Doublet Group distance statistics: 55571

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 2, 6, 3, 1, 1, 1, 1, 8, 7, 4, 3, 0, 0, 1, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.004, 0.011, 0.018, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C5	A	0, -0.001, 0.010, 0.022, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.010 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.016, 0.031, 0.046, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.031 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.017, 0.032, 0.048, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.032 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.017, 0.034, 0.051, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.034 std_dev=0.017
N1	A	0, 0.010, 0.027, 0.044, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.027 std_dev=0.017
C6	A	0, 0.015, 0.033, 0.050, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.033 std_dev=0.017
O2	A	0, 0.039, 0.074, 0.109, 0.143 max_d=0.143 avg_d=0.074 std_dev=0.035
O4	A	0, 0.047, 0.107, 0.168, 0.310 max_d=0.310 avg_d=0.107 std_dev=0.060
N3	B	0, 0.279, 0.482, 0.684, 1.194 max_d=1.194 avg_d=0.482 std_dev=0.203
C4	B	0, 0.348, 0.585, 0.822, 1.293 max_d=1.293 avg_d=0.585 std_dev=0.237
N9	B	0, 0.378, 0.625, 0.873, 0.980 max_d=0.980 avg_d=0.625 std_dev=0.248
O4'	A	0, 0.173, 0.452, 0.731, 0.922 max_d=0.922 avg_d=0.452 std_dev=0.279
C2'	B	0, 0.393, 0.689, 0.985, 1.083 max_d=1.083 avg_d=0.689 std_dev=0.296
C4'	A	0, 0.249, 0.563, 0.876, 1.151 max_d=1.151 avg_d=0.563 std_dev=0.314
C3'	B	0, 0.430, 0.751, 1.073, 1.185 max_d=1.185 avg_d=0.751 std_dev=0.322
C1'	B	0, 0.395, 0.724, 1.052, 1.105 max_d=1.105 avg_d=0.724 std_dev=0.329
C2'	A	0, 0.218, 0.577, 0.936, 1.087 max_d=1.087 avg_d=0.577 std_dev=0.359
C8	B	0, 0.491, 0.857, 1.223, 1.402 max_d=1.402 avg_d=0.857 std_dev=0.366
O5'	B	0, 0.625, 1.007, 1.389, 1.442 max_d=1.442 avg_d=1.007 std_dev=0.382
C2	B	0, 0.436, 0.822, 1.208, 1.720 max_d=1.720 avg_d=0.822 std_dev=0.386
C5	B	0, 0.481, 0.898, 1.315, 1.833 max_d=1.833 avg_d=0.898 std_dev=0.417
N7	B	0, 0.549, 0.998, 1.446, 1.830 max_d=1.830 avg_d=0.998 std_dev=0.448
O3'	B	0, 0.591, 1.072, 1.553, 1.885 max_d=1.885 avg_d=1.072 std_dev=0.481
C3'	A	0, 0.324, 0.809, 1.295, 1.541 max_d=1.541 avg_d=0.809 std_dev=0.485
C5'	B	0, 0.626, 1.127, 1.629, 1.727 max_d=1.727 avg_d=1.127 std_dev=0.501
C4'	B	0, 0.500, 1.013, 1.526, 1.629 max_d=1.629 avg_d=1.013 std_dev=0.513
O2'	A	0, 0.324, 0.845, 1.365, 1.491 max_d=1.491 avg_d=0.845 std_dev=0.520
P	B	0, 0.683, 1.209, 1.735, 1.844 max_d=1.844 avg_d=1.209 std_dev=0.526
O4'	B	0, 0.511, 1.040, 1.569, 1.651 max_d=1.651 avg_d=1.040 std_dev=0.529
O2'	B	0, 0.492, 1.028, 1.564, 1.736 max_d=1.736 avg_d=1.028 std_dev=0.536
