Doublet Group distance statistics: 6648

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.021, 0.131, 0.241, 0.282 max_d=0.282 avg_d=0.131 std_dev=0.110
C4	B	0, -0.005, 0.116, 0.236, 0.334 max_d=0.334 avg_d=0.116 std_dev=0.121
N3	A	0, -0.033, 0.104, 0.241, 0.373 max_d=0.373 avg_d=0.104 std_dev=0.137
N9	B	0, 0.036, 0.179, 0.322, 0.345 max_d=0.345 avg_d=0.179 std_dev=0.143
C2	A	0, -0.020, 0.132, 0.285, 0.420 max_d=0.420 avg_d=0.132 std_dev=0.152
C6	A	0, 0.006, 0.172, 0.339, 0.453 max_d=0.453 avg_d=0.172 std_dev=0.166
C4	A	0, -0.038, 0.130, 0.298, 0.457 max_d=0.457 avg_d=0.130 std_dev=0.168
C3'	B	0, 0.007, 0.177, 0.346, 0.481 max_d=0.481 avg_d=0.177 std_dev=0.170
C1'	B	0, 0.050, 0.252, 0.454, 0.427 max_d=0.427 avg_d=0.252 std_dev=0.202
C5	A	0, -0.039, 0.184, 0.408, 0.613 max_d=0.613 avg_d=0.184 std_dev=0.224
N1	B	0, 0.003, 0.234, 0.465, 0.634 max_d=0.634 avg_d=0.234 std_dev=0.231
O6	A	0, -0.001, 0.244, 0.489, 0.676 max_d=0.676 avg_d=0.244 std_dev=0.245
C3'	A	0, 0.056, 0.301, 0.546, 0.606 max_d=0.606 avg_d=0.301 std_dev=0.245
O3'	A	0, 0.066, 0.321, 0.576, 0.566 max_d=0.566 avg_d=0.321 std_dev=0.255
C2'	A	0, 0.060, 0.318, 0.576, 0.585 max_d=0.585 avg_d=0.318 std_dev=0.258
N9	A	0, -0.080, 0.198, 0.476, 0.746 max_d=0.746 avg_d=0.198 std_dev=0.278
C1'	A	0, -0.018, 0.261, 0.541, 0.769 max_d=0.769 avg_d=0.261 std_dev=0.279
N2	A	0, -0.090, 0.216, 0.523, 0.820 max_d=0.820 avg_d=0.216 std_dev=0.306
C4'	A	0, -0.050, 0.283, 0.616, 0.918 max_d=0.918 avg_d=0.283 std_dev=0.333
C2	B	0, -0.050, 0.297, 0.643, 0.953 max_d=0.953 avg_d=0.297 std_dev=0.346
C4'	B	0, 0.083, 0.432, 0.781, 0.784 max_d=0.784 avg_d=0.432 std_dev=0.349
N3	B	0, -0.073, 0.281, 0.636, 0.967 max_d=0.967 avg_d=0.281 std_dev=0.354
O2'	A	0, 0.057, 0.434, 0.811, 0.903 max_d=0.903 avg_d=0.434 std_dev=0.377
N7	A	0, -0.109, 0.276, 0.660, 1.035 max_d=1.035 avg_d=0.276 std_dev=0.385
O4'	B	0, 0.099, 0.489, 0.880, 0.884 max_d=0.884 avg_d=0.489 std_dev=0.391
C5	B	0, -0.116, 0.277, 0.670, 1.049 max_d=1.049 avg_d=0.277 std_dev=0.393
O4'	A	0, -0.141, 0.261, 0.663, 1.059 max_d=1.059 avg_d=0.261 std_dev=0.402
C6	B	0, -0.081, 0.322, 0.725, 1.100 max_d=1.100 avg_d=0.322 std_dev=0.403
C8	A	0, -0.141, 0.268, 0.677, 1.082 max_d=1.082 avg_d=0.268 std_dev=0.409
C5'	A	0, -0.078, 0.361, 0.800, 1.204 max_d=1.204 avg_d=0.361 std_dev=0.439
O3'	B	0, 0.008, 0.469, 0.931, 1.280 max_d=1.280 avg_d=0.469 std_dev=0.462
C8	B	0, -0.072, 0.409, 0.889, 1.322 max_d=1.322 avg_d=0.409 std_dev=0.481
C2'	B	0, -0.143, 0.365, 0.873, 1.367 max_d=1.367 avg_d=0.365 std_dev=0.508
O5'	A	0, -0.090, 0.453, 0.997, 1.493 max_d=1.493 avg_d=0.453 std_dev=0.543
C5'	B	0, 0.114, 0.666, 1.218, 1.389 max_d=1.389 avg_d=0.666 std_dev=0.552
N7	B	0, -0.170, 0.492, 1.155, 1.787 max_d=1.787 avg_d=0.492 std_dev=0.663
N6	B	0, -0.110, 0.564, 1.238, 1.857 max_d=1.857 avg_d=0.564 std_dev=0.674
