Doublet Group distance statistics: 9116

back

Distances from reference structure (by RMSD)

13, 3, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	B	0, 0.013, 0.063, 0.112, 0.188 max_d=0.188 avg_d=0.063 std_dev=0.049
C5	A	0, -0.003, 0.064, 0.131, 0.265 max_d=0.265 avg_d=0.064 std_dev=0.067
C4	B	0, -0.001, 0.078, 0.156, 0.286 max_d=0.286 avg_d=0.078 std_dev=0.079
C2	B	0, -0.009, 0.071, 0.151, 0.318 max_d=0.318 avg_d=0.071 std_dev=0.080
C4	A	0, -0.033, 0.071, 0.174, 0.392 max_d=0.392 avg_d=0.071 std_dev=0.103
O2	B	0, -0.003, 0.104, 0.210, 0.389 max_d=0.389 avg_d=0.104 std_dev=0.106
N4	B	0, 0.004, 0.111, 0.218, 0.408 max_d=0.408 avg_d=0.111 std_dev=0.107
C5	B	0, -0.027, 0.101, 0.230, 0.460 max_d=0.460 avg_d=0.101 std_dev=0.128
N1	B	0, -0.054, 0.080, 0.213, 0.473 max_d=0.473 avg_d=0.080 std_dev=0.133
C6	B	0, -0.045, 0.102, 0.249, 0.523 max_d=0.523 avg_d=0.102 std_dev=0.147
C6	A	0, -0.080, 0.110, 0.300, 0.676 max_d=0.676 avg_d=0.110 std_dev=0.190
C1'	B	0, -0.075, 0.117, 0.310, 0.665 max_d=0.665 avg_d=0.117 std_dev=0.192
N7	A	0, -0.056, 0.141, 0.339, 0.708 max_d=0.708 avg_d=0.141 std_dev=0.198
N9	A	0, -0.093, 0.124, 0.341, 0.744 max_d=0.744 avg_d=0.124 std_dev=0.217
N3	A	0, -0.088, 0.140, 0.368, 0.808 max_d=0.808 avg_d=0.140 std_dev=0.228
C8	A	0, -0.086, 0.157, 0.400, 0.833 max_d=0.833 avg_d=0.157 std_dev=0.243
O4'	B	0, -0.080, 0.168, 0.416, 0.849 max_d=0.849 avg_d=0.168 std_dev=0.248
N1	A	0, -0.118, 0.148, 0.413, 0.906 max_d=0.906 avg_d=0.148 std_dev=0.265
C2	A	0, -0.108, 0.162, 0.432, 0.924 max_d=0.924 avg_d=0.162 std_dev=0.270
N6	A	0, -0.144, 0.180, 0.504, 1.146 max_d=1.146 avg_d=0.180 std_dev=0.324
C2'	A	0, -0.133, 0.226, 0.586, 1.247 max_d=1.247 avg_d=0.226 std_dev=0.360
C1'	A	0, -0.189, 0.189, 0.568, 1.271 max_d=1.271 avg_d=0.189 std_dev=0.379
OP2	A	0, -0.154, 0.333, 0.821, 1.780 max_d=1.780 avg_d=0.333 std_dev=0.488
C4'	B	0, -0.238, 0.266, 0.770, 1.730 max_d=1.730 avg_d=0.266 std_dev=0.504
O4'	A	0, -0.278, 0.262, 0.801, 1.784 max_d=1.784 avg_d=0.262 std_dev=0.540
O5'	A	0, -0.215, 0.326, 0.867, 1.849 max_d=1.849 avg_d=0.326 std_dev=0.541
P	A	0, -0.216, 0.336, 0.889, 2.064 max_d=2.064 avg_d=0.336 std_dev=0.552
C3'	A	0, -0.284, 0.281, 0.845, 1.880 max_d=1.880 avg_d=0.281 std_dev=0.565
C3'	B	0, -0.282, 0.284, 0.850, 1.950 max_d=1.950 avg_d=0.284 std_dev=0.566
O2'	A	0, -0.187, 0.380, 0.948, 1.986 max_d=1.986 avg_d=0.380 std_dev=0.568
C2'	B	0, -0.302, 0.276, 0.854, 1.965 max_d=1.965 avg_d=0.276 std_dev=0.578
C5'	B	0, -0.295, 0.357, 1.009, 2.229 max_d=2.229 avg_d=0.357 std_dev=0.652
OP1	A	0, -0.244, 0.448, 1.141, 2.619 max_d=2.619 avg_d=0.448 std_dev=0.692
O3'	A	0, -0.317, 0.378, 1.073, 2.345 max_d=2.345 avg_d=0.378 std_dev=0.695
