Doublet Group distance statistics: 55563

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 5, 13, 14, 20, 8, 5, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.005, 0.012, 0.020, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.012 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.003, 0.010, 0.018, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.012, 0.025, 0.037, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.025 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.010, 0.023, 0.035, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.023 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.012, 0.024, 0.037, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.024 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.010, 0.023, 0.036, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.023 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.003, 0.017, 0.030, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.017 std_dev=0.013
O2	A	0, 0.031, 0.059, 0.088, 0.159 max_d=0.159 avg_d=0.059 std_dev=0.028
O4	A	0, 0.054, 0.119, 0.184, 0.273 max_d=0.273 avg_d=0.119 std_dev=0.065
N3	B	0, 0.186, 0.318, 0.451, 0.765 max_d=0.765 avg_d=0.318 std_dev=0.132
C2	B	0, 0.212, 0.351, 0.490, 0.757 max_d=0.757 avg_d=0.351 std_dev=0.139
C4	B	0, 0.218, 0.361, 0.504, 0.738 max_d=0.738 avg_d=0.361 std_dev=0.143
N2	B	0, 0.196, 0.343, 0.491, 0.810 max_d=0.810 avg_d=0.343 std_dev=0.147
N9	B	0, 0.220, 0.381, 0.541, 0.817 max_d=0.817 avg_d=0.381 std_dev=0.160
O4'	A	0, 0.042, 0.206, 0.370, 0.866 max_d=0.866 avg_d=0.206 std_dev=0.164
C1'	B	0, 0.201, 0.368, 0.535, 0.918 max_d=0.918 avg_d=0.368 std_dev=0.167
N1	B	0, 0.252, 0.421, 0.589, 0.767 max_d=0.767 avg_d=0.421 std_dev=0.169
C5	B	0, 0.255, 0.425, 0.595, 0.833 max_d=0.833 avg_d=0.425 std_dev=0.170
O2'	B	0, 0.238, 0.413, 0.589, 0.962 max_d=0.962 avg_d=0.413 std_dev=0.175
C2'	B	0, 0.225, 0.405, 0.584, 0.988 max_d=0.988 avg_d=0.405 std_dev=0.179
C6	B	0, 0.276, 0.464, 0.653, 0.811 max_d=0.811 avg_d=0.464 std_dev=0.188
C8	B	0, 0.250, 0.440, 0.631, 1.047 max_d=1.047 avg_d=0.440 std_dev=0.190
N7	B	0, 0.271, 0.467, 0.663, 1.101 max_d=1.101 avg_d=0.467 std_dev=0.196
O4'	B	0, 0.216, 0.418, 0.620, 1.240 max_d=1.240 avg_d=0.418 std_dev=0.202
C2'	A	0, -0.008, 0.207, 0.422, 1.055 max_d=1.055 avg_d=0.207 std_dev=0.215
C4'	B	0, 0.254, 0.479, 0.704, 1.343 max_d=1.343 avg_d=0.479 std_dev=0.225
O6	B	0, 0.326, 0.556, 0.787, 1.045 max_d=1.045 avg_d=0.556 std_dev=0.230
C3'	B	0, 0.286, 0.520, 0.753, 1.367 max_d=1.367 avg_d=0.520 std_dev=0.234
C5'	B	0, 0.287, 0.547, 0.807, 1.552 max_d=1.552 avg_d=0.547 std_dev=0.260
C4'	A	0, -0.004, 0.261, 0.527, 1.517 max_d=1.517 avg_d=0.261 std_dev=0.265
O3'	B	0, 0.333, 0.607, 0.882, 1.617 max_d=1.617 avg_d=0.607 std_dev=0.275
C3'	A	0, -0.097, 0.196, 0.490, 1.751 max_d=1.751 avg_d=0.196 std_dev=0.293
