Doublet Group distance statistics: 55561

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.007, 0.014, 0.021, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.014 std_dev=0.007
N3	A	0, -0.001, 0.007, 0.016, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.007 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.006, 0.015, 0.024, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.015 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.003, 0.015, 0.026, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.015 std_dev=0.011
C5	A	0, -0.004, 0.008, 0.020, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.008 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.004, 0.016, 0.028, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.016 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.004, 0.018, 0.033, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.018 std_dev=0.014
O2	A	0, 0.006, 0.044, 0.081, 0.131 max_d=0.131 avg_d=0.044 std_dev=0.037
O4	A	0, 0.011, 0.055, 0.099, 0.146 max_d=0.146 avg_d=0.055 std_dev=0.044
O4'	A	0, -0.019, 0.140, 0.299, 0.546 max_d=0.546 avg_d=0.140 std_dev=0.159
C2'	A	0, -0.002, 0.183, 0.368, 0.658 max_d=0.658 avg_d=0.183 std_dev=0.185
O2	B	0, 0.142, 0.388, 0.633, 0.937 max_d=0.937 avg_d=0.388 std_dev=0.246
O5'	A	0, 0.217, 0.480, 0.743, 0.859 max_d=0.859 avg_d=0.480 std_dev=0.263
C4'	A	0, -0.109, 0.170, 0.449, 0.925 max_d=0.925 avg_d=0.170 std_dev=0.279
C5'	A	0, -0.010, 0.287, 0.585, 0.944 max_d=0.944 avg_d=0.287 std_dev=0.297
C3'	A	0, -0.068, 0.255, 0.579, 1.143 max_d=1.143 avg_d=0.255 std_dev=0.324
C2	B	0, 0.223, 0.556, 0.890, 1.299 max_d=1.299 avg_d=0.556 std_dev=0.334
N3	B	0, 0.232, 0.605, 0.978, 1.458 max_d=1.458 avg_d=0.605 std_dev=0.373
P	A	0, 0.294, 0.675, 1.056, 1.269 max_d=1.269 avg_d=0.675 std_dev=0.381
O2'	A	0, -0.129, 0.320, 0.768, 1.531 max_d=1.531 avg_d=0.320 std_dev=0.449
C4	B	0, 0.337, 0.811, 1.285, 1.877 max_d=1.877 avg_d=0.811 std_dev=0.474
N1	B	0, 0.299, 0.774, 1.250, 1.590 max_d=1.590 avg_d=0.774 std_dev=0.475
O4	B	0, 0.360, 0.874, 1.388, 1.998 max_d=1.998 avg_d=0.874 std_dev=0.514
C5	B	0, 0.435, 1.001, 1.568, 2.164 max_d=2.164 avg_d=1.001 std_dev=0.567
C1'	B	0, 0.195, 0.782, 1.368, 2.047 max_d=2.047 avg_d=0.782 std_dev=0.587
C6	B	0, 0.397, 0.988, 1.579, 2.016 max_d=2.016 avg_d=0.988 std_dev=0.591
O3'	A	0, -0.208, 0.419, 1.047, 2.175 max_d=2.175 avg_d=0.419 std_dev=0.627
C2'	B	0, 0.191, 0.857, 1.523, 2.387 max_d=2.387 avg_d=0.857 std_dev=0.666
OP1	A	0, 0.327, 0.999, 1.671, 2.503 max_d=2.503 avg_d=0.999 std_dev=0.672