OP2	B	0, 0.712, 1.262, 1.813, 1.961 max_d=1.961 avg_d=1.262 std_dev=0.550
N1	B	0, 0.554, 1.149, 1.744, 2.262 max_d=2.262 avg_d=1.149 std_dev=0.595
C6	B	0, 0.578, 1.176, 1.773, 2.324 max_d=2.324 avg_d=1.176 std_dev=0.598
OP1	B	0, 0.770, 1.426, 2.082, 2.268 max_d=2.268 avg_d=1.426 std_dev=0.656
C5'	A	0, 0.470, 1.128, 1.786, 2.246 max_d=2.246 avg_d=1.128 std_dev=0.658
O3'	A	0, 0.467, 1.166, 1.866, 2.129 max_d=2.129 avg_d=1.166 std_dev=0.700
OP2	A	0, 0.509, 1.211, 1.912, 4.007 max_d=4.007 avg_d=1.211 std_dev=0.701
N6	B	0, 0.727, 1.537, 2.348, 2.873 max_d=2.873 avg_d=1.537 std_dev=0.811
O5'	A	0, 0.548, 1.456, 2.364, 2.782 max_d=2.782 avg_d=1.456 std_dev=0.908
P	A	0, 0.651, 1.702, 2.753, 3.432 max_d=3.432 avg_d=1.702 std_dev=1.051
OP1	A	0, 0.853, 2.738, 4.622, 5.117 max_d=5.117 avg_d=2.738 std_dev=1.884

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.04	0.02	0.02	0.02	0.01	0.10	0.34	0.75	0.28
C2	0.02	0.00	0.13	0.09	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.11	0.02	0.05	0.19	0.70	0.71	0.35
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.07	0.01	0.17	0.01	0.19	0.04	0.06	0.29	0.00	0.02	0.08	0.01	0.12	0.17	0.46	0.18
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.16	0.01	0.28	0.02	0.29	0.08	0.05	0.24	0.02	0.01	0.17	0.01	0.15	0.13	0.29	0.13
C4	0.02	0.01	0.07	0.16	0.00	0.08	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.19	0.00	0.03	0.29	0.91	0.64	0.35
C4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.08	0.00	0.12	0.01	0.12	0.04	0.04	0.07	0.04	0.02	0.09	0.01	0.02	0.22	0.50	0.09
C5	0.02	0.01	0.17	0.28	0.00	0.12	0.00	0.17	0.00	0.01	0.01	0.02	0.09	0.34	0.01	0.07	0.33	0.84	0.65	0.34
C5'	0.02	0.06	0.01	0.02	0.14	0.01	0.17	0.00	0.15	0.08	0.09	0.06	0.04	0.04	0.15	0.02	0.01	0.40	0.35	0.01
C6	0.03	0.01	0.19	0.29	0.01	0.12	0.00	0.15	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.32	0.01	0.08	0.30	0.66	0.72	0.32
N1	0.01	0.01	0.04	0.08	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.08	0.01	0.01	0.19	0.58	0.74	0.32
N3	0.01	0.01	0.06	0.05	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.11	0.06	0.01	0.03	0.23	0.84	0.67	0.36
O2	0.04	0.01	0.29	0.24	0.02	0.07	0.02	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.30	0.32	0.02	0.08	0.19	0.65	0.72	0.35
O2'	0.02	0.15	0.00	0.02	0.05	0.04	0.09	0.04	0.11	0.03	0.11	0.30	0.00	0.04	0.05	0.03	0.06	0.11	0.48	0.12
O3'	0.02	0.11	0.02	0.01	0.19	0.02	0.34	0.04	0.32	0.08	0.06	0.32	0.04	0.00	0.21	0.02	0.14	0.43	0.22	0.20
O4	0.02	0.02	0.08	0.17	0.00	0.09	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.21	0.00	0.04	0.31	0.99	0.61	0.36
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.01	0.07	0.02	0.08	0.01	0.03	0.08	0.03	0.02	0.04	0.00	0.10	0.26	0.88	0.31
