Doublet Group distance statistics: 55548

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.006, 0.012, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.006 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.000, 0.006, 0.013, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.006 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.000, 0.009, 0.019, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.000, 0.010, 0.021, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.010 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.000, 0.014, 0.029, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.014 std_dev=0.014
O2	A	0, 0.000, 0.016, 0.033, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.016 std_dev=0.016
O4	A	0, 0.000, 0.025, 0.050, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.025 std_dev=0.025
C2'	A	0, 0.000, 0.080, 0.160, 0.160 max_d=0.160 avg_d=0.080 std_dev=0.080
O4'	A	0, 0.000, 0.128, 0.255, 0.255 max_d=0.255 avg_d=0.128 std_dev=0.128
O2'	A	0, 0.000, 0.136, 0.272, 0.272 max_d=0.272 avg_d=0.136 std_dev=0.136
O2'	B	0, 0.000, 0.182, 0.365, 0.365 max_d=0.365 avg_d=0.182 std_dev=0.182
C2'	B	0, 0.000, 0.189, 0.378, 0.378 max_d=0.378 avg_d=0.189 std_dev=0.189
N2	B	0, 0.000, 0.220, 0.440, 0.440 max_d=0.440 avg_d=0.220 std_dev=0.220
C2	B	0, 0.000, 0.243, 0.486, 0.486 max_d=0.486 avg_d=0.243 std_dev=0.243
O3'	B	0, 0.000, 0.244, 0.488, 0.488 max_d=0.488 avg_d=0.244 std_dev=0.244
N1	B	0, 0.000, 0.263, 0.527, 0.527 max_d=0.527 avg_d=0.263 std_dev=0.263
N3	B	0, 0.000, 0.266, 0.531, 0.531 max_d=0.531 avg_d=0.266 std_dev=0.266
C3'	A	0, 0.000, 0.272, 0.544, 0.544 max_d=0.544 avg_d=0.272 std_dev=0.272
C4	B	0, 0.000, 0.311, 0.623, 0.623 max_d=0.623 avg_d=0.311 std_dev=0.311
C6	B	0, 0.000, 0.315, 0.629, 0.629 max_d=0.629 avg_d=0.315 std_dev=0.315
C4'	A	0, 0.000, 0.335, 0.671, 0.671 max_d=0.671 avg_d=0.335 std_dev=0.335
O6	B	0, 0.000, 0.336, 0.672, 0.672 max_d=0.672 avg_d=0.336 std_dev=0.336
C3'	B	0, 0.000, 0.338, 0.676, 0.676 max_d=0.676 avg_d=0.338 std_dev=0.338
C1'	B	0, 0.000, 0.341, 0.681, 0.681 max_d=0.681 avg_d=0.341 std_dev=0.341
O3'	A	0, 0.000, 0.344, 0.689, 0.689 max_d=0.689 avg_d=0.344 std_dev=0.344
C5	B	0, 0.000, 0.345, 0.690, 0.690 max_d=0.690 avg_d=0.345 std_dev=0.345
N9	B	0, 0.000, 0.358, 0.717, 0.717 max_d=0.717 avg_d=0.358 std_dev=0.358
N7	B	0, 0.000, 0.418, 0.835, 0.835 max_d=0.835 avg_d=0.418 std_dev=0.418
C8	B	0, 0.000, 0.420, 0.840, 0.840 max_d=0.840 avg_d=0.420 std_dev=0.420
C4'	B	0, 0.000, 0.493, 0.986, 0.986 max_d=0.986 avg_d=0.493 std_dev=0.493
O4'	B	0, 0.000, 0.498, 0.996, 0.996 max_d=0.996 avg_d=0.498 std_dev=0.498
C5'	A	0, 0.000, 0.614, 1.227, 1.227 max_d=1.227 avg_d=0.614 std_dev=0.614
O5'	A	0, 0.000, 0.701, 1.403, 1.403 max_d=1.403 avg_d=0.701 std_dev=0.701
P	A	0, 0.000, 0.713, 1.426, 1.426 max_d=1.426 avg_d=0.713 std_dev=0.713
OP2	A	0, 0.000, 0.729, 1.459, 1.459 max_d=1.459 avg_d=0.729 std_dev=0.729
OP1	A	0, 0.000, 0.735, 1.470, 1.470 max_d=1.470 avg_d=0.735 std_dev=0.735
C5'	B	0, 0.000, 0.756, 1.513, 1.513 max_d=1.513 avg_d=0.756 std_dev=0.756
O5'	B	0, 0.000, 0.849, 1.699, 1.699 max_d=1.699 avg_d=0.849 std_dev=0.849
P	B	0, 0.000, 1.173, 2.347, 2.347 max_d=2.347 avg_d=1.173 std_dev=1.173
OP1	B	0, 0.000, 1.260, 2.521, 2.521 max_d=2.521 avg_d=1.260 std_dev=1.260
OP2	B	0, 0.000, 1.300, 2.601, 2.601 max_d=2.601 avg_d=1.300 std_dev=1.300

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.23	0.24	0.09	0.17
C2	0.01	0.00	0.02	0.07	0.01	0.03	0.01	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.06	0.01	0.01	0.31	0.29	0.17	0.24