O2'	B	0, 0.047, 0.805, 1.564, 2.733 max_d=2.733 avg_d=0.805 std_dev=0.759
O4'	B	0, 0.164, 0.965, 1.767, 2.878 max_d=2.878 avg_d=0.965 std_dev=0.801
C3'	B	0, 0.222, 1.079, 1.936, 3.089 max_d=3.089 avg_d=1.079 std_dev=0.857
OP2	A	0, 0.067, 0.934, 1.802, 3.182 max_d=3.182 avg_d=0.934 std_dev=0.868
C4'	B	0, 0.147, 1.116, 2.086, 3.506 max_d=3.506 avg_d=1.116 std_dev=0.969
O3'	B	0, 0.163, 1.217, 2.271, 3.809 max_d=3.809 avg_d=1.217 std_dev=1.054
O5'	B	0, 0.422, 1.485, 2.548, 3.867 max_d=3.867 avg_d=1.485 std_dev=1.063
C5'	B	0, 0.201, 1.357, 2.514, 4.205 max_d=4.205 avg_d=1.357 std_dev=1.156
OP2	B	0, 0.529, 1.790, 3.052, 4.501 max_d=4.501 avg_d=1.790 std_dev=1.262
P	B	0, 0.427, 1.695, 2.964, 4.612 max_d=4.612 avg_d=1.695 std_dev=1.269
OP1	B	0, 0.369, 1.844, 3.319, 5.386 max_d=5.386 avg_d=1.844 std_dev=1.475

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.03	0.04	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01	0.22	0.03	0.01	0.08	0.36	0.34	0.23
C2	0.01	0.00	0.10	0.07	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.21	0.03	0.05	0.06	0.55	0.31	0.24
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.03	0.01	0.07	0.13	0.09	0.02	0.07	0.19	0.01	0.03	0.03	0.02	0.25	0.40	0.28	0.30
C3'	0.02	0.07	0.00	0.00	0.14	0.01	0.16	0.02	0.14	0.08	0.10	0.06	0.01	0.01	0.15	0.01	0.05	0.23	0.09	0.11
C4	0.03	0.01	0.03	0.14	0.00	0.07	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.21	0.08	0.00	0.05	0.11	0.73	0.21	0.22
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.07	0.00	0.10	0.01	0.10	0.04	0.04	0.02	0.13	0.01	0.08	0.01	0.02	0.17	0.27	0.05
C5	0.03	0.01	0.07	0.16	0.01	0.10	0.00	0.09	0.00	0.02	0.01	0.01	0.26	0.03	0.02	0.07	0.13	0.74	0.20	0.22
C5'	0.04	0.04	0.13	0.02	0.07	0.01	0.09	0.00	0.09	0.04	0.04	0.03	0.02	0.14	0.08	0.02	0.01	0.26	0.27	0.01
C6	0.02	0.01	0.09	0.14	0.01	0.10	0.00	0.09	0.00	0.01	0.02	0.03	0.24	0.04	0.01	0.08	0.10	0.65	0.23	0.23
N1	0.01	0.01	0.02	0.08	0.01	0.04	0.02	0.04	0.01	0.00	0.01	0.03	0.12	0.14	0.02	0.02	0.06	0.53	0.30	0.24
N3	0.01	0.00	0.07	0.10	0.01	0.04	0.01	0.04	0.02	0.01	0.00	0.02	0.12	0.17	0.02	0.04	0.08	0.65	0.27	0.24
O2	0.04	0.01	0.19	0.06	0.02	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.02	0.00	0.16	0.29	0.05	0.06	0.07	0.45	0.33	0.22
O2'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.21	0.13	0.26	0.02	0.24	0.12	0.12	0.16	0.00	0.02	0.22	0.08	0.23	0.42	0.28	0.30
O3'	0.22	0.21	0.03	0.01	0.08	0.01	0.03	0.14	0.04	0.14	0.17	0.29	0.02	0.00	0.08	0.14	0.13	0.52	0.15	0.26
O4	0.03	0.03	0.03	0.15	0.00	0.08	0.02	0.08	0.01	0.02	0.02	0.05	0.22	0.08	0.00	0.05	0.13	0.76	0.18	0.20
