Doublet Group distance statistics: 55566

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.007, 0.015, 0.024, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.015 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.010, 0.021, 0.032, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.021 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.012, 0.025, 0.037, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.025 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.014, 0.026, 0.039, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.026 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.017, 0.032, 0.047, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.032 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.014, 0.033, 0.051, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.033 std_dev=0.018
O4	A	0, 0.010, 0.033, 0.056, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.033 std_dev=0.023
N1	A	0, 0.020, 0.046, 0.072, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.046 std_dev=0.026
O2	A	0, 0.030, 0.086, 0.141, 0.184 max_d=0.184 avg_d=0.086 std_dev=0.055
O4'	A	0, 0.057, 0.236, 0.415, 0.545 max_d=0.545 avg_d=0.236 std_dev=0.179
C2'	A	0, 0.162, 0.342, 0.522, 0.591 max_d=0.591 avg_d=0.342 std_dev=0.180
O2'	A	0, 0.337, 0.660, 0.983, 1.059 max_d=1.059 avg_d=0.660 std_dev=0.323
C4'	A	0, 0.249, 0.586, 0.923, 1.166 max_d=1.166 avg_d=0.586 std_dev=0.337
C3'	A	0, 0.044, 0.430, 0.816, 0.992 max_d=0.992 avg_d=0.430 std_dev=0.386
N3	B	0, 0.439, 0.917, 1.396, 1.316 max_d=1.316 avg_d=0.917 std_dev=0.479
N2	B	0, 0.479, 0.969, 1.459, 1.532 max_d=1.532 avg_d=0.969 std_dev=0.490
C2	B	0, 0.498, 0.993, 1.488, 1.353 max_d=1.353 avg_d=0.993 std_dev=0.495
O2'	B	0, 0.544, 1.056, 1.567, 1.446 max_d=1.446 avg_d=1.056 std_dev=0.512
N1	B	0, 0.564, 1.118, 1.671, 1.603 max_d=1.603 avg_d=1.118 std_dev=0.554
C2'	B	0, 0.422, 0.976, 1.530, 1.485 max_d=1.485 avg_d=0.976 std_dev=0.554
C4	B	0, 0.420, 0.975, 1.529, 1.479 max_d=1.479 avg_d=0.975 std_dev=0.555
C1'	B	0, 0.380, 0.943, 1.506, 1.525 max_d=1.525 avg_d=0.943 std_dev=0.563
O5'	A	0, 0.537, 1.115, 1.693, 1.969 max_d=1.969 avg_d=1.115 std_dev=0.578
O3'	A	0, 0.390, 0.973, 1.557, 1.904 max_d=1.904 avg_d=0.973 std_dev=0.584
C5'	A	0, 0.580, 1.173, 1.767, 1.662 max_d=1.662 avg_d=1.173 std_dev=0.593
N9	B	0, 0.357, 0.963, 1.568, 1.570 max_d=1.570 avg_d=0.963 std_dev=0.606
C6	B	0, 0.559, 1.168, 1.778, 1.784 max_d=1.784 avg_d=1.168 std_dev=0.610
O4'	B	0, 0.359, 0.976, 1.593, 1.617 max_d=1.617 avg_d=0.976 std_dev=0.617
C5	B	0, 0.468, 1.086, 1.704, 1.681 max_d=1.681 avg_d=1.086 std_dev=0.618
C4'	B	0, 0.406, 1.030, 1.653, 1.635 max_d=1.635 avg_d=1.030 std_dev=0.623
C3'	B	0, 0.407, 1.032, 1.656, 1.583 max_d=1.583 avg_d=1.032 std_dev=0.625
O3'	B	0, 0.489, 1.117, 1.745, 1.599 max_d=1.599 avg_d=1.117 std_dev=0.628