O5'	0.10	0.19	0.12	0.15	0.29	0.02	0.33	0.01	0.30	0.19	0.23	0.19	0.06	0.14	0.31	0.10	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.34	0.70	0.17	0.13	0.91	0.22	0.84	0.40	0.66	0.58	0.84	0.65	0.11	0.43	0.99	0.26	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.75	0.71	0.46	0.29	0.64	0.50	0.65	0.35	0.72	0.74	0.67	0.72	0.48	0.22	0.61	0.88	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.28	0.35	0.18	0.13	0.35	0.09	0.34	0.01	0.32	0.32	0.36	0.35	0.12	0.20	0.36	0.31	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.14	0.21	0.14	0.20	0.14	0.23	0.26	0.21	0.26	0.17	0.15	0.23	0.27	0.22	0.42	0.35	0.37	0.31	0.42	0.27	0.36
C2	0.15	0.14	0.21	0.14	0.18	0.11	0.19	0.20	0.18	0.21	0.15	0.15	0.19	0.21	0.19	0.39	0.27	0.28	0.24	0.30	0.19	0.26
C2'	0.28	0.13	0.55	0.53	0.11	0.40	0.09	0.30	0.12	0.15	0.14	0.11	0.14	0.11	0.16	0.78	0.74	0.20	0.21	0.15	0.19	0.13
C3'	0.16	0.14	0.36	0.34	0.09	0.25	0.09	0.20	0.11	0.11	0.14	0.11	0.12	0.10	0.10	0.52	0.52	0.13	0.15	0.13	0.16	0.09
C4	0.17	0.15	0.15	0.13	0.11	0.14	0.11	0.18	0.13	0.13	0.16	0.11	0.15	0.11	0.13	0.17	0.18	0.24	0.19	0.21	0.14	0.19
C4'	0.21	0.14	0.12	0.08	0.18	0.19	0.20	0.29	0.17	0.25	0.14	0.15	0.18	0.23	0.22	0.23	0.21	0.37	0.32	0.46	0.26	0.35
C5	0.21	0.14	0.14	0.13	0.11	0.18	0.10	0.23	0.12	0.15	0.16	0.10	0.14	0.11	0.16	0.17	0.19	0.31	0.23	0.27	0.15	0.23
C5'	0.35	0.15	0.22	0.25	0.24	0.39	0.22	0.46	0.17	0.33	0.14	0.19	0.16	0.28	0.31	0.18	0.16	0.50	0.45	0.60	0.36	0.47
C6	0.21	0.11	0.13	0.10	0.14	0.19	0.13	0.26	0.11	0.19	0.11	0.11	0.11	0.16	0.19	0.21	0.20	0.35	0.26	0.34	0.19	0.29
N1	0.19	0.12	0.17	0.10	0.17	0.15	0.18	0.24	0.15	0.22	0.13	0.14	0.16	0.21	0.20	0.32	0.26	0.35	0.27	0.35	0.22	0.30
N3	0.14	0.11	0.18	0.14	0.13	0.11	0.12	0.17	0.11	0.15	0.10	0.12	0.11	0.13	0.14	0.27	0.21	0.23	0.20	0.22	0.14	0.20
O2	0.14	0.20	0.30	0.20	0.24	0.13	0.27	0.20	0.27	0.25	0.24	0.19	0.29	0.28	0.22	0.55	0.35	0.27	0.26	0.33	0.22	0.29
O2'	0.44	0.13	0.79	0.79	0.15	0.63	0.12	0.48	0.14	0.22	0.16	0.15	0.19	0.15	0.26	1.08	1.07	0.34	0.34	0.24	0.27	0.23
O3'	0.34	0.15	0.54	0.57	0.14	0.51	0.13	0.45	0.11	0.25	0.15	0.12	0.13	0.19	0.23	0.72	0.77	0.31	0.35	0.27	0.36	0.30
O4	0.16	0.22	0.15	0.15	0.13	0.14	0.16	0.16	0.22	0.12	0.26	0.14	0.25	0.14	0.13	0.15	0.18	0.20	0.17	0.16	0.15	0.16
O4'	0.41	0.14	0.18	0.23	0.29	0.45	0.30	0.55	0.23	0.43	0.15	0.20	0.23	0.38	0.38	0.14	0.11	0.63	0.55	0.69	0.48	0.59
O5'	0.31	0.22	0.24	0.25	0.22	0.34	0.21	0.38	0.22	0.26	0.24	0.22	0.23	0.23	0.26	0.22	0.22	0.42	0.37	0.49	0.26	0.36
OP1	0.30	1.06	0.30	0.21	0.73	0.15	0.83	0.17	1.03	0.52	1.15	0.83	1.11	0.70	0.51	0.24	0.23	0.17	0.16	0.25	0.32	0.14
OP2	0.42	0.65	0.54	0.50	0.55	0.37	0.57	0.33	0.63	0.48	0.66	0.58	0.64	0.53	0.48	0.55	0.58	0.32	0.36	0.27	0.44	0.36
P	0.17	0.41	0.17	0.17	0.22	0.24	0.27	0.28	0.38	0.15	0.46	0.28	0.43	0.20	0.15	0.17	0.18	0.28	0.22	0.37	0.13	0.23

