Doublet Group distance statistics: 55569

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 14, 25, 15, 15, 15, 7, 2, 0, 1, 3, 2, 5, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.005, 0.011, 0.017, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.011 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.000, 0.010, 0.019, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.010 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.006, 0.017, 0.029, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.017 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.005, 0.016, 0.028, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.016 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.002, 0.014, 0.026, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.014 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.005, 0.017, 0.030, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.017 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.006, 0.019, 0.032, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.019 std_dev=0.013
O2	A	0, 0.011, 0.041, 0.072, 0.140 max_d=0.140 avg_d=0.041 std_dev=0.031
O4	A	0, -0.003, 0.070, 0.144, 0.366 max_d=0.366 avg_d=0.070 std_dev=0.073
O4'	A	0, 0.016, 0.172, 0.329, 0.654 max_d=0.654 avg_d=0.172 std_dev=0.156
N3	B	0, 0.131, 0.320, 0.508, 0.936 max_d=0.936 avg_d=0.320 std_dev=0.189
C4'	A	0, 0.045, 0.273, 0.500, 0.933 max_d=0.933 avg_d=0.273 std_dev=0.227
C2'	A	0, 0.013, 0.243, 0.472, 0.871 max_d=0.871 avg_d=0.243 std_dev=0.229
C4	B	0, 0.156, 0.414, 0.671, 1.190 max_d=1.190 avg_d=0.414 std_dev=0.258
C2	B	0, 0.100, 0.358, 0.617, 1.275 max_d=1.275 avg_d=0.358 std_dev=0.259
C1'	B	0, 0.199, 0.477, 0.754, 1.365 max_d=1.365 avg_d=0.477 std_dev=0.277
N9	B	0, 0.202, 0.481, 0.760, 1.319 max_d=1.319 avg_d=0.481 std_dev=0.279
C3'	A	0, 0.038, 0.396, 0.754, 1.253 max_d=1.253 avg_d=0.396 std_dev=0.358
O2'	A	0, 0.029, 0.388, 0.746, 1.204 max_d=1.204 avg_d=0.388 std_dev=0.359
C5	B	0, 0.163, 0.530, 0.897, 1.540 max_d=1.540 avg_d=0.530 std_dev=0.367
C8	B	0, 0.236, 0.610, 0.984, 1.712 max_d=1.712 avg_d=0.610 std_dev=0.374
N1	B	0, 0.077, 0.465, 0.852, 1.776 max_d=1.776 avg_d=0.465 std_dev=0.387
C2'	B	0, 0.106, 0.496, 0.887, 3.608 max_d=3.608 avg_d=0.496 std_dev=0.390
O2'	B	0, 0.145, 0.545, 0.945, 3.885 max_d=3.885 avg_d=0.545 std_dev=0.400
O4'	B	0, 0.189, 0.607, 1.025, 2.554 max_d=2.554 avg_d=0.607 std_dev=0.418
N7	B	0, 0.216, 0.641, 1.066, 1.862 max_d=1.862 avg_d=0.641 std_dev=0.425
C6	B	0, 0.120, 0.554, 0.988, 1.830 max_d=1.830 avg_d=0.554 std_dev=0.434
C5'	A	0, 0.064, 0.501, 0.938, 1.769 max_d=1.769 avg_d=0.501 std_dev=0.437
C3'	B	0, 0.110, 0.606, 1.102, 4.612 max_d=4.612 avg_d=0.606 std_dev=0.496
C4'	B	0, 0.153, 0.677, 1.201, 4.287 max_d=4.287 avg_d=0.677 std_dev=0.524
