47	0.09	0.14	0.14	0.36	0.18	0.20	0.06	0.15	0.09	0.09	0.36	0.22	0.44	0.64	0.44
C5'	0.24	0.18	0.18	0.26	0.30	0.27	0.43	0.47	0.44	0.44	0.29	0.15	0.19	0.51	0.32	0.15	0.19	0.29	0.56	0.56	0.59	0.81	0.61
C6	0.08	0.19	0.05	0.11	0.06	0.14	0.12	0.42	0.13	0.14	0.08	0.33	0.16	0.20	0.06	0.18	0.05	0.08	0.36	0.27	0.43	0.63	0.42
N1	0.09	0.15	0.06	0.09	0.05	0.11	0.13	0.36	0.17	0.12	0.05	0.30	0.14	0.19	0.05	0.20	0.04	0.08	0.36	0.31	0.40	0.61	0.40
N3	0.09	0.24	0.05	0.12	0.07	0.15	0.11	0.41	0.13	0.12	0.11	0.37	0.18	0.18	0.05	0.16	0.06	0.08	0.36	0.30	0.41	0.61	0.41
O2	0.09	0.09	0.07	0.08	0.04	0.08	0.15	0.29	0.23	0.11	0.14	0.26	0.11	0.19	0.04	0.21	0.06	0.08	0.34	0.35	0.35	0.56	0.36
O2'	0.16	0.19	0.15	0.22	0.19	0.18	0.25	0.35	0.31	0.21	0.27	0.21	0.18	0.27	0.17	0.13	0.17	0.17	0.21	0.40	0.17	0.40	0.19
O3'	0.31	0.31	0.28	0.34	0.36	0.31	0.44	0.45	0.46	0.44	0.38	0.28	0.31	0.49	0.37	0.18	0.26	0.32	0.46	0.54	0.42	0.63	0.45
O4	0.08	0.30	0.04	0.18	0.10	0.23	0.07	0.54	0.08	0.13	0.27	0.39	0.22	0.17	0.07	0.10	0.15	0.09	0.35	0.11	0.45	0.64	0.45
O4'	0.11	0.12	0.12	0.07	0.04	0.09	0.12	0.30	0.16	0.10	0.05	0.25	0.13	0.18	0.03	0.27	0.12	0.09	0.37	0.29	0.41	0.62	0.41
O5'	0.33	0.35	0.30	0.20	0.28	0.24	0.22	0.16	0.21	0.22	0.27	0.44	0.35	0.21	0.27	0.42	0.25	0.32	0.67	0.20	0.71	0.94	0.72
OP1	0.26	0.30	0.25	0.38	0.29	0.39	0.34	0.68	0.35	0.35	0.30	0.36	0.29	0.40	0.29	0.17	0.33	0.29	0.19	0.44	0.25	0.44	0.26
OP2	0.60	0.66	0.59	0.69	0.62	0.70	0.62	0.95	0.63	0.61	0.65	0.70	0.64	0.61	0.61	0.50	0.64	0.61	0.29	0.63	0.30	0.42	0.30
P	0.35	0.41	0.32	0.42	0.36	0.43	0.35	0.68	0.36	0.35	0.38	0.48	0.39	0.36	0.35	0.25	0.37	0.36	0.20	0.38	0.27	0.49	0.27

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.30	0.01	0.19	0.22	0.15
C2	0.02	0.00	0.10	0.08	0.00	0.03	0.00	0.19	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.18	0.11	0.02	0.40	0.01	0.35	0.53	0.35
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.06	0.02	0.06	0.03	0.08	0.05	0.09	0.11	0.09	0.05	0.03	0.00	0.03	0.00	0.20	0.08	0.16	0.24	0.11
C3'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.04	0.00	0.03	0.03	0.05	0.07	0.07	0.09	0.07	0.05	0.03	0.02	0.00	0.03	0.15	0.05	0.23	0.21	0.13
C4	0.01	0.00	0.06	0.04	0.00	0.06	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.04	0.01	0.42	0.01	0.36	0.49	0.36
C4'	0.00	0.03	0.02	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.11	0.15	0.07	0.04	0.02	0.15	0.08	0.06	0.02	0.00	0.00	0.13	0.05	0.15	0.12
C5	0.01	0.00	0.06	0.03	0.00	0.11	0.00	0.32	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.10	0.02	0.03	0.46	0.02	0.46	0.61	0.46
C5'	0.06	0.19	0.03	0.03	0.23	0.00	0.32	0.00	0.33	0.35	0.27	0.14	0.15	0.39	0.22	0.06	0.01	0.01	0.00	0.38	0.34	0.28	0.01
C6	0.01	0.00	0.08	0.05	0.01	0.11	0.01	0.33	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.13	0.05	0.03	0.46	0.00	0.48	0.66	0.48
C8	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.15	0.00	0.35	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.07	0.04	0.47	0.02	0.44	0.52	0.43
N1	0.02	0.00	0.09	0.07	0.01	0.07	0.01	0.27	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.17	0.10	0.01	0.43	0.01	0.42	0.61	0.42
N2	0.03	0.00	0.11	0.09	0.00	0.04	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.21	0.14	0.03	0.38	0.01	0.32	0.50	0.32
N3	0.02	0.00	0.09	0.07	0.00	0.02	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.16	0.09	0.02	0.38	0.01	0.31	0.45	0.30
N7	0.00	0.01	0.05	0.05	0.00	0.15	0.00	0.39	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.05	0.04	0.48	0.02	0.51	0.64	0.51
N9	0.00	0.01	0.03	0.03	0.00	0.08	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.01	0.02	0.41	0.02	0.33	0.41	0.32
O2'	0.01	0.18	0.00	0.02	0.11	0.06	0.10	0.06	0.13	0.03	0.17	0.21	0.16	0.06	0.04	0.00	0.04	0.04	0.04	0.13	0.09	0.07	0.12
O3'	0.01	0.11	0.03	0.00	0.04	0.02	0.02	0.01	0.05	0.07	0.10	0.14	0.09	0.05	0.01	0.04	0.00	0.01	0.16	0.05	0.16	0.14	0.15
O4'	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.00	0.03	0.01	0.03	0.04	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.04	0.01	0.00	0.29	0.05	0.17	0.09	0.11
O5'	0.30	0.40	0.20	0.15	0.42	0.00	0.46	0.00	0.46	0.47	0.43	0.38	0.38	0.48	0.41	0.04	0.16	0.29	0.00	0.47	0.00	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.08	0.05	0.01	0.13	0.02	0.38	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.13	0.05	0.05	0.47	0.00	0.54	0.72	0.53
OP1	0.19	0.35	0.16	0.23	0.36	0.05	0.46	0.34	0.48	0.44	0.42	0.32	0.31	0.51	0.33	0.09	0.16	0.17	0.00	0.54	0.00	0.01	0.00
OP2	0.22	0.53	0.24	0.21	0.49	0.15	0.61	0.28	0.66	0.52	0.61	0.50	0.45	0.64	0.41	0.07	0.14	0.09	0.01	0.72	0.01	0.00	0.00
P	0.15	0.35	0.11	0.13	0.36	0.12	0.46	0.01	0.48	0.43	0.42	0.32	0.30	0.51	0.32	0.12	0.15	0.11	0.00	0.53	0.00	0.00	0.00