Doublet Group distance statistics: 81216

back

Distances from reference structure (by RMSD)

4, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C8	B	0, 0.024, 0.120, 0.216, 0.258 max_d=0.258 avg_d=0.120 std_dev=0.096
N9	B	0, -0.002, 0.125, 0.252, 0.388 max_d=0.388 avg_d=0.125 std_dev=0.127
N3	A	0, -0.018, 0.111, 0.241, 0.394 max_d=0.394 avg_d=0.111 std_dev=0.130
C4	B	0, -0.048, 0.111, 0.270, 0.463 max_d=0.463 avg_d=0.111 std_dev=0.159
N7	B	0, -0.023, 0.137, 0.297, 0.469 max_d=0.469 avg_d=0.137 std_dev=0.160
C4	A	0, -0.061, 0.109, 0.279, 0.486 max_d=0.486 avg_d=0.109 std_dev=0.170
N9	A	0, -0.051, 0.134, 0.319, 0.544 max_d=0.544 avg_d=0.134 std_dev=0.185
C5	B	0, -0.077, 0.127, 0.332, 0.580 max_d=0.580 avg_d=0.127 std_dev=0.205
N3	B	0, -0.084, 0.133, 0.351, 0.617 max_d=0.617 avg_d=0.133 std_dev=0.218
C1'	A	0, -0.067, 0.156, 0.379, 0.650 max_d=0.650 avg_d=0.156 std_dev=0.223
C1'	B	0, -0.044, 0.181, 0.405, 0.670 max_d=0.670 avg_d=0.181 std_dev=0.224
C2'	B	0, -0.029, 0.210, 0.448, 0.720 max_d=0.720 avg_d=0.210 std_dev=0.239
C2	A	0, -0.076, 0.192, 0.460, 0.785 max_d=0.785 avg_d=0.192 std_dev=0.268
C2	B	0, -0.088, 0.184, 0.455, 0.781 max_d=0.781 avg_d=0.184 std_dev=0.272
O5'	B	0, -0.027, 0.245, 0.518, 0.831 max_d=0.831 avg_d=0.245 std_dev=0.272
P	B	0, -0.021, 0.274, 0.569, 0.898 max_d=0.898 avg_d=0.274 std_dev=0.295
O4'	B	0, -0.116, 0.188, 0.491, 0.864 max_d=0.864 avg_d=0.188 std_dev=0.304
N2	B	0, -0.062, 0.251, 0.564, 0.931 max_d=0.931 avg_d=0.251 std_dev=0.313
C8	A	0, -0.099, 0.224, 0.548, 0.942 max_d=0.942 avg_d=0.224 std_dev=0.323
C6	B	0, -0.140, 0.189, 0.518, 0.921 max_d=0.921 avg_d=0.189 std_dev=0.329
N1	B	0, -0.125, 0.209, 0.543, 0.944 max_d=0.944 avg_d=0.209 std_dev=0.334
C5	A	0, -0.149, 0.195, 0.539, 0.961 max_d=0.961 avg_d=0.195 std_dev=0.344
OP2	B	0, -0.013, 0.332, 0.678, 1.061 max_d=1.061 avg_d=0.332 std_dev=0.346
O2'	B	0, -0.077, 0.302, 0.682, 1.122 max_d=1.122 avg_d=0.302 std_dev=0.380
C3'	B	0, -0.114, 0.271, 0.657, 1.118 max_d=1.118 avg_d=0.271 std_dev=0.385
C4'	B	0, -0.128, 0.260, 0.648, 1.118 max_d=1.118 avg_d=0.260 std_dev=0.388
C5'	B	0, -0.125, 0.269, 0.662, 1.134 max_d=1.134 avg_d=0.269 std_dev=0.393
N1	A	0, -0.159, 0.248, 0.656, 1.156 max_d=1.156 avg_d=0.248 std_dev=0.407
N7	A	0, -0.156, 0.258, 0.671, 1.178 max_d=1.178 avg_d=0.258 std_dev=0.414
O5'	A	0, -0.168, 0.246, 0.660, 1.168 max_d=1.168 avg_d=0.246 std_dev=0.414
O6	B	0, -0.179, 0.261, 0.700, 1.237 max_d=1.237 avg_d=0.261 std_dev=0.439
O4'	A	0, -0.163, 0.279, 0.721, 1.263 max_d=1.263 avg_d=0.279 std_dev=0.442
C6	A	0, -0.204, 0.246, 0.697, 1.252 max_d=1.252 avg_d=0.246 std_dev=0.450
OP1	B	0, -0.088, 0.364, 0.817, 1.334 max_d=1.334 avg_d=0.364 std_dev=0.453
OP1	A	0, -0.055, 0.428, 0.911, 1.426 max_d=1.426 avg_d=0.428 std_dev=0.483
C2'	A	0, -0.209, 0.277, 0.763, 1.362 max_d=1.362 avg_d=0.277 std_dev=0.486
P	A	0, -0.199, 0.351, 0.902, 1.571 max_d=1.571 avg_d=0.351 std_dev=0.551