O4'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.05	0.01	0.07	0.02	0.08	0.02	0.04	0.06	0.08	0.14	0.05	0.00	0.04	0.17	0.41	0.15
O5'	0.08	0.06	0.25	0.05	0.11	0.02	0.13	0.01	0.10	0.06	0.08	0.07	0.23	0.13	0.13	0.04	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.36	0.55	0.40	0.23	0.73	0.17	0.74	0.26	0.65	0.53	0.65	0.45	0.42	0.52	0.76	0.17	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.34	0.31	0.28	0.09	0.21	0.27	0.20	0.27	0.23	0.30	0.27	0.33	0.28	0.15	0.18	0.41	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.23	0.24	0.30	0.11	0.22	0.05	0.22	0.01	0.23	0.24	0.24	0.22	0.30	0.26	0.20	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.07	0.03	0.16	0.13	0.08	0.06	0.11	0.07	0.10	0.06	0.05	0.05	0.21	0.18	0.07	0.09	0.08	0.13	0.07	0.08
C2	0.07	0.03	0.12	0.10	0.05	0.07	0.08	0.07	0.08	0.06	0.04	0.03	0.15	0.12	0.04	0.08	0.07	0.08	0.10	0.06
C2'	0.27	0.15	0.35	0.34	0.10	0.30	0.13	0.27	0.17	0.19	0.09	0.16	0.40	0.38	0.08	0.27	0.26	0.19	0.30	0.25
C3'	0.07	0.04	0.13	0.09	0.07	0.08	0.11	0.12	0.10	0.06	0.03	0.08	0.18	0.12	0.07	0.10	0.12	0.22	0.09	0.14
C4	0.07	0.06	0.12	0.11	0.09	0.11	0.07	0.09	0.06	0.05	0.08	0.04	0.21	0.18	0.12	0.08	0.06	0.08	0.13	0.06
C4'	0.16	0.08	0.09	0.13	0.13	0.24	0.20	0.30	0.20	0.15	0.09	0.05	0.09	0.10	0.11	0.25	0.27	0.40	0.23	0.30
C5	0.08	0.05	0.11	0.11	0.07	0.13	0.06	0.12	0.06	0.05	0.07	0.04	0.19	0.18	0.10	0.10	0.08	0.12	0.10	0.05
C5'	0.19	0.09	0.14	0.19	0.12	0.30	0.19	0.36	0.21	0.16	0.08	0.07	0.14	0.18	0.08	0.28	0.31	0.45	0.25	0.34
C6	0.06	0.03	0.06	0.07	0.04	0.11	0.06	0.11	0.07	0.05	0.04	0.03	0.12	0.11	0.05	0.09	0.08	0.13	0.07	0.06
N1	0.05	0.03	0.09	0.07	0.05	0.06	0.08	0.08	0.08	0.05	0.03	0.04	0.11	0.10	0.04	0.08	0.07	0.11	0.07	0.05
N3	0.06	0.04	0.08	0.08	0.05	0.07	0.06	0.06	0.06	0.05	0.05	0.03	0.14	0.11	0.06	0.07	0.06	0.06	0.13	0.07
O2	0.13	0.07	0.24	0.20	0.12	0.13	0.14	0.11	0.12	0.09	0.10	0.05	0.31	0.25	0.12	0.11	0.11	0.09	0.12	0.09
O2'	0.37	0.08	0.52	0.58	0.10	0.57	0.10	0.55	0.19	0.20	0.10	0.08	0.65	0.68	0.16	0.45	0.46	0.44	0.42	0.44
O3'	0.34	0.34	0.22	0.27	0.44	0.37	0.49	0.44	0.46	0.39	0.38	0.26	0.15	0.21	0.44	0.41	0.46	0.58	0.45	0.50
O4	0.09	0.08	0.16	0.15	0.14	0.12	0.10	0.09	0.08	0.07	0.13	0.07	0.26	0.23	0.18	0.09	0.07	0.07	0.17	0.08
O4'	0.20	0.11	0.11	0.15	0.15	0.28	0.21	0.33	0.23	0.18	0.11	0.07	0.10	0.12	0.12	0.29	0.29	0.40	0.23	0.31
O5'	0.11	0.04	0.09	0.13	0.04	0.22	0.09	0.26	0.11	0.08	0.05	0.07	0.12	0.16	0.07	0.18	0.20	0.32	0.12	0.21
OP1	0.55	0.60	0.57	0.56	0.60	0.54	0.60	0.53	0.58	0.58	0.62	0.61	0.56	0.57	0.59	0.52	0.53	0.58	0.47	0.50
OP2	0.58	0.35	0.69	0.78	0.29	0.80	0.40	0.81	0.47	0.46	0.28	0.34	0.81	0.91	0.22	0.64	0.70	0.85	0.54	0.67