N6	B	0, 0.127, 0.701, 1.276, 2.386 max_d=2.386 avg_d=0.701 std_dev=0.575
O3'	A	0, 0.065, 0.661, 1.257, 1.862 max_d=1.862 avg_d=0.661 std_dev=0.596
O5'	A	0, 0.145, 0.776, 1.408, 2.582 max_d=2.582 avg_d=0.776 std_dev=0.632
O3'	B	0, 1.376, 2.015, 2.654, 5.725 max_d=5.725 avg_d=2.015 std_dev=0.639
P	A	0, 0.059, 0.703, 1.347, 2.686 max_d=2.686 avg_d=0.703 std_dev=0.644
C5'	B	0, 0.174, 0.872, 1.570, 6.005 max_d=6.005 avg_d=0.872 std_dev=0.698
O5'	B	0, 0.072, 0.907, 1.742, 7.823 max_d=7.823 avg_d=0.907 std_dev=0.835
OP2	A	0, 0.173, 1.056, 1.939, 2.935 max_d=2.935 avg_d=1.056 std_dev=0.883
P	B	0, -0.012, 1.036, 2.084, 9.719 max_d=9.719 avg_d=1.036 std_dev=1.048
OP1	B	0, -0.061, 1.055, 2.171, 10.521 max_d=10.521 avg_d=1.055 std_dev=1.116
OP2	B	0, -0.057, 1.063, 2.182, 10.243 max_d=10.243 avg_d=1.063 std_dev=1.120
OP1	A	0, 0.165, 1.594, 3.023, 4.174 max_d=4.174 avg_d=1.594 std_dev=1.429

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.01	0.08	0.36	0.70	0.17
C2	0.02	0.00	0.08	0.07	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.12	0.08	0.01	0.03	0.16	0.53	0.85	0.17
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.06	0.01	0.12	0.01	0.12	0.03	0.05	0.18	0.00	0.02	0.07	0.01	0.08	0.15	0.47	0.12
C3'	0.02	0.07	0.00	0.00	0.18	0.00	0.25	0.02	0.24	0.10	0.10	0.14	0.02	0.01	0.19	0.01	0.10	0.11	0.24	0.10
C4	0.02	0.01	0.06	0.18	0.00	0.10	0.01	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.21	0.00	0.04	0.31	0.70	0.94	0.22
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.10	0.00	0.13	0.01	0.13	0.05	0.05	0.06	0.06	0.03	0.10	0.01	0.01	0.20	0.27	0.07
C5	0.02	0.01	0.12	0.25	0.01	0.13	0.00	0.21	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.30	0.01	0.05	0.36	0.72	0.94	0.23
C5'	0.02	0.06	0.01	0.02	0.17	0.01	0.21	0.00	0.18	0.09	0.11	0.04	0.05	0.04	0.18	0.01	0.01	0.22	0.24	0.02
C6	0.02	0.01	0.12	0.24	0.01	0.13	0.01	0.18	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.26	0.01	0.05	0.31	0.62	0.90	0.19
N1	0.00	0.01	0.03	0.10	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.10	0.02	0.01	0.18	0.50	0.83	0.17
N3	0.02	0.00	0.05	0.10	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.10	0.11	0.01	0.03	0.23	0.62	0.91	0.18
O2	0.03	0.00	0.18	0.14	0.01	0.06	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.22	0.20	0.02	0.05	0.11	0.47	0.81	0.17
O2'	0.02	0.12	0.00	0.02	0.05	0.06	0.06	0.05	0.07	0.03	0.10	0.22	0.00	0.08	0.06	0.06	0.04	0.17	0.38	0.08
O3'	0.02	0.08	0.02	0.01	0.21	0.03	0.30	0.04	0.26	0.10	0.11	0.20	0.08	0.00	0.24	0.03	0.12	0.24	0.18	0.13
O4	0.02	0.01	0.07	0.19	0.00	0.10	0.01	0.18	0.01	0.02	0.01	0.02	0.06	0.24	0.00	0.04	0.33	0.74	0.95	0.24
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.03	0.05	0.06	0.03	0.04	0.00	0.07	0.38	0.66	0.19