O6	B	0, 0.626, 1.302, 1.977, 2.062 max_d=2.062 avg_d=1.302 std_dev=0.676
C8	B	0, 0.345, 1.045, 1.744, 1.730 max_d=1.730 avg_d=1.045 std_dev=0.700
N7	B	0, 0.411, 1.115, 1.819, 1.825 max_d=1.825 avg_d=1.115 std_dev=0.704
C5'	B	0, 0.393, 1.099, 1.805, 1.822 max_d=1.822 avg_d=1.099 std_dev=0.706
P	A	0, 0.233, 0.943, 1.653, 2.046 max_d=2.046 avg_d=0.943 std_dev=0.710
OP2	A	0, 0.310, 1.232, 2.153, 2.946 max_d=2.946 avg_d=1.232 std_dev=0.922
OP2	B	0, 0.825, 1.756, 2.688, 3.036 max_d=3.036 avg_d=1.756 std_dev=0.931
P	B	0, 0.725, 1.692, 2.658, 3.167 max_d=3.167 avg_d=1.692 std_dev=0.967
OP1	A	0, -0.109, 0.861, 1.832, 2.985 max_d=2.985 avg_d=0.861 std_dev=0.971
OP1	B	0, 0.866, 1.892, 2.918, 3.464 max_d=3.464 avg_d=1.892 std_dev=1.026
O5'	B	0, 0.501, 1.545, 2.590, 3.268 max_d=3.268 avg_d=1.545 std_dev=1.045

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.09	0.01	0.01	0.03	0.07	0.02	0.28	0.04	0.01	0.16	0.09	0.16	0.18
C2	0.03	0.00	0.12	0.19	0.01	0.07	0.01	0.19	0.01	0.01	0.00	0.01	0.11	0.24	0.02	0.07	0.23	0.16	0.17	0.22
C2'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.07	0.01	0.10	0.19	0.13	0.02	0.10	0.22	0.00	0.04	0.08	0.02	0.43	0.57	0.48	0.60
C3'	0.02	0.19	0.00	0.00	0.27	0.00	0.25	0.01	0.20	0.16	0.25	0.17	0.01	0.01	0.30	0.01	0.14	0.24	0.29	0.32
C4	0.03	0.01	0.07	0.27	0.00	0.12	0.01	0.28	0.02	0.02	0.01	0.02	0.27	0.22	0.01	0.02	0.31	0.29	0.32	0.38
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.12	0.00	0.13	0.00	0.12	0.07	0.09	0.08	0.25	0.02	0.14	0.01	0.01	0.10	0.13	0.09
C5	0.01	0.01	0.10	0.25	0.01	0.13	0.00	0.28	0.00	0.01	0.01	0.02	0.29	0.19	0.03	0.04	0.30	0.32	0.30	0.38
C5'	0.09	0.19	0.19	0.01	0.28	0.00	0.28	0.00	0.25	0.18	0.24	0.16	0.07	0.19	0.30	0.01	0.00	0.17	0.16	0.01
C6	0.01	0.01	0.13	0.20	0.02	0.12	0.00	0.25	0.00	0.00	0.02	0.02	0.25	0.13	0.03	0.06	0.26	0.24	0.20	0.27
N1	0.01	0.01	0.02	0.16	0.02	0.07	0.01	0.18	0.00	0.00	0.02	0.02	0.15	0.16	0.03	0.01	0.21	0.15	0.14	0.19
N3	0.03	0.00	0.10	0.25	0.01	0.09	0.01	0.24	0.02	0.02	0.00	0.03	0.19	0.23	0.02	0.06	0.28	0.22	0.24	0.30
O2	0.07	0.01	0.22	0.17	0.02	0.08	0.02	0.16	0.02	0.02	0.03	0.00	0.03	0.34	0.02	0.11	0.23	0.14	0.17	0.22
O2'	0.02	0.11	0.00	0.01	0.27	0.25	0.29	0.07	0.25	0.15	0.19	0.03	0.00	0.05	0.29	0.17	0.35	0.65	0.39	0.60
O3'	0.28	0.24	0.04	0.01	0.22	0.02	0.19	0.19	0.13	0.16	0.23	0.34	0.05	0.00	0.25	0.21	0.18	0.13	0.17	0.14
O4	0.04	0.02	0.08	0.30	0.01	0.14	0.03	0.30	0.03	0.03	0.02	0.02	0.29	0.25	0.00	0.03	0.34	0.34	0.38	0.44
O4'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.06	0.11	0.17	0.21	0.03	0.00	0.07	0.33	0.19	0.12