O3'	B	0, -0.328, 0.372, 1.072, 2.365 max_d=2.365 avg_d=0.372 std_dev=0.700
C4'	A	0, -0.391, 0.350, 1.091, 2.443 max_d=2.443 avg_d=0.350 std_dev=0.741
O2'	B	0, -0.388, 0.397, 1.182, 2.637 max_d=2.637 avg_d=0.397 std_dev=0.785
C5'	A	0, -0.518, 0.451, 1.419, 3.199 max_d=3.199 avg_d=0.451 std_dev=0.968
P	B	0, -0.422, 0.584, 1.591, 3.459 max_d=3.459 avg_d=0.584 std_dev=1.006
OP2	B	0, -0.363, 0.697, 1.756, 3.564 max_d=3.564 avg_d=0.697 std_dev=1.059
O5'	B	0, -0.530, 0.536, 1.601, 3.561 max_d=3.561 avg_d=0.536 std_dev=1.065
OP1	B	0, -0.602, 0.744, 2.091, 4.557 max_d=4.557 avg_d=0.744 std_dev=1.347

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.15	0.12	0.06	0.06
C2	0.01	0.00	0.11	0.18	0.00	0.06	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.06	0.20	0.04	0.26	0.19	0.20	0.17
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.06	0.01	0.04	0.02	0.06	0.03	0.09	0.11	0.05	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.20	0.24	0.11	0.15
C3'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.14	0.00	0.14	0.01	0.17	0.07	0.18	0.16	0.16	0.11	0.08	0.02	0.00	0.01	0.26	0.36	0.09	0.21
C4	0.01	0.00	0.06	0.14	0.00	0.07	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.14	0.02	0.28	0.20	0.19	0.17
C4'	0.00	0.06	0.01	0.00	0.07	0.00	0.09	0.00	0.10	0.10	0.08	0.04	0.11	0.11	0.06	0.05	0.01	0.00	0.01	0.11	0.17	0.03
C5	0.01	0.00	0.04	0.14	0.00	0.09	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.16	0.01	0.33	0.25	0.26	0.23
C5'	0.03	0.12	0.02	0.01	0.13	0.00	0.19	0.00	0.19	0.19	0.16	0.10	0.22	0.22	0.12	0.04	0.02	0.01	0.01	0.21	0.29	0.01
C6	0.01	0.00	0.06	0.17	0.00	0.10	0.00	0.19	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.19	0.02	0.34	0.26	0.29	0.24
C8	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.10	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.07	0.04	0.34	0.25	0.22	0.22
N1	0.01	0.00	0.09	0.18	0.00	0.08	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.05	0.21	0.03	0.30	0.23	0.26	0.21
N3	0.01	0.00	0.11	0.16	0.00	0.04	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.17	0.04	0.23	0.17	0.16	0.14
N6	0.01	0.00	0.05	0.16	0.01	0.11	0.01	0.22	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.19	0.02	0.36	0.29	0.33	0.27
N7	0.01	0.01	0.02	0.11	0.00	0.11	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.12	0.03	0.37	0.29	0.29	0.26
N9	0.00	0.00	0.02	0.08	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.08	0.01	0.27	0.19	0.15	0.15
O2'	0.01	0.06	0.00	0.02	0.04	0.05	0.04	0.04	0.05	0.03	0.05	0.05	0.05	0.03	0.02	0.00	0.03	0.07	0.03	0.08	0.06	0.06
O3'	0.01	0.20	0.01	0.00	0.14	0.01	0.16	0.02	0.19	0.07	0.21	0.17	0.19	0.12	0.08	0.03	0.00	0.01	0.17	0.38	0.05	0.19