C3'	A	0, -0.234, 0.342, 0.918, 1.627 max_d=1.627 avg_d=0.342 std_dev=0.576
O3'	B	0, -0.195, 0.401, 0.998, 1.710 max_d=1.710 avg_d=0.401 std_dev=0.597
C4'	A	0, -0.235, 0.362, 0.958, 1.692 max_d=1.692 avg_d=0.362 std_dev=0.597
C5'	A	0, -0.244, 0.379, 1.002, 1.766 max_d=1.766 avg_d=0.379 std_dev=0.623
O2'	A	0, -0.265, 0.359, 0.983, 1.750 max_d=1.750 avg_d=0.359 std_dev=0.624
N6	A	0, -0.288, 0.340, 0.968, 1.741 max_d=1.741 avg_d=0.340 std_dev=0.628
O3'	A	0, -0.438, 0.532, 1.502, 2.699 max_d=2.699 avg_d=0.532 std_dev=0.970
OP2	A	0, -0.558, 0.719, 1.995, 3.550 max_d=3.550 avg_d=0.719 std_dev=1.276

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.27	0.00	0.09	0.25	0.23	0.10
C2	0.02	0.00	0.13	0.03	0.00	0.14	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.40	0.19	0.08	0.18	0.42	0.16
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.09	0.01	0.07	0.15	0.10	0.03	0.12	0.12	0.09	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.31	0.47	0.17	0.33
C3'	0.02	0.03	0.00	0.00	0.14	0.00	0.27	0.01	0.24	0.38	0.13	0.02	0.31	0.38	0.18	0.02	0.01	0.00	0.05	0.06	0.40	0.06
C4	0.01	0.00	0.09	0.14	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.11	0.20	0.10	0.12	0.18	0.48	0.19
C4'	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00	0.09	0.00	0.05	0.25	0.06	0.15	0.11	0.22	0.08	0.17	0.02	0.00	0.01	0.11	0.17	0.03
C5	0.00	0.00	0.07	0.27	0.00	0.09	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.20	0.02	0.05	0.27	0.16	0.65	0.37
C5'	0.03	0.07	0.15	0.01	0.04	0.00	0.17	0.00	0.13	0.30	0.03	0.09	0.21	0.30	0.11	0.02	0.13	0.02	0.01	0.18	0.08	0.01
C6	0.01	0.00	0.10	0.24	0.00	0.05	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.17	0.08	0.09	0.27	0.16	0.66	0.39
C8	0.01	0.00	0.03	0.38	0.00	0.25	0.01	0.30	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.29	0.20	0.09	0.32	0.17	0.67	0.36
N1	0.02	0.00	0.12	0.13	0.00	0.06	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.25	0.15	0.17	0.16	0.55	0.29
N3	0.02	0.00	0.12	0.02	0.00	0.15	0.00	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.42	0.18	0.04	0.20	0.35	0.09
N6	0.00	0.00	0.09	0.31	0.01	0.11	0.01	0.21	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.22	0.04	0.05	0.35	0.20	0.77	0.51
N7	0.01	0.00	0.02	0.38	0.00	0.22	0.00	0.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.29	0.20	0.04	0.38	0.18	0.76	0.48
N9	0.00	0.00	0.02	0.18	0.00	0.08	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.16	0.09	0.01	0.12	0.19	0.45	0.15
O2'	0.01	0.04	0.00	0.02	0.11	0.17	0.20	0.02	0.17	0.29	0.09	0.04	0.22	0.29	0.16	0.00	0.03	0.14	0.27	0.52	0.19	0.37
O3'	0.27	0.40	0.02	0.01	0.20	0.02	0.02	0.13	0.08	0.20	0.25	0.42	0.04	0.20	0.09	0.03	0.00	0.18	0.20	0.43	0.81	0.36
O4'	0.00	0.19	0.02	0.00	0.10	0.00	0.05	0.02	0.09	0.09	0.15	0.18	0.05	0.04	0.01	0.14	0.18	0.00	0.06	0.10	0.15	0.06