O5'	0.16	0.23	0.43	0.14	0.31	0.01	0.30	0.00	0.26	0.21	0.28	0.23	0.35	0.18	0.34	0.07	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.09	0.16	0.57	0.24	0.29	0.10	0.32	0.17	0.24	0.15	0.22	0.14	0.65	0.13	0.34	0.33	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.16	0.17	0.48	0.29	0.32	0.13	0.30	0.16	0.20	0.14	0.24	0.17	0.39	0.17	0.38	0.19	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.18	0.22	0.60	0.32	0.38	0.09	0.38	0.01	0.27	0.19	0.30	0.22	0.60	0.14	0.44	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.33	0.15	0.27	0.26	0.17	0.37	0.16	0.36	0.14	0.26	0.15	0.21	0.14	0.21	0.25	0.36	0.26	0.39	0.38	0.14	0.42	0.30	0.36
C2	0.26	0.13	0.16	0.14	0.14	0.25	0.12	0.23	0.11	0.19	0.12	0.18	0.12	0.15	0.19	0.24	0.12	0.30	0.30	0.10	0.34	0.18	0.28
C2'	0.43	0.10	0.33	0.32	0.22	0.49	0.19	0.49	0.10	0.34	0.10	0.16	0.15	0.26	0.33	0.42	0.30	0.52	0.44	0.08	0.53	0.30	0.44
C3'	0.29	0.21	0.19	0.20	0.19	0.29	0.17	0.29	0.17	0.22	0.20	0.25	0.20	0.18	0.23	0.28	0.27	0.33	0.26	0.16	0.29	0.23	0.24
C4	0.19	0.10	0.15	0.13	0.08	0.19	0.08	0.17	0.08	0.14	0.11	0.19	0.06	0.10	0.14	0.20	0.14	0.21	0.40	0.10	0.39	0.17	0.34
C4'	0.28	0.18	0.27	0.34	0.14	0.38	0.15	0.39	0.17	0.21	0.20	0.24	0.13	0.18	0.20	0.35	0.41	0.35	0.42	0.20	0.43	0.43	0.39
C5	0.23	0.12	0.19	0.16	0.08	0.24	0.06	0.20	0.08	0.15	0.13	0.22	0.06	0.10	0.16	0.27	0.16	0.25	0.44	0.11	0.44	0.22	0.38
C5'	0.21	0.32	0.21	0.30	0.17	0.33	0.20	0.35	0.29	0.15	0.35	0.40	0.21	0.17	0.14	0.30	0.37	0.28	0.40	0.33	0.44	0.41	0.37
C6	0.27	0.13	0.22	0.18	0.11	0.28	0.08	0.25	0.09	0.18	0.14	0.22	0.09	0.12	0.18	0.32	0.17	0.30	0.42	0.10	0.44	0.25	0.38
N1	0.28	0.13	0.21	0.18	0.13	0.29	0.11	0.27	0.10	0.20	0.13	0.21	0.11	0.14	0.20	0.30	0.15	0.32	0.35	0.10	0.39	0.22	0.32
N3	0.20	0.11	0.11	0.09	0.10	0.18	0.09	0.16	0.08	0.14	0.10	0.17	0.09	0.11	0.15	0.17	0.11	0.23	0.31	0.08	0.34	0.13	0.28
O2	0.30	0.15	0.19	0.19	0.19	0.28	0.18	0.27	0.16	0.24	0.14	0.17	0.16	0.21	0.24	0.24	0.20	0.35	0.27	0.15	0.30	0.23	0.25
O2'	0.45	0.19	0.39	0.47	0.20	0.63	0.20	0.67	0.15	0.38	0.18	0.31	0.15	0.30	0.34	0.45	0.48	0.59	0.56	0.16	0.68	0.45	0.56
O3'	0.22	0.33	0.36	0.52	0.25	0.42	0.27	0.49	0.31	0.24	0.35	0.38	0.27	0.26	0.23	0.33	0.69	0.28	0.56	0.33	0.50	0.63	0.50
O4	0.17	0.11	0.17	0.19	0.12	0.18	0.13	0.17	0.12	0.16	0.13	0.18	0.09	0.15	0.16	0.18	0.21	0.17	0.43	0.15	0.40	0.18	0.36
O4'	0.28	0.27	0.27	0.30	0.22	0.32	0.23	0.32	0.26	0.23	0.28	0.31	0.23	0.23	0.23	0.33	0.33	0.32	0.38	0.28	0.38	0.41	0.35
O5'	0.20	0.30	0.14	0.12	0.18	0.22	0.18	0.20	0.24	0.15	0.31	0.38	0.22	0.14	0.16	0.23	0.18	0.22	0.30	0.27	0.35	0.18	0.27
OP1	0.62	0.36	0.63	0.63	0.52	0.66	0.54	0.65	0.46	0.64	0.37	0.24	0.44	0.61	0.60	0.61	0.64	0.64	0.84	0.45	0.88	0.71	0.81
OP2	0.38	0.24	0.39	0.45	0.22	0.50	0.20	0.52	0.17	0.32	0.23	0.34	0.21	0.25	0.30	0.45	0.55	0.43	0.63	0.17	0.71	0.54	0.61
P	0.36	0.34	0.32	0.29	0.33	0.35	0.33	0.33	0.33	0.36	0.35	0.37	0.32	0.35	0.35	0.35	0.29	0.36	0.46	0.34	0.51	0.33	0.44

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.24	0.02	0.23	0.12	0.16
C2	0.02	0.00	0.08	0.09	0.02	0.03	0.02	0.06	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.09	0.11	0.03	0.47	0.01	0.38	0.23	0.39