P	0.37	0.26	0.39	0.43	0.24	0.48	0.30	0.50	0.34	0.32	0.23	0.24	0.44	0.48	0.19	0.41	0.44	0.55	0.34	0.42

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.02	0.08	0.05
C2	0.02	0.00	0.03	0.05	0.01	0.03	0.02	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.05	0.02	0.02	0.08	0.09	0.17	0.11
C2'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.04	0.00	0.01	0.04	0.01	0.03	0.04	0.05	0.04
C3'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.08	0.00	0.08	0.01	0.07	0.04	0.05	0.05	0.02	0.01	0.09	0.01	0.04	0.05	0.05	0.04
C4	0.02	0.01	0.03	0.08	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.09	0.01	0.03	0.13	0.19	0.26	0.18
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.07	0.00	0.07	0.00	0.06	0.03	0.04	0.04	0.05	0.02	0.08	0.00	0.01	0.05	0.02	0.01
C5	0.02	0.02	0.03	0.08	0.00	0.07	0.00	0.11	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.10	0.01	0.02	0.13	0.19	0.26	0.18
C5'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.11	0.00	0.11	0.00	0.10	0.06	0.08	0.05	0.05	0.03	0.12	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.03	0.07	0.01	0.06	0.00	0.10	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.09	0.02	0.02	0.11	0.13	0.19	0.14
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.03	0.02	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.05	0.03	0.01	0.07	0.08	0.15	0.10
N3	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.04	0.01	0.08	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.06	0.02	0.02	0.11	0.14	0.22	0.15
O2	0.03	0.01	0.04	0.05	0.01	0.04	0.02	0.05	0.02	0.02	0.01	0.00	0.07	0.05	0.02	0.04	0.07	0.07	0.16	0.10
O2'	0.01	0.05	0.00	0.02	0.02	0.05	0.03	0.05	0.03	0.02	0.04	0.07	0.00	0.02	0.03	0.04	0.04	0.08	0.05	0.05
O3'	0.02	0.05	0.01	0.01	0.09	0.02	0.10	0.03	0.09	0.05	0.06	0.05	0.02	0.00	0.10	0.02	0.06	0.10	0.09	0.07
O4	0.03	0.02	0.04	0.09	0.01	0.08	0.01	0.12	0.02	0.03	0.02	0.02	0.03	0.10	0.00	0.04	0.15	0.22	0.28	0.20
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.04	0.02	0.04	0.00	0.02	0.05	0.05	0.03
O5'	0.03	0.08	0.03	0.04	0.13	0.01	0.13	0.01	0.11	0.07	0.11	0.07	0.04	0.06	0.15	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.02	0.09	0.04	0.05	0.19	0.05	0.19	0.06	0.13	0.08	0.14	0.07	0.08	0.10	0.22	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.08	0.17	0.05	0.05	0.26	0.02	0.26	0.02	0.19	0.15	0.22	0.16	0.05	0.09	0.28	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.11	0.04	0.04	0.18	0.01	0.18	0.01	0.14	0.10	0.15	0.10	0.05	0.07	0.20	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00