O5'	0.08	0.16	0.08	0.10	0.31	0.01	0.36	0.01	0.31	0.18	0.23	0.11	0.04	0.12	0.33	0.07	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.36	0.53	0.15	0.11	0.70	0.20	0.72	0.22	0.62	0.50	0.62	0.47	0.17	0.24	0.74	0.38	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.70	0.85	0.47	0.24	0.94	0.27	0.94	0.24	0.90	0.83	0.91	0.81	0.38	0.18	0.95	0.66	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.17	0.17	0.12	0.10	0.22	0.07	0.23	0.02	0.19	0.17	0.18	0.17	0.08	0.13	0.24	0.19	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.13	0.20	0.26	0.16	0.32	0.18	0.37	0.15	0.22	0.14	0.14	0.16	0.21	0.20	0.32	0.37	0.32	0.45	0.42	0.54	0.50
C2	0.16	0.13	0.16	0.16	0.14	0.24	0.15	0.28	0.14	0.17	0.13	0.13	0.14	0.16	0.15	0.28	0.24	0.27	0.34	0.33	0.45	0.38
C2'	0.26	0.14	0.32	0.40	0.18	0.43	0.20	0.47	0.17	0.26	0.15	0.15	0.18	0.24	0.23	0.42	0.52	0.35	0.57	0.52	0.68	0.62
C3'	0.22	0.14	0.25	0.36	0.13	0.42	0.14	0.49	0.12	0.22	0.13	0.11	0.13	0.19	0.18	0.36	0.47	0.35	0.60	0.58	0.73	0.68
C4	0.14	0.13	0.20	0.13	0.09	0.19	0.10	0.25	0.12	0.11	0.14	0.09	0.13	0.10	0.11	0.30	0.17	0.23	0.30	0.33	0.46	0.37
C4'	0.23	0.13	0.23	0.32	0.15	0.39	0.16	0.45	0.14	0.23	0.13	0.12	0.14	0.21	0.20	0.33	0.43	0.36	0.54	0.52	0.65	0.61
C5	0.15	0.12	0.20	0.15	0.09	0.23	0.09	0.29	0.11	0.11	0.14	0.08	0.13	0.10	0.11	0.32	0.22	0.25	0.36	0.38	0.52	0.43
C5'	0.23	0.17	0.21	0.30	0.15	0.39	0.15	0.45	0.14	0.22	0.16	0.14	0.15	0.19	0.20	0.32	0.39	0.36	0.54	0.54	0.66	0.62
C6	0.17	0.10	0.20	0.19	0.10	0.27	0.10	0.33	0.10	0.14	0.11	0.08	0.10	0.12	0.13	0.33	0.27	0.28	0.40	0.40	0.54	0.47
N1	0.18	0.12	0.19	0.20	0.13	0.28	0.14	0.33	0.12	0.18	0.12	0.11	0.13	0.16	0.16	0.31	0.29	0.30	0.40	0.39	0.52	0.45
N3	0.13	0.11	0.18	0.12	0.09	0.19	0.09	0.24	0.09	0.11	0.11	0.08	0.10	0.10	0.11	0.28	0.17	0.23	0.28	0.30	0.42	0.34
O2	0.18	0.18	0.16	0.18	0.20	0.25	0.21	0.28	0.20	0.22	0.18	0.18	0.21	0.22	0.20	0.27	0.27	0.28	0.32	0.31	0.42	0.36
O2'	0.39	0.21	0.48	0.56	0.29	0.54	0.31	0.55	0.28	0.38	0.23	0.23	0.30	0.36	0.35	0.57	0.68	0.45	0.62	0.56	0.72	0.68
O3'	0.31	0.14	0.37	0.50	0.15	0.55	0.16	0.62	0.13	0.28	0.14	0.12	0.14	0.24	0.24	0.46	0.62	0.43	0.71	0.72	0.86	0.81
O4	0.15	0.19	0.22	0.15	0.15	0.18	0.16	0.23	0.19	0.15	0.21	0.15	0.21	0.15	0.14	0.29	0.17	0.21	0.27	0.32	0.44	0.34
O4'	0.25	0.13	0.21	0.27	0.18	0.36	0.18	0.41	0.15	0.25	0.13	0.14	0.15	0.22	0.23	0.31	0.35	0.37	0.48	0.47	0.56	0.53
O5'	0.20	0.29	0.17	0.24	0.20	0.35	0.21	0.42	0.25	0.19	0.29	0.23	0.26	0.20	0.19	0.30	0.32	0.33	0.52	0.53	0.66	0.60
OP1	0.48	0.73	0.60	0.52	0.61	0.43	0.62	0.43	0.69	0.52	0.74	0.66	0.70	0.57	0.53	0.67	0.58	0.39	0.52	0.57	0.61	0.55
OP2	0.92	0.88	0.97	0.97	0.90	0.93	0.90	0.94	0.88	0.91	0.87	0.90	0.87	0.91	0.91	1.00	1.00	0.91	1.03	0.97	1.20	1.11
P	0.19	0.27	0.21	0.22	0.17	0.32	0.19	0.39	0.24	0.17	0.29	0.19	0.27	0.17	0.16	0.36	0.30	0.30	0.49	0.50	0.65	0.59