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.13	0.19	0.03	0.11
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.11	0.00	0.10	0.00	0.08	0.06	0.10	0.05	0.00	0.00	0.12	0.01	0.08	0.21	0.05	0.07
C4	0.00	0.01	0.00	0.11	0.00	0.10	0.00	0.26	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.11	0.00	0.02	0.35	0.30	0.22	0.27
C4'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.10	0.00	0.13	0.00	0.12	0.06	0.06	0.02	0.01	0.01	0.11	0.00	0.01	0.14	0.14	0.02
C5	0.00	0.01	0.01	0.10	0.00	0.13	0.00	0.30	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.10	0.00	0.04	0.35	0.29	0.22	0.27
C5'	0.05	0.13	0.02	0.00	0.26	0.00	0.30	0.00	0.27	0.15	0.19	0.06	0.00	0.05	0.28	0.03	0.00	0.27	0.23	0.01
C6	0.01	0.00	0.02	0.08	0.00	0.12	0.00	0.27	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.00	0.04	0.35	0.29	0.20	0.26
N1	0.00	0.00	0.00	0.06	0.00	0.06	0.01	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.05	0.01	0.01	0.31	0.28	0.16	0.24
N3	0.00	0.00	0.01	0.10	0.00	0.06	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.09	0.01	0.00	0.33	0.29	0.20	0.26
O2	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00	0.05	0.04	0.02	0.03	0.28	0.27	0.15	0.22
O2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.05	0.05	0.00	0.01	0.05	0.05	0.03	0.05	0.09	0.03
O3'	0.00	0.06	0.01	0.00	0.11	0.01	0.10	0.05	0.07	0.05	0.09	0.04	0.01	0.00	0.12	0.01	0.12	0.08	0.19	0.07
O4	0.01	0.01	0.00	0.12	0.00	0.11	0.00	0.28	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.12	0.00	0.01	0.35	0.30	0.23	0.28
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.03	0.04	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.01	0.00	0.22	0.24	0.06	0.16
O5'	0.23	0.31	0.13	0.08	0.35	0.01	0.35	0.00	0.35	0.31	0.33	0.28	0.03	0.12	0.35	0.22	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.24	0.29	0.19	0.21	0.30	0.14	0.29	0.27	0.29	0.28	0.29	0.27	0.05	0.08	0.30	0.24	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.09	0.17	0.03	0.05	0.22	0.14	0.22	0.23	0.20	0.16	0.20	0.15	0.09	0.19	0.23	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.17	0.24	0.11	0.07	0.27	0.02	0.27	0.01	0.26	0.24	0.26	0.22	0.03	0.07	0.28	0.16	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.07	0.09	0.08	0.12	0.09	0.09	0.08	0.15	0.07	0.09	0.08	0.10	0.10	0.08	0.09	0.02	0.11	0.07	0.27	0.06	0.35	0.49	0.36
C2	0.11	0.15	0.11	0.14	0.13	0.14	0.12	0.20	0.11	0.12	0.13	0.15	0.15	0.11	0.13	0.06	0.12	0.12	0.31	0.07	0.39	0.52	0.40
C2'	0.09	0.11	0.12	0.15	0.10	0.10	0.08	0.15	0.07	0.09	0.08	0.14	0.12	0.08	0.10	0.08	0.16	0.08	0.26	0.05	0.32	0.45	0.33
C3'	0.15	0.18	0.16	0.18	0.17	0.15	0.17	0.21	0.17	0.17	0.17	0.19	0.18	0.17	0.17	0.11	0.18	0.14	0.32	0.16	0.38	0.53	0.40
C4	0.14	0.16	0.10	0.12	0.15	0.16	0.14	0.23	0.14	0.14	0.16	0.15	0.16	0.14	0.15	0.07	0.09	0.16	0.33	0.12	0.41	0.53	0.43
C4'	0.06	0.10	0.06	0.09	0.10	0.07	0.12	0.14	0.12	0.11	0.12	0.10	0.10	0.12	0.10	0.01	0.07	0.06	0.27	0.13	0.34	0.50	0.36
C5	0.12	0.15	0.10	0.12	0.13	0.14	0.13	0.21	0.13	0.13	0.14	0.15	0.15	0.12	0.13	0.07	0.10	0.14	0.31	0.11	0.40	0.52	0.42
C5'	0.16	0.21	0.14	0.18	0.22	0.17	0.25	0.25	0.27	0.24	0.25	0.19	0.20	0.27	0.22	0.05	0.14	0.18	0.40	0.29	0.48	0.66	0.51
C6	0.11	0.14	0.10	0.13	0.13	0.13	0.12	0.20	0.12	0.12	0.14	0.15	0.14	0.12	0.13	0.06	0.11	0.12	0.31	0.10	0.39	0.52	0.41
N1	0.10	0.14	0.10	0.14	0.12	0.12	0.11	0.19	0.10	0.12	0.12	0.15	0.14	0.11	0.12	0.06	0.12	0.11	0.30	0.08	0.38	0.51	0.39
N3	0.13	0.16	0.11	0.13	0.15	0.15	0.14	0.23	0.14	0.14	0.16	0.15	0.16	0.13	0.15	0.07	0.10	0.15	0.33	0.10	0.41	0.53	0.42
O2	0.10	0.12	0.10	0.14	0.12	0.12	0.10	0.19	0.07	0.11	0.08	0.12	0.13	0.10	0.12	0.05	0.12	0.11	0.30	0.04	0.37	0.50	0.38