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.05	0.07	0.12	0.06
C2	0.03	0.00	0.15	0.12	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.20	0.16	0.06	0.11	0.11	0.11	0.13
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.07	0.01	0.03	0.01	0.06	0.10	0.11	0.15	0.04	0.07	0.02	0.00	0.02	0.01	0.05	0.09	0.11	0.05
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.07	0.01	0.10	0.02	0.09	0.17	0.10	0.11	0.11	0.16	0.08	0.02	0.01	0.01	0.09	0.11	0.15	0.08
C4	0.01	0.01	0.07	0.07	0.00	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.10	0.08	0.03	0.11	0.10	0.10	0.11
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.00	0.07	0.01	0.06	0.10	0.04	0.03	0.08	0.10	0.05	0.04	0.03	0.00	0.02	0.09	0.07	0.03
C5	0.01	0.01	0.03	0.10	0.01	0.07	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.12	0.02	0.16	0.14	0.12	0.16
C5'	0.02	0.08	0.01	0.02	0.09	0.01	0.13	0.00	0.13	0.14	0.11	0.07	0.16	0.16	0.08	0.04	0.05	0.02	0.01	0.10	0.06	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.09	0.01	0.06	0.01	0.13	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.10	0.12	0.03	0.16	0.15	0.14	0.19
C8	0.02	0.01	0.10	0.17	0.01	0.10	0.01	0.14	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.07	0.21	0.06	0.16	0.11	0.10	0.12
N1	0.02	0.00	0.11	0.10	0.01	0.04	0.01	0.11	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.16	0.12	0.04	0.14	0.13	0.13	0.17
N3	0.03	0.00	0.15	0.11	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.19	0.15	0.06	0.10	0.09	0.09	0.10
N6	0.02	0.01	0.04	0.11	0.01	0.08	0.02	0.16	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.04	0.02	0.08	0.15	0.04	0.19	0.18	0.18	0.23
N7	0.02	0.01	0.07	0.16	0.01	0.10	0.01	0.16	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.01	0.05	0.20	0.04	0.19	0.15	0.13	0.18
N9	0.00	0.01	0.02	0.08	0.00	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.08	0.01	0.10	0.08	0.09	0.07
O2'	0.02	0.20	0.00	0.02	0.10	0.04	0.06	0.04	0.10	0.07	0.16	0.19	0.08	0.05	0.03	0.00	0.04	0.04	0.04	0.10	0.11	0.05
O3'	0.01	0.16	0.02	0.01	0.08	0.03	0.12	0.05	0.12	0.21	0.12	0.15	0.15	0.20	0.08	0.04	0.00	0.02	0.13	0.16	0.24	0.13
O4'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.02	0.03	0.06	0.04	0.06	0.04	0.04	0.01	0.04	0.02	0.00	0.10	0.10	0.19	0.12
O5'	0.05	0.11	0.05	0.09	0.11	0.02	0.16	0.01	0.16	0.16	0.14	0.10	0.19	0.19	0.10	0.04	0.13	0.10	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.07	0.11	0.09	0.11	0.10	0.09	0.14	0.10	0.15	0.11	0.13	0.09	0.18	0.15	0.08	0.10	0.16	0.10	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.11	0.11	0.15	0.10	0.07	0.12	0.06	0.14	0.10	0.13	0.09	0.18	0.13	0.09	0.11	0.24	0.19	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.13	0.05	0.08	0.11	0.03	0.16	0.02	0.19	0.12	0.17	0.10	0.23	0.18	0.07	0.05	0.13	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00