O5'	A	0, 0.118, 0.450, 0.782, 1.440 max_d=1.440 avg_d=0.450 std_dev=0.332
P	A	0, 0.147, 0.492, 0.837, 2.231 max_d=2.231 avg_d=0.492 std_dev=0.345
O5'	B	0, 0.268, 0.625, 0.981, 2.558 max_d=2.558 avg_d=0.625 std_dev=0.356
O2'	A	0, 0.029, 0.393, 0.757, 2.198 max_d=2.198 avg_d=0.393 std_dev=0.364
C5'	A	0, 0.015, 0.387, 0.759, 1.754 max_d=1.754 avg_d=0.387 std_dev=0.372
OP2	A	0, 0.157, 0.590, 1.024, 2.389 max_d=2.389 avg_d=0.590 std_dev=0.434
O3'	A	0, -0.252, 0.219, 0.691, 2.809 max_d=2.809 avg_d=0.219 std_dev=0.471
P	B	0, 0.219, 0.718, 1.218, 3.899 max_d=3.899 avg_d=0.718 std_dev=0.500
OP2	B	0, 0.243, 0.823, 1.403, 4.631 max_d=4.631 avg_d=0.823 std_dev=0.580
OP1	B	0, 0.217, 0.821, 1.424, 4.849 max_d=4.849 avg_d=0.821 std_dev=0.604
OP1	A	0, -0.066, 0.672, 1.410, 4.033 max_d=4.033 avg_d=0.672 std_dev=0.738

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.14	0.02	0.01	0.15	0.33	0.11	0.16
C2	0.02	0.00	0.09	0.09	0.01	0.03	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.10	0.02	0.07	0.20	0.45	0.17	0.21
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.05	0.01	0.09	0.11	0.11	0.02	0.07	0.16	0.01	0.02	0.05	0.01	0.35	0.36	0.27	0.31
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.14	0.00	0.14	0.02	0.12	0.09	0.12	0.07	0.02	0.01	0.15	0.01	0.21	0.24	0.13	0.13
C4	0.01	0.01	0.05	0.14	0.00	0.05	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.10	0.00	0.03	0.24	0.52	0.26	0.26
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.09	0.03	0.03	0.07	0.14	0.03	0.06	0.01	0.01	0.20	0.12	0.05
C5	0.01	0.01	0.09	0.14	0.01	0.09	0.00	0.16	0.00	0.01	0.01	0.02	0.21	0.12	0.01	0.06	0.25	0.48	0.27	0.26
C5'	0.05	0.09	0.11	0.02	0.13	0.00	0.16	0.00	0.14	0.09	0.11	0.10	0.06	0.12	0.14	0.01	0.01	0.22	0.16	0.02
C6	0.01	0.01	0.11	0.12	0.01	0.09	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.02	0.21	0.09	0.01	0.08	0.23	0.42	0.21	0.22
N1	0.00	0.01	0.02	0.09	0.01	0.03	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.08	0.01	0.01	0.20	0.40	0.15	0.19
N3	0.02	0.00	0.07	0.12	0.01	0.03	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.08	0.02	0.06	0.22	0.50	0.22	0.24
O2	0.03	0.01	0.16	0.07	0.01	0.07	0.02	0.10	0.02	0.01	0.01	0.00	0.20	0.15	0.02	0.13	0.18	0.44	0.14	0.20
O2'	0.02	0.09	0.01	0.02	0.14	0.14	0.21	0.06	0.21	0.09	0.09	0.20	0.00	0.05	0.15	0.09	0.32	0.31	0.30	0.30
O3'	0.14	0.10	0.02	0.01	0.10	0.03	0.12	0.12	0.09	0.08	0.08	0.15	0.05	0.00	0.11	0.10	0.18	0.30	0.17	0.18
O4	0.02	0.02	0.05	0.15	0.00	0.06	0.01	0.14	0.01	0.01	0.02	0.02	0.15	0.11	0.00	0.04	0.24	0.56	0.28	0.29
O4'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.06	0.13	0.09	0.10	0.04	0.00	0.11	0.28	0.13	0.11