C2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.04	0.02	0.02	0.01	0.04	0.05	0.06	0.11	0.08	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.26	0.03	0.25	0.11	0.18
C3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.05	0.09	0.07	0.12	0.08	0.07	0.03	0.02	0.01	0.01	0.31	0.06	0.29	0.12	0.21
C4	0.01	0.02	0.04	0.04	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.04	0.01	0.49	0.01	0.38	0.20	0.39
C4'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.05	0.03	0.04	0.03	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.05	0.14	0.29	0.02
C5	0.01	0.02	0.02	0.04	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.05	0.03	0.62	0.01	0.48	0.34	0.51
C5'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.05	0.01	0.07	0.00	0.07	0.08	0.06	0.06	0.05	0.08	0.04	0.06	0.01	0.02	0.01	0.09	0.17	0.35	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.05	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.05	0.03	0.63	0.00	0.51	0.41	0.55
C8	0.02	0.02	0.05	0.09	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.00	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.10	0.04	0.62	0.02	0.46	0.23	0.48
N1	0.02	0.01	0.06	0.07	0.03	0.03	0.03	0.06	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.03	0.03	0.07	0.08	0.04	0.56	0.01	0.45	0.34	0.48
N2	0.02	0.01	0.11	0.12	0.02	0.04	0.02	0.06	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.12	0.16	0.03	0.42	0.02	0.35	0.21	0.35
N3	0.02	0.01	0.08	0.08	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.10	0.02	0.41	0.01	0.33	0.15	0.33
N7	0.01	0.02	0.03	0.07	0.01	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.09	0.03	0.68	0.02	0.52	0.40	0.57
N9	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.46	0.02	0.35	0.11	0.34
O2'	0.02	0.09	0.01	0.02	0.04	0.06	0.02	0.06	0.04	0.04	0.07	0.12	0.08	0.03	0.02	0.00	0.03	0.04	0.09	0.04	0.18	0.15	0.08
O3'	0.02	0.11	0.02	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.05	0.10	0.08	0.16	0.10	0.09	0.03	0.03	0.00	0.02	0.20	0.06	0.26	0.14	0.17
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.03	0.04	0.04	0.03	0.02	0.03	0.01	0.04	0.02	0.00	0.12	0.03	0.19	0.27	0.10
O5'	0.24	0.47	0.26	0.31	0.49	0.02	0.62	0.01	0.63	0.62	0.56	0.42	0.41	0.68	0.46	0.09	0.20	0.12	0.00	0.69	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.03	0.06	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.06	0.03	0.69	0.00	0.57	0.51	0.62
OP1	0.23	0.38	0.25	0.29	0.38	0.14	0.48	0.17	0.51	0.46	0.45	0.35	0.33	0.52	0.35	0.18	0.26	0.19	0.01	0.57	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.23	0.11	0.12	0.20	0.29	0.34	0.35	0.41	0.23	0.34	0.21	0.15	0.40	0.11	0.15	0.14	0.27	0.01	0.51	0.01	0.00	0.01
P	0.16	0.39	0.18	0.21	0.39	0.02	0.51	0.01	0.55	0.48	0.48	0.35	0.33	0.57	0.34	0.08	0.17	0.10	0.00	0.62	0.01	0.01	0.00