P	A	0, -0.219, 0.514, 1.246, 1.959 max_d=1.959 avg_d=0.514 std_dev=0.732
OP2	A	0, -0.093, 0.752, 1.596, 2.336 max_d=2.336 avg_d=0.752 std_dev=0.845
O2'	B	0, -0.151, 0.911, 1.973, 2.938 max_d=2.938 avg_d=0.911 std_dev=1.062
OP1	A	0, -0.451, 0.794, 2.039, 3.269 max_d=3.269 avg_d=0.794 std_dev=1.245
O5'	B	0, -0.065, 1.306, 2.677, 3.781 max_d=3.781 avg_d=1.306 std_dev=1.371
OP2	B	0, -0.198, 1.536, 3.271, 4.780 max_d=4.780 avg_d=1.536 std_dev=1.735
P	B	0, -0.730, 1.095, 2.921, 4.736 max_d=4.736 avg_d=1.095 std_dev=1.826
OP1	B	0, -0.194, 1.783, 3.760, 5.436 max_d=5.436 avg_d=1.783 std_dev=1.977

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.08	0.02	0.20	0.03	0.08
C2	0.02	0.00	0.07	0.17	0.01	0.07	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.19	0.02	0.12	0.01	0.28	0.12	0.14
C2'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.03	0.02	0.04	0.02	0.04	0.06	0.04	0.09	0.08	0.07	0.02	0.00	0.02	0.02	0.05	0.05	0.06	0.06	0.05
C3'	0.02	0.17	0.00	0.00	0.12	0.00	0.09	0.01	0.11	0.03	0.14	0.18	0.16	0.05	0.07	0.01	0.01	0.02	0.10	0.10	0.20	0.09	0.09
C4	0.01	0.01	0.03	0.12	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.13	0.01	0.12	0.01	0.29	0.13	0.13
C4'	0.01	0.07	0.02	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.06	0.03	0.07	0.08	0.07	0.03	0.03	0.09	0.02	0.00	0.02	0.06	0.09	0.16	0.03
C5	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.11	0.01	0.11	0.01	0.33	0.21	0.14
C5'	0.01	0.10	0.02	0.01	0.08	0.01	0.08	0.00	0.09	0.04	0.10	0.10	0.08	0.06	0.05	0.08	0.04	0.01	0.01	0.10	0.19	0.28	0.03
C6	0.01	0.01	0.04	0.11	0.01	0.06	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.13	0.02	0.12	0.00	0.33	0.23	0.15
C8	0.01	0.01	0.06	0.03	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.04	0.02	0.11	0.01	0.33	0.19	0.13
N1	0.02	0.00	0.04	0.14	0.01	0.07	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.17	0.02	0.12	0.01	0.31	0.18	0.15
N2	0.02	0.00	0.09	0.18	0.01	0.08	0.01	0.10	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.06	0.21	0.02	0.12	0.01	0.26	0.09	0.14
N3	0.01	0.01	0.08	0.16	0.01	0.07	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.18	0.01	0.12	0.01	0.26	0.09	0.13
N7	0.01	0.01	0.07	0.05	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.06	0.02	0.10	0.01	0.36	0.26	0.14
N9	0.00	0.01	0.02	0.07	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01	0.11	0.01	0.27	0.11	0.12
O2'	0.02	0.06	0.00	0.01	0.04	0.09	0.06	0.08	0.08	0.03	0.08	0.06	0.04	0.05	0.02	0.00	0.06	0.08	0.06	0.08	0.05	0.11	0.07
O3'	0.01	0.19	0.02	0.01	0.13	0.02	0.11	0.04	0.13	0.04	0.17	0.21	0.18	0.06	0.06	0.06	0.00	0.02	0.12	0.12	0.35	0.18	0.12
O4'	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.08	0.02	0.00	0.13	0.03	0.23	0.11	0.11
O5'	0.08	0.12	0.05	0.10	0.12	0.02	0.11	0.01	0.12	0.11	0.12	0.12	0.12	0.10	0.11	0.06	0.12	0.13	0.00	0.12	0.01	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.05	0.10	0.01	0.06	0.01	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.12	0.03	0.12	0.00	0.36	0.28	0.16