O5'	0.15	0.20	0.35	0.21	0.24	0.01	0.25	0.01	0.23	0.20	0.22	0.18	0.32	0.18	0.24	0.11	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.33	0.45	0.36	0.24	0.52	0.20	0.48	0.22	0.42	0.40	0.50	0.44	0.31	0.30	0.56	0.28	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	0.17	0.27	0.13	0.26	0.12	0.27	0.16	0.21	0.15	0.22	0.14	0.30	0.17	0.28	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.16	0.21	0.31	0.13	0.26	0.05	0.26	0.02	0.22	0.19	0.24	0.20	0.30	0.18	0.29	0.11	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.10	0.10	0.09	0.10	0.12	0.11	0.15	0.11	0.12	0.11	0.11	0.09	0.12	0.11	0.14	0.11	0.12	0.16	0.11	0.34	0.26	0.28
C2	0.09	0.11	0.11	0.09	0.11	0.10	0.11	0.12	0.11	0.12	0.11	0.12	0.10	0.12	0.11	0.14	0.10	0.12	0.13	0.12	0.25	0.20	0.22
C2'	0.18	0.15	0.17	0.17	0.17	0.20	0.18	0.25	0.17	0.20	0.16	0.15	0.15	0.20	0.18	0.18	0.17	0.19	0.27	0.18	0.49	0.39	0.42
C3'	0.09	0.16	0.09	0.10	0.12	0.16	0.13	0.23	0.15	0.12	0.17	0.20	0.13	0.12	0.11	0.12	0.12	0.14	0.22	0.15	0.46	0.35	0.37
C4	0.10	0.11	0.11	0.10	0.11	0.10	0.11	0.10	0.12	0.11	0.12	0.12	0.10	0.11	0.10	0.12	0.12	0.12	0.11	0.12	0.20	0.16	0.17
C4'	0.17	0.10	0.16	0.20	0.12	0.25	0.13	0.29	0.11	0.17	0.11	0.12	0.10	0.15	0.16	0.17	0.22	0.23	0.28	0.11	0.45	0.36	0.38
C5	0.10	0.11	0.11	0.10	0.10	0.10	0.11	0.11	0.11	0.11	0.12	0.12	0.10	0.11	0.10	0.12	0.13	0.12	0.11	0.12	0.23	0.17	0.19
C5'	0.22	0.16	0.23	0.26	0.17	0.29	0.17	0.32	0.15	0.21	0.15	0.17	0.16	0.19	0.20	0.25	0.29	0.27	0.30	0.15	0.45	0.37	0.39
C6	0.10	0.11	0.11	0.10	0.10	0.11	0.11	0.12	0.11	0.11	0.11	0.12	0.10	0.11	0.11	0.13	0.12	0.13	0.12	0.12	0.27	0.20	0.22
N1	0.10	0.10	0.11	0.09	0.11	0.11	0.11	0.13	0.11	0.12	0.11	0.11	0.10	0.12	0.11	0.14	0.10	0.13	0.13	0.12	0.28	0.22	0.24
N3	0.09	0.10	0.11	0.10	0.10	0.10	0.10	0.11	0.11	0.11	0.11	0.12	0.09	0.11	0.10	0.13	0.11	0.12	0.11	0.11	0.21	0.17	0.18
O2	0.11	0.12	0.13	0.11	0.12	0.12	0.12	0.14	0.12	0.13	0.12	0.12	0.11	0.13	0.12	0.17	0.11	0.13	0.15	0.13	0.27	0.21	0.23
O2'	0.28	0.13	0.30	0.36	0.18	0.40	0.20	0.46	0.17	0.28	0.15	0.15	0.14	0.25	0.25	0.31	0.38	0.35	0.48	0.18	0.71	0.57	0.61
O3'	0.22	0.14	0.20	0.28	0.17	0.36	0.18	0.43	0.16	0.23	0.15	0.17	0.14	0.21	0.20	0.20	0.30	0.31	0.39	0.17	0.60	0.49	0.51
O4	0.11	0.13	0.13	0.13	0.12	0.11	0.12	0.11	0.13	0.12	0.13	0.13	0.12	0.12	0.12	0.13	0.15	0.13	0.13	0.14	0.18	0.16	0.16
O4'	0.20	0.12	0.18	0.20	0.17	0.24	0.17	0.26	0.15	0.21	0.13	0.12	0.14	0.20	0.20	0.17	0.19	0.26	0.25	0.15	0.35	0.31	0.31
O5'	0.22	0.24	0.23	0.24	0.22	0.25	0.22	0.27	0.22	0.22	0.24	0.26	0.23	0.22	0.22	0.25	0.26	0.24	0.23	0.22	0.39	0.31	0.33
OP1	0.60	0.56	0.63	0.63	0.58	0.62	0.57	0.60	0.56	0.59	0.55	0.55	0.58	0.58	0.59	0.64	0.66	0.61	0.59	0.55	0.60	0.58	0.57
OP2	0.17	0.27	0.21	0.18	0.20	0.16	0.21	0.16	0.24	0.17	0.27	0.32	0.23	0.18	0.18	0.21	0.21	0.16	0.13	0.25	0.31	0.22	0.25
P	0.28	0.28	0.27	0.28	0.27	0.29	0.27	0.29	0.26	0.27	0.27	0.29	0.28	0.27	0.28	0.28	0.29	0.30	0.27	0.26	0.37	0.31	0.32

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.05	0.02	0.06	0.09	0.07