O5'	0.09	0.08	0.31	0.05	0.12	0.01	0.27	0.01	0.27	0.32	0.17	0.04	0.35	0.38	0.12	0.27	0.20	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.25	0.18	0.47	0.06	0.18	0.11	0.16	0.18	0.16	0.17	0.16	0.20	0.20	0.18	0.19	0.52	0.43	0.10	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.23	0.42	0.17	0.40	0.48	0.17	0.65	0.08	0.66	0.67	0.55	0.35	0.77	0.76	0.45	0.19	0.81	0.15	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.10	0.16	0.33	0.06	0.19	0.03	0.37	0.01	0.39	0.36	0.29	0.09	0.51	0.48	0.15	0.37	0.36	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.29	0.10	0.14	0.20	0.14	0.18	0.25	0.21	0.11	0.27	0.34	0.26	0.12	0.16	0.20	0.23	0.09	0.18	0.20	0.35	0.16	0.23
C2	0.18	0.39	0.11	0.14	0.36	0.21	0.41	0.22	0.45	0.32	0.44	0.38	0.34	0.38	0.30	0.11	0.27	0.06	0.02	0.47	0.11	0.13	0.03
C2'	0.08	0.10	0.10	0.21	0.06	0.21	0.08	0.30	0.06	0.16	0.08	0.16	0.08	0.15	0.09	0.11	0.26	0.13	0.25	0.07	0.35	0.25	0.28
C3'	0.26	0.28	0.24	0.16	0.25	0.17	0.22	0.14	0.23	0.21	0.26	0.31	0.28	0.19	0.24	0.33	0.11	0.23	0.20	0.21	0.15	0.23	0.20
C4	0.19	0.43	0.10	0.15	0.34	0.20	0.35	0.29	0.41	0.24	0.44	0.46	0.37	0.29	0.26	0.13	0.30	0.06	0.13	0.43	0.28	0.03	0.14
C4'	0.44	0.49	0.42	0.29	0.42	0.31	0.36	0.21	0.38	0.31	0.44	0.54	0.48	0.29	0.40	0.55	0.22	0.39	0.22	0.34	0.07	0.15	0.15
C5	0.23	0.58	0.11	0.15	0.46	0.21	0.49	0.30	0.58	0.33	0.62	0.62	0.50	0.42	0.35	0.12	0.34	0.06	0.11	0.61	0.29	0.02	0.13
C5'	0.41	0.49	0.39	0.22	0.41	0.25	0.35	0.15	0.37	0.28	0.45	0.55	0.48	0.27	0.38	0.53	0.15	0.35	0.15	0.34	0.07	0.09	0.08
C6	0.24	0.67	0.12	0.15	0.55	0.22	0.61	0.27	0.70	0.41	0.73	0.69	0.57	0.53	0.42	0.10	0.35	0.05	0.07	0.74	0.23	0.09	0.07
C8	0.20	0.51	0.11	0.17	0.37	0.19	0.38	0.31	0.46	0.23	0.52	0.57	0.44	0.30	0.28	0.17	0.33	0.07	0.18	0.47	0.39	0.11	0.22
N1	0.23	0.59	0.12	0.14	0.52	0.22	0.59	0.23	0.65	0.43	0.65	0.57	0.51	0.53	0.42	0.12	0.31	0.05	0.02	0.69	0.14	0.16	0.04
N3	0.15	0.31	0.10	0.14	0.26	0.19	0.28	0.25	0.32	0.21	0.33	0.32	0.27	0.24	0.22	0.11	0.25	0.07	0.08	0.33	0.18	0.03	0.07
N6	0.26	0.82	0.14	0.15	0.64	0.22	0.72	0.27	0.85	0.48	0.89	0.85	0.68	0.62	0.48	0.10	0.37	0.06	0.06	0.90	0.24	0.11	0.07
N7	0.23	0.62	0.12	0.16	0.47	0.20	0.49	0.31	0.59	0.31	0.64	0.67	0.52	0.40	0.35	0.15	0.36	0.06	0.15	0.62	0.36	0.05	0.18
N9	0.17	0.40	0.09	0.17	0.29	0.19	0.29	0.31	0.35	0.18	0.40	0.44	0.35	0.22	0.22	0.16	0.30	0.07	0.18	0.35	0.36	0.12	0.22
O2'	0.12	0.09	0.17	0.32	0.07	0.33	0.11	0.47	0.06	0.23	0.06	0.16	0.06	0.21	0.13	0.08	0.39	0.20	0.44	0.08	0.60	0.47	0.51
O3'	0.72	0.69	0.72	0.67	0.70	0.67	0.68	0.68	0.67	0.69	0.68	0.70	0.70	0.67	0.71	0.77	0.61	0.72	0.77	0.65	0.74	0.82	0.80
O4'	0.41	0.51	0.35	0.16	0.42	0.18	0.36	0.06	0.39	0.28	0.47	0.57	0.50	0.27	0.38	0.49	0.09	0.33	0.06	0.36	0.23	0.06	0.09
O5'	0.25	0.38	0.20	0.03	0.29	0.05	0.26	0.05	0.30	0.18	0.36	0.44	0.35	0.19	0.25	0.31	0.09	0.17	0.03	0.28	0.16	0.04	0.05
OP1	0.37	0.60	0.30	0.08	0.47	0.11	0.44	0.05	0.50	0.31	0.58	0.67	0.55	0.34	0.39	0.41	0.08	0.27	0.08	0.49	0.20	0.07	0.07
OP2	0.09	0.08	0.09	0.10	0.10	0.10	0.15	0.11	0.15	0.18	0.11	0.09	0.07	0.20	0.11	0.17	0.11	0.10	0.09	0.18	0.08	0.09	0.08