OP1	0.20	0.28	0.06	0.20	0.29	0.09	0.33	0.19	0.33	0.33	0.31	0.26	0.26	0.36	0.27	0.05	0.35	0.23	0.01	0.36	0.00	0.01	0.01
OP2	0.03	0.12	0.06	0.09	0.13	0.16	0.21	0.28	0.23	0.19	0.18	0.09	0.09	0.26	0.11	0.11	0.18	0.11	0.02	0.28	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.14	0.05	0.09	0.13	0.03	0.14	0.03	0.15	0.13	0.15	0.14	0.13	0.14	0.12	0.07	0.12	0.11	0.01	0.16	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.46	0.67	0.25	0.37	0.25	0.45	0.23	0.53	0.35	0.54	0.35	0.58	0.43	0.29	0.73	0.12	0.37	0.33	0.54	0.55	0.18
C2	0.21	0.23	0.36	0.09	0.12	0.31	0.19	0.27	0.30	0.14	0.33	0.10	0.36	0.17	0.13	0.27	0.40	0.47	0.40	0.29	0.50	0.10
C2'	0.05	0.40	0.54	0.20	0.31	0.14	0.46	0.12	0.55	0.33	0.53	0.26	0.65	0.46	0.22	0.52	0.10	0.28	0.36	0.61	0.73	0.32
C3'	0.10	0.28	0.40	0.14	0.24	0.10	0.42	0.09	0.51	0.32	0.44	0.15	0.62	0.46	0.16	0.35	0.09	0.26	0.40	0.70	0.80	0.44
C4	0.18	0.38	0.46	0.12	0.23	0.30	0.33	0.26	0.44	0.21	0.48	0.22	0.50	0.30	0.16	0.38	0.36	0.45	0.37	0.36	0.52	0.07
C4'	0.11	0.40	0.59	0.24	0.37	0.15	0.50	0.17	0.56	0.41	0.52	0.30	0.64	0.51	0.30	0.61	0.07	0.22	0.39	0.71	0.71	0.39
C5	0.26	0.36	0.30	0.08	0.17	0.35	0.29	0.29	0.43	0.16	0.47	0.14	0.50	0.25	0.13	0.25	0.46	0.51	0.41	0.29	0.51	0.09
C5'	0.09	0.36	0.50	0.23	0.36	0.12	0.50	0.20	0.55	0.44	0.49	0.27	0.64	0.54	0.30	0.49	0.16	0.15	0.44	0.78	0.75	0.49
C6	0.32	0.19	0.16	0.09	0.09	0.38	0.16	0.33	0.30	0.13	0.35	0.08	0.39	0.13	0.17	0.27	0.52	0.55	0.45	0.23	0.50	0.15
C8	0.16	0.48	0.52	0.14	0.35	0.30	0.46	0.25	0.56	0.31	0.57	0.34	0.61	0.42	0.23	0.44	0.35	0.44	0.35	0.41	0.53	0.10
N1	0.28	0.15	0.23	0.08	0.09	0.35	0.13	0.31	0.24	0.13	0.28	0.08	0.33	0.12	0.16	0.22	0.47	0.52	0.44	0.24	0.50	0.15
N2	0.20	0.18	0.36	0.09	0.11	0.30	0.16	0.27	0.24	0.13	0.27	0.09	0.31	0.14	0.13	0.28	0.38	0.46	0.40	0.29	0.50	0.11
N3	0.17	0.33	0.47	0.13	0.20	0.28	0.29	0.25	0.39	0.19	0.42	0.19	0.45	0.26	0.15	0.40	0.33	0.44	0.36	0.36	0.52	0.06
N7	0.27	0.44	0.31	0.08	0.25	0.37	0.39	0.29	0.52	0.21	0.55	0.23	0.58	0.33	0.14	0.27	0.48	0.53	0.40	0.31	0.52	0.07
N9	0.15	0.45	0.58	0.18	0.33	0.27	0.42	0.24	0.52	0.30	0.54	0.32	0.57	0.39	0.23	0.54	0.27	0.41	0.34	0.44	0.53	0.11
O2'	0.10	0.43	0.56	0.18	0.32	0.21	0.45	0.17	0.55	0.32	0.54	0.29	0.64	0.44	0.23	0.58	0.09	0.33	0.33	0.62	0.64	0.27
O3'	0.16	0.21	0.29	0.10	0.18	0.09	0.38	0.10	0.47	0.29	0.38	0.12	0.61	0.44	0.11	0.30	0.09	0.25	0.42	0.80	0.87	0.52
O4'	0.23	0.50	0.76	0.31	0.43	0.24	0.51	0.24	0.57	0.42	0.57	0.41	0.61	0.49	0.36	0.89	0.06	0.32	0.32	0.60	0.55	0.22
O5'	0.08	0.33	0.38	0.13	0.31	0.16	0.48	0.12	0.55	0.40	0.47	0.22	0.65	0.52	0.23	0.34	0.05	0.25	0.41	0.74	0.73	0.44
O6	0.42	0.02	0.02	0.15	0.17	0.43	0.06	0.38	0.22	0.18	0.27	0.24	0.33	0.07	0.27	0.43	0.58	0.60	0.50	0.22	0.49	0.22