C2	0.03	0.00	0.08	0.08	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.10	0.03	0.13	0.02	0.10	0.19	0.11
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.05	0.04	0.06	0.10	0.07	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.05	0.07	0.10	0.04
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.06	0.07	0.07	0.10	0.07	0.07	0.04	0.01	0.01	0.01	0.08	0.07	0.10	0.11	0.07
C4	0.02	0.01	0.04	0.05	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.06	0.02	0.13	0.01	0.10	0.18	0.12
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.06	0.04	0.05	0.03	0.06	0.03	0.04	0.02	0.00	0.01	0.05	0.06	0.05	0.05
C5	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.07	0.02	0.18	0.01	0.17	0.25	0.18
C5'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.07	0.01	0.10	0.00	0.10	0.12	0.08	0.06	0.05	0.13	0.07	0.05	0.03	0.01	0.01	0.12	0.05	0.02	0.02
C6	0.02	0.01	0.05	0.06	0.01	0.04	0.01	0.10	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.08	0.02	0.18	0.01	0.19	0.28	0.19
C8	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.06	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.08	0.03	0.18	0.02	0.17	0.21	0.17
N1	0.03	0.01	0.06	0.07	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.09	0.03	0.16	0.01	0.14	0.24	0.15
N2	0.04	0.01	0.10	0.10	0.01	0.05	0.01	0.06	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.11	0.12	0.04	0.12	0.03	0.09	0.18	0.11
N3	0.03	0.00	0.07	0.07	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.09	0.03	0.11	0.01	0.08	0.16	0.09
N7	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.06	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.08	0.02	0.20	0.02	0.22	0.29	0.22
N9	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.12	0.01	0.09	0.15	0.10
O2'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.04	0.04	0.04	0.05	0.06	0.03	0.08	0.11	0.08	0.03	0.02	0.00	0.03	0.03	0.04	0.06	0.08	0.07	0.06
O3'	0.01	0.10	0.01	0.01	0.06	0.02	0.07	0.03	0.08	0.08	0.09	0.12	0.09	0.08	0.04	0.03	0.00	0.01	0.09	0.08	0.14	0.13	0.09
O4'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.04	0.03	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.06	0.02	0.10	0.13	0.12
O5'	0.05	0.13	0.06	0.08	0.13	0.01	0.18	0.01	0.18	0.18	0.16	0.12	0.11	0.20	0.12	0.04	0.09	0.06	0.00	0.20	0.01	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.05	0.07	0.01	0.05	0.01	0.12	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.06	0.08	0.02	0.20	0.00	0.23	0.33	0.23
OP1	0.06	0.10	0.07	0.10	0.10	0.06	0.17	0.05	0.19	0.17	0.14	0.09	0.08	0.22	0.09	0.08	0.14	0.10	0.01	0.23	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.19	0.10	0.11	0.18	0.05	0.25	0.02	0.28	0.21	0.24	0.18	0.16	0.29	0.15	0.07	0.13	0.13	0.02	0.33	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.11	0.04	0.07	0.12	0.05	0.18	0.02	0.19	0.17	0.15	0.11	0.09	0.22	0.10	0.06	0.09	0.12	0.01	0.23	0.01	0.01	0.00