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.04	0.02	0.03	0.01	0.07	0.01	0.00	0.06	0.04	0.11	0.06
O5'	0.15	0.26	0.20	0.26	0.28	0.01	0.33	0.01	0.34	0.34	0.30	0.23	0.36	0.37	0.27	0.03	0.17	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.12	0.19	0.24	0.36	0.20	0.11	0.25	0.21	0.26	0.25	0.23	0.17	0.29	0.29	0.19	0.08	0.38	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.06	0.20	0.11	0.09	0.19	0.17	0.26	0.29	0.29	0.22	0.26	0.16	0.33	0.29	0.15	0.06	0.05	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.17	0.15	0.21	0.17	0.03	0.23	0.01	0.24	0.22	0.21	0.14	0.27	0.26	0.15	0.06	0.19	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.49	0.34	0.72	0.32	0.29	0.42	0.41	0.48	0.48	0.44	0.27	0.20	0.32	0.91	0.27	0.41	0.16	0.28	0.53	0.24
C2	0.22	0.23	0.34	0.10	0.23	0.10	0.23	0.12	0.23	0.23	0.23	0.22	0.23	0.55	0.09	0.16	0.65	0.79	1.00	0.76
C2'	0.44	0.29	0.68	0.23	0.23	0.31	0.34	0.34	0.42	0.38	0.21	0.13	0.27	0.92	0.17	0.33	0.30	0.44	0.61	0.37
C3'	0.33	0.15	0.56	0.15	0.11	0.25	0.23	0.32	0.32	0.27	0.10	0.12	0.14	0.81	0.11	0.27	0.32	0.41	0.62	0.36
C4	0.26	0.19	0.42	0.06	0.18	0.17	0.25	0.23	0.28	0.24	0.16	0.13	0.17	0.62	0.09	0.21	0.46	0.58	0.83	0.55
C4'	0.49	0.28	0.74	0.36	0.21	0.48	0.37	0.57	0.47	0.41	0.18	0.11	0.25	0.94	0.28	0.45	0.10	0.16	0.42	0.12
C5	0.10	0.07	0.20	0.18	0.07	0.07	0.12	0.11	0.13	0.09	0.08	0.08	0.08	0.41	0.14	0.10	0.61	0.70	0.94	0.67
C5'	0.37	0.14	0.60	0.25	0.10	0.40	0.26	0.52	0.35	0.28	0.09	0.12	0.11	0.79	0.19	0.36	0.12	0.16	0.46	0.14
C6	0.11	0.13	0.08	0.33	0.12	0.16	0.10	0.13	0.10	0.11	0.14	0.13	0.15	0.25	0.24	0.12	0.78	0.85	1.07	0.83
C8	0.20	0.10	0.37	0.06	0.10	0.17	0.21	0.25	0.23	0.18	0.08	0.08	0.08	0.58	0.08	0.19	0.41	0.49	0.77	0.47
N1	0.08	0.07	0.09	0.31	0.07	0.16	0.09	0.15	0.09	0.08	0.07	0.08	0.07	0.30	0.22	0.11	0.81	0.90	1.11	0.88
N3	0.36	0.31	0.52	0.11	0.29	0.23	0.35	0.25	0.36	0.34	0.28	0.23	0.30	0.72	0.13	0.28	0.45	0.60	0.83	0.56
N6	0.28	0.31	0.23	0.50	0.27	0.30	0.22	0.23	0.23	0.27	0.31	0.26	0.33	0.10	0.38	0.25	0.89	0.94	1.14	0.92
N7	0.09	0.09	0.19	0.17	0.08	0.07	0.11	0.13	0.12	0.08	0.11	0.11	0.12	0.41	0.13	0.10	0.56	0.63	0.89	0.61
N9	0.32	0.21	0.51	0.14	0.19	0.26	0.30	0.32	0.34	0.29	0.17	0.13	0.19	0.71	0.14	0.28	0.33	0.44	0.71	0.41
O2'	0.71	0.53	0.99	0.53	0.43	0.56	0.56	0.58	0.66	0.64	0.44	0.30	0.52	1.23	0.42	0.57	0.10	0.21	0.34	0.14
O3'	0.36	0.16	0.60	0.18	0.11	0.26	0.23	0.32	0.33	0.28	0.10	0.13	0.14	0.88	0.12	0.28	0.30	0.41	0.57	0.33
O4'	0.53	0.36	0.77	0.40	0.30	0.52	0.44	0.61	0.52	0.47	0.28	0.20	0.33	0.94	0.35	0.49	0.11	0.16	0.44	0.13
O5'	0.61	0.46	0.83	0.45	0.44	0.57	0.56	0.64	0.61	0.56	0.40	0.35	0.43	1.04	0.40	0.56	0.10	0.15	0.41	0.11