P	0.17	0.28	0.13	0.03	0.21	0.02	0.19	0.04	0.22	0.14	0.27	0.33	0.25	0.14	0.18	0.23	0.12	0.12	0.04	0.21	0.07	0.07	0.03

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02
C2	0.01	0.00	0.08	0.10	0.00	0.04	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.10	0.13	0.01	0.05	0.01	0.05	0.08	0.07
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.05	0.02	0.03	0.00	0.05	0.02	0.07	0.10	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.04	0.04	0.06	0.06
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.07	0.00	0.07	0.01	0.08	0.08	0.10	0.11	0.09	0.08	0.05	0.01	0.00	0.02	0.03	0.08	0.04	0.02	0.03
C4	0.01	0.00	0.05	0.07	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.08	0.01	0.04	0.01	0.04	0.07	0.05
C4'	0.00	0.04	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.03	0.03	0.05	0.04	0.03	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01
C5	0.01	0.00	0.03	0.07	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.09	0.01	0.06	0.00	0.06	0.08	0.07
C5'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.07	0.03	0.04	0.03	0.07	0.03	0.07	0.02	0.01	0.01	0.05	0.03	0.01	0.01
C6	0.01	0.00	0.05	0.08	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.11	0.01	0.06	0.00	0.07	0.09	0.08
C8	0.00	0.00	0.02	0.08	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.01	0.08	0.00	0.08	0.07	0.07
N1	0.01	0.00	0.07	0.10	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.08	0.13	0.01	0.05	0.00	0.06	0.09	0.07
N2	0.01	0.00	0.10	0.11	0.00	0.05	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.11	0.16	0.01	0.05	0.01	0.05	0.09	0.07
N3	0.01	0.00	0.08	0.09	0.00	0.04	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.11	0.01	0.04	0.01	0.04	0.07	0.06
N7	0.00	0.01	0.01	0.08	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.09	0.01	0.08	0.00	0.08	0.09	0.09
N9	0.00	0.00	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.04	0.05	0.04
O2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.05	0.07	0.04	0.07	0.06	0.01	0.08	0.11	0.09	0.01	0.02	0.00	0.03	0.04	0.02	0.06	0.05	0.02	0.01
O3'	0.00	0.13	0.01	0.00	0.08	0.00	0.09	0.02	0.11	0.08	0.13	0.16	0.11	0.09	0.05	0.03	0.00	0.00	0.03	0.11	0.04	0.02	0.02
O4'	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.06	0.05
O5'	0.02	0.05	0.05	0.03	0.04	0.01	0.06	0.01	0.06	0.08	0.05	0.05	0.04	0.08	0.04	0.02	0.03	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.04	0.08	0.01	0.01	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.11	0.01	0.06	0.00	0.08	0.10	0.09
OP1	0.01	0.05	0.04	0.04	0.04	0.03	0.06	0.03	0.07	0.08	0.06	0.05	0.04	0.08	0.04	0.05	0.04	0.04	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00
OP2	0.03	0.08	0.06	0.02	0.07	0.01	0.08	0.01	0.09	0.07	0.09	0.09	0.07	0.09	0.05	0.02	0.02	0.06	0.01	0.10	0.01	0.00	0.00
P	0.02	0.07	0.06	0.03	0.05	0.01	0.07	0.01	0.08	0.07	0.07	0.07	0.06	0.09	0.04	0.01	0.02	0.05	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00