O2'	0.06	0.04	0.01	0.02	0.04	0.04	0.05	0.00	0.05	0.04	0.05	0.03	0.03	0.05	0.04	0.06	0.05	0.08	0.12	0.06	0.17	0.32	0.18
O3'	0.13	0.16	0.15	0.17	0.16	0.13	0.15	0.17	0.15	0.15	0.15	0.17	0.16	0.15	0.15	0.10	0.17	0.12	0.29	0.14	0.34	0.49	0.36
O4	0.14	0.15	0.09	0.11	0.15	0.16	0.15	0.24	0.15	0.15	0.15	0.14	0.15	0.14	0.15	0.07	0.07	0.17	0.33	0.13	0.42	0.52	0.44
O4'	0.05	0.09	0.06	0.10	0.09	0.08	0.09	0.15	0.09	0.09	0.09	0.09	0.09	0.09	0.08	0.01	0.08	0.06	0.27	0.08	0.35	0.51	0.37
O5'	0.13	0.11	0.12	0.11	0.14	0.12	0.18	0.08	0.19	0.16	0.16	0.07	0.10	0.19	0.14	0.14	0.11	0.13	0.01	0.23	0.08	0.20	0.09
OP1	0.13	0.11	0.13	0.11	0.13	0.12	0.15	0.07	0.16	0.14	0.14	0.08	0.10	0.16	0.13	0.15	0.12	0.13	0.03	0.19	0.10	0.23	0.11
OP2	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.04	0.05	0.06	0.03	0.02	0.07	0.03	0.06	0.01	0.01	0.02	0.00	0.14	0.09	0.20	0.31	0.22
P	0.08	0.06	0.08	0.07	0.08	0.08	0.11	0.02	0.12	0.10	0.09	0.02	0.05	0.12	0.08	0.10	0.08	0.08	0.07	0.15	0.14	0.26	0.16

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.04	0.03	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.08	0.00	0.07	0.13	0.09
C2	0.03	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.02	0.03	0.14	0.01	0.18	0.31	0.20
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.03	0.04	0.03	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.04	0.05	0.10	0.06
C3'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.03	0.05	0.02
C4	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.02	0.00	0.14	0.00	0.17	0.27	0.19
C4'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.04	0.01	0.03	0.02	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00
C5	0.00	0.00	0.03	0.02	0.00	0.02	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.04	0.02	0.17	0.00	0.23	0.33	0.25
C5'	0.02	0.04	0.01	0.01	0.06	0.00	0.09	0.00	0.09	0.09	0.06	0.02	0.03	0.11	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.02	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.05	0.01	0.18	0.00	0.25	0.37	0.27
C8	0.02	0.00	0.03	0.03	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.05	0.15	0.00	0.18	0.23	0.20
N1	0.03	0.00	0.04	0.02	0.01	0.01	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.04	0.01	0.16	0.01	0.23	0.35	0.25
N2	0.04	0.00	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.01	0.04	0.13	0.01	0.16	0.30	0.19
N3	0.03	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.00	0.03	0.12	0.01	0.15	0.26	0.17
N7	0.02	0.00	0.03	0.02	0.00	0.04	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.05	0.18	0.00	0.24	0.31	0.26
N9	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.12	0.00	0.14	0.20	0.15
O2'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.07	0.08	0.06	0.02	0.01	0.00	0.04	0.01	0.03	0.06	0.01	0.07	0.03
O3'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.05	0.05	0.04	0.01	0.00	0.05	0.02	0.04	0.00	0.01	0.04	0.06	0.03	0.03	0.04
O4'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.05	0.01	0.04	0.03	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.03	0.04	0.07	0.04
O5'	0.08	0.14	0.05	0.02	0.14	0.01	0.17	0.01	0.18	0.15	0.16	0.13	0.12	0.18	0.12	0.03	0.04	0.04	0.00	0.20	0.01	0.01	0.00
O6	0.00	0.01	0.04	0.02	0.00	0.03	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.06	0.03	0.20	0.00	0.29	0.39	0.30
OP1	0.07	0.18	0.05	0.03	0.17	0.01	0.23	0.01	0.25	0.18	0.23	0.16	0.15	0.24	0.14	0.01	0.03	0.04	0.01	0.29	0.00	0.00	0.00
OP2	0.13	0.31	0.10	0.05	0.27	0.02	0.33	0.00	0.37	0.23	0.35	0.30	0.26	0.31	0.20	0.07	0.03	0.07	0.01	0.39	0.00	0.00	0.00
P	0.09	0.20	0.06	0.02	0.19	0.00	0.25	0.01	0.27	0.20	0.25	0.19	0.17	0.26	0.15	0.03	0.04	0.04	0.00	0.30	0.00	0.00	0.00