OP1	0.53	0.37	0.78	0.41	0.35	0.52	0.49	0.61	0.54	0.48	0.30	0.27	0.33	0.98	0.37	0.48	0.13	0.16	0.39	0.13
OP2	0.41	0.27	0.59	0.25	0.28	0.40	0.40	0.49	0.44	0.37	0.23	0.22	0.23	0.80	0.25	0.40	0.17	0.24	0.55	0.22
P	0.46	0.31	0.68	0.33	0.31	0.46	0.44	0.55	0.48	0.42	0.26	0.23	0.28	0.88	0.31	0.44	0.12	0.16	0.46	0.15

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.22	0.00	0.22	0.21	0.19	0.10
C2	0.01	0.00	0.14	0.19	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.10	0.10	0.45	0.44	0.30	0.37
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.03	0.01	0.09	0.16	0.12	0.02	0.11	0.03	0.24	0.00	0.01	0.01	0.05	0.13	0.59	0.22
C3'	0.01	0.19	0.00	0.00	0.28	0.00	0.28	0.01	0.24	0.18	0.24	0.30	0.13	0.01	0.00	0.01	0.10	0.14	0.41	0.09
C4	0.01	0.00	0.03	0.28	0.00	0.09	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.22	0.10	0.02	0.70	0.70	0.71	0.65
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.09	0.00	0.15	0.00	0.16	0.06	0.04	0.10	0.06	0.22	0.01	0.00	0.01	0.14	0.29	0.05
C5	0.01	0.00	0.09	0.28	0.00	0.15	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.29	0.16	0.08	0.77	0.75	0.72	0.70
C5'	0.06	0.07	0.16	0.01	0.10	0.00	0.14	0.00	0.13	0.05	0.08	0.11	0.11	0.07	0.16	0.01	0.01	0.23	0.25	0.01
C6	0.01	0.01	0.12	0.24	0.00	0.16	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.26	0.11	0.11	0.68	0.61	0.45	0.54
N1	0.00	0.01	0.02	0.18	0.00	0.06	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.06	0.01	0.47	0.43	0.22	0.34
N3	0.01	0.00	0.11	0.24	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.13	0.05	0.08	0.57	0.57	0.52	0.51
N4	0.01	0.00	0.03	0.30	0.00	0.10	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.24	0.13	0.03	0.74	0.78	0.86	0.74
O2	0.02	0.00	0.24	0.13	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.12	0.22	0.17	0.32	0.32	0.16	0.25
O2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.22	0.22	0.29	0.07	0.26	0.13	0.13	0.24	0.12	0.00	0.03	0.17	0.10	0.14	0.69	0.21
O3'	0.22	0.10	0.01	0.00	0.10	0.01	0.16	0.16	0.11	0.06	0.05	0.13	0.22	0.03	0.00	0.17	0.18	0.35	0.30	0.14
O4'	0.00	0.10	0.01	0.01	0.02	0.00	0.08	0.01	0.11	0.01	0.08	0.03	0.17	0.17	0.17	0.00	0.20	0.24	0.09	0.14
O5'	0.22	0.45	0.05	0.10	0.70	0.01	0.77	0.01	0.68	0.47	0.57	0.74	0.32	0.10	0.18	0.20	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.21	0.44	0.13	0.14	0.70	0.14	0.75	0.23	0.61	0.43	0.57	0.78	0.32	0.14	0.35	0.24	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.19	0.30	0.59	0.41	0.71	0.29	0.72	0.25	0.45	0.22	0.52	0.86	0.16	0.69	0.30	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.37	0.22	0.09	0.65	0.05	0.70	0.01	0.54	0.34	0.51	0.74	0.25	0.21	0.14	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00