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.01	0.00	0.02	0.07	0.01	0.08	0.06	0.12	0.09
C2	0.03	0.00	0.12	0.09	0.01	0.08	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.12	0.12	0.11	0.18	0.28	0.18
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.06	0.01	0.04	0.04	0.06	0.07	0.09	0.11	0.06	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.07	0.11	0.09	0.06
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.07	0.00	0.09	0.02	0.10	0.11	0.09	0.08	0.11	0.11	0.06	0.02	0.01	0.01	0.10	0.15	0.15	0.11
C4	0.01	0.01	0.06	0.07	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.05	0.09	0.07	0.11	0.11	0.19	0.13
C4'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.10	0.05	0.08	0.06	0.08	0.03	0.08	0.02	0.01	0.02	0.09	0.05	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.09	0.01	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.07	0.12	0.04	0.18	0.15	0.24	0.19
C5'	0.03	0.13	0.04	0.02	0.07	0.01	0.08	0.00	0.09	0.14	0.10	0.12	0.11	0.13	0.06	0.05	0.06	0.02	0.01	0.09	0.04	0.01
C6	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.07	0.13	0.06	0.15	0.16	0.24	0.18
C8	0.01	0.01	0.07	0.11	0.01	0.10	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.00	0.15	0.13	0.07	0.30	0.21	0.32	0.29
N1	0.03	0.01	0.09	0.09	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.09	0.12	0.10	0.10	0.16	0.25	0.17
N3	0.03	0.01	0.11	0.08	0.00	0.08	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.11	0.12	0.10	0.16	0.25	0.16
N6	0.03	0.01	0.06	0.11	0.02	0.06	0.02	0.11	0.00	0.04	0.02	0.01	0.00	0.04	0.03	0.08	0.15	0.06	0.20	0.20	0.29	0.23
N7	0.01	0.01	0.05	0.11	0.01	0.08	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.14	0.14	0.05	0.29	0.23	0.35	0.30
N9	0.00	0.01	0.02	0.06	0.01	0.03	0.01	0.06	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.07	0.01	0.15	0.10	0.17	0.15
O2'	0.02	0.13	0.00	0.02	0.05	0.08	0.07	0.05	0.07	0.15	0.09	0.12	0.08	0.14	0.05	0.00	0.09	0.06	0.09	0.13	0.08	0.07
O3'	0.07	0.12	0.02	0.01	0.09	0.02	0.12	0.06	0.13	0.13	0.12	0.11	0.15	0.14	0.07	0.09	0.00	0.05	0.14	0.27	0.28	0.20
O4'	0.01	0.12	0.01	0.01	0.07	0.01	0.04	0.02	0.06	0.07	0.10	0.12	0.06	0.05	0.01	0.06	0.05	0.00	0.07	0.07	0.16	0.10
O5'	0.08	0.11	0.07	0.10	0.11	0.02	0.18	0.01	0.15	0.30	0.10	0.10	0.20	0.29	0.15	0.09	0.14	0.07	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.06	0.18	0.11	0.15	0.11	0.09	0.15	0.09	0.16	0.21	0.16	0.16	0.20	0.23	0.10	0.13	0.27	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.28	0.09	0.15	0.19	0.05	0.24	0.04	0.24	0.32	0.25	0.25	0.29	0.35	0.17	0.08	0.28	0.16	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.18	0.06	0.11	0.13	0.02	0.19	0.01	0.18	0.29	0.17	0.16	0.23	0.30	0.15	0.07	0.20	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00