OP1	0.37	0.06	0.04	0.18	0.04	0.45	0.20	0.26	0.25	0.20	0.16	0.11	0.36	0.28	0.13	0.11	0.04	0.52	0.11	0.77	0.45	0.28
OP2	0.16	0.65	0.24	0.17	0.69	0.10	0.96	0.32	1.03	0.85	0.88	0.51	1.19	1.05	0.59	0.32	0.01	0.13	0.83	1.10	1.24	0.99
P	0.14	0.26	0.14	0.02	0.26	0.16	0.45	0.09	0.50	0.38	0.41	0.17	0.61	0.52	0.19	0.18	0.00	0.21	0.43	0.81	0.75	0.52

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.29	0.00	0.30	0.15	0.82	0.26
C2	0.01	0.00	0.22	0.21	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.31	0.18	0.09	0.48	0.05	0.54	0.06
C2'	0.00	0.22	0.00	0.00	0.12	0.01	0.07	0.18	0.11	0.09	0.18	0.22	0.08	0.05	0.02	0.00	0.03	0.01	0.41	0.24	0.67	0.23
C3'	0.01	0.21	0.00	0.00	0.23	0.00	0.30	0.00	0.32	0.28	0.28	0.17	0.35	0.33	0.20	0.02	0.00	0.01	0.28	0.34	0.55	0.17
C4	0.01	0.01	0.12	0.23	0.00	0.07	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.23	0.09	0.05	0.50	0.07	0.58	0.08
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.10	0.13	0.07	0.02	0.12	0.14	0.07	0.22	0.03	0.00	0.02	0.15	0.69	0.18
C5	0.01	0.01	0.07	0.30	0.00	0.11	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.25	0.04	0.03	0.60	0.09	0.41	0.02
C5'	0.07	0.04	0.18	0.00	0.07	0.01	0.13	0.00	0.13	0.16	0.09	0.03	0.17	0.18	0.08	0.06	0.17	0.01	0.01	0.26	0.45	0.02
C6	0.01	0.01	0.11	0.32	0.00	0.10	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.29	0.04	0.05	0.61	0.10	0.35	0.05
C8	0.01	0.01	0.09	0.28	0.01	0.13	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.20	0.10	0.04	0.61	0.11	0.54	0.07
N1	0.01	0.00	0.18	0.28	0.00	0.07	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.30	0.07	0.07	0.55	0.08	0.43	0.01
N3	0.01	0.00	0.22	0.17	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.29	0.23	0.08	0.42	0.05	0.63	0.12
N6	0.01	0.01	0.08	0.35	0.01	0.12	0.01	0.17	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.30	0.11	0.04	0.66	0.13	0.24	0.11
N7	0.00	0.01	0.05	0.33	0.01	0.14	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.24	0.14	0.01	0.65	0.11	0.32	0.06
N9	0.00	0.01	0.02	0.20	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.16	0.08	0.01	0.47	0.10	0.68	0.14
O2'	0.01	0.31	0.00	0.02	0.23	0.22	0.25	0.06	0.29	0.20	0.30	0.29	0.30	0.24	0.16	0.00	0.07	0.16	0.39	0.22	0.64	0.13
O3'	0.29	0.18	0.03	0.00	0.09	0.03	0.04	0.17	0.04	0.10	0.07	0.23	0.11	0.14	0.08	0.07	0.00	0.21	0.31	0.59	0.64	0.34
O4'	0.00	0.09	0.01	0.01	0.05	0.00	0.03	0.01	0.05	0.04	0.07	0.08	0.04	0.01	0.01	0.16	0.21	0.00	0.13	0.19	0.95	0.38
O5'	0.30	0.48	0.41	0.28	0.50	0.02	0.60	0.01	0.61	0.61	0.55	0.42	0.66	0.65	0.47	0.39	0.31	0.13	0.00	0.02	0.04	0.01
OP1	0.15	0.05	0.24	0.34	0.07	0.15	0.09	0.26	0.10	0.11	0.08	0.05	0.13	0.11	0.10	0.22	0.59	0.19	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.82	0.54	0.67	0.55	0.58	0.69	0.41	0.45	0.35	0.54	0.43	0.63	0.24	0.32	0.68	0.64	0.64	0.95	0.04	0.01	0.00	0.00
P	0.26	0.06	0.23	0.17	0.08	0.18	0.02	0.02	0.05	0.07	0.01	0.12	0.11	0.06	0.14	0.13	0.34	0.38	0.01	0.00	0.00	0.00