CompaRNA - on-line benchmarks of RNA structure prediction methods
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RNA Secondary Structure Atlas - PDB - RDfolder
2K5Z_A
[ FASTA input ]
GGUCUACAUUGCUGUUGUCGUGUGUGACC
[ reference std structure ]
(((((((((.((....)).))))).))))
[ reference ext structure ]
(((((((((.((....)).))))).))))
[ predicted structure ]
((((.(((............)))..))))
2K63_A
[ FASTA input ]
GGAGUAUGUAUUGGCACUGAGCAUACUCC
[ reference std structure ]
(((((((((...........)))))))))
[ reference ext structure ]
((((((((((.........))))))))))
[ predicted structure ]
((((((((.............))))))))
2K66_A
[ FASTA input ]
GGAGUAUGUGAAAGCAUACUCC
[ reference std structure ]
(((((((((....)))))))))
[ reference ext structure ]
((((((((((..))))))))))
[ predicted structure ]
((((((((......))))))))
2KD8_A
[ FASTA input ]
GGAUGGUUGGGGUUAGCCAUCC
[ reference std structure ]
(((((((((....)))))))))
[ reference ext structure ]
(((((((((....)))))))))
[ predicted structure ]
((((((((......))))))))
2KDQ_B
[ FASTA input ]
GGCAGAUCUGAGCCUGGGAGCUCUCUGCC
[ reference std structure ]
((((((...((((......))))))))))
[ reference ext structure ]
(((((([..(]((......)).)))))))
( )
[ predicted structure ]
((((((...((((......))))))))))
2KE6_A
[ FASTA input ]
GGCUUGAUUGUAUUUUUAAAUUAAUUCUUAAAAACUACAAAUUAAGCC
[ reference std structure ]
(((((.(((((((((((((........))))))).))).))).)))))
[ reference ext structure ]
(((((.(((((((((((((.(....).))))))).))).))).)))))
[ predicted structure ]
(((((((((...(((((((........))))))).....)))))))))
2KEZ_A
[ FASTA input ]
GGUUCCCCUGCAUAAGGAUGAACC
[ reference std structure ]
(((((.(((.....)))..)))))
[ reference ext structure ]
((((((((((...)))).))))))
[ predicted structure ]
(((((.(((.....)))..)))))
2KFC_A
[ FASTA input ]
GGAGAGGUUCUAGUUAUACCCUCUAUAAAAAACUAA
[ reference std structure ]
..(((((...[[[......)))))........]].]
[ reference ext structure ]
..({a((.(.<<(.....)))(})..A)...).>.>
( )
( )
( )
( )
()
( )
( )
( )
( )
( )
[ predicted structure ]
..(((((............)))))............
2KGP_A
[ FASTA input ]
GGCAGUGUGAGUACCUUCACACGUC
[ reference std structure ]
(((.((((((......)))))))))
[ reference ext structure ]
(((.((((((......)))))))))
[ predicted structure ]
(((.((((((......)))))))))
2KMJ_A
[ FASTA input ]
GGCCAGAUUGAGCUUCGGCUCUCUGGUC
[ reference std structure ]
(((((((..((((....)))))))))))
[ reference ext structure ]
(((((((..((((....)))))))))))
[ predicted structure ]
(((((((..((((....)))))))))))
2KPV_A
[ FASTA input ]
GGAGGUAGUAGGUCGAAAGACCGUUCUACACUCC
[ reference std structure ]
((((((((.(((((....)))).).)))).))))
[ reference ext structure ]
((((((((.(((((....)))).).)))).))))
[ predicted structure ]
((((((((..((((....))))...)))).))))
2KU0_A
[ FASTA input ]
GGAGGAACUACUGUCUUCCUUCGGGUCGUGCAGCCUCC
[ reference std structure ]
(((((.....(((((..((....))..).)))))))))
[ reference ext structure ]
((((((..).((((((((((..)))))).)))))))))
[ predicted structure ]
(((((((........)))))))................
2KUR_A
[ FASTA input ]
GGCUUGAUUGUAUUAUUAAAUUAAUUCUUAAUAACUACAAAUUAAGCC
[ reference std structure ]
(((((((((((((((((((........))))))).))).)))))))))
[ reference ext structure ]
(((((((((((((((((((((....))))))))).))).)))))))))
[ predicted structure ]
(((((((((...(((((((........))))))).....)))))))))
2KUU_A
[ FASTA input ]
GGCUUGAUUGUAUGUGUAAAUUAAUUCUUACACACUACAAAUUAAGCC
[ reference std structure ]
(((((.(((((((((((((........))))))).))).))).)))))
[ reference ext structure ]
(((((.(((((((((((((((....))))))))).))).))).)))))
( )
[ predicted structure ]
(((((((((...(((((((........))))))).....)))))))))
2KUV_A
[ FASTA input ]
GGCUCGAUUGUAUUUUUAAAUUAAUUCUUAAAAACUACAAAUCGAGCC
[ reference std structure ]
(((((((((((((((((((........))))))).))).)))))))))
[ reference ext structure ]
(((((((((((((((((((((....))))))))).))).)))))))))
( )
[ predicted structure ]
(((((((((...(((((((........))))))).....)))))))))
2KUW_A
[ FASTA input ]
GGGGUUGGUGUAUUUUUAAAUUAAUUCUUAAAAACUACAAUCAGCUCC
[ reference std structure ]
(((((((((((.(((((((........)))))))..)).)))))))))
[ reference ext structure ]
(((((((((((((((((((.(....).))))))).))).)))))))))
( )
[ predicted structure ]
(((((((((...(((((((........))))))).....)))))))))
2KX8_A
[ FASTA input ]
GGGAAAUGAGGCGCUGCAUGUGGCAGUCUGCCUUUCUUUCCC
[ reference std structure ]
((((((.((((((((((.....)))))..)))))..))))))
[ reference ext structure ]
(((((((((((((((((.....)))))..))))).)))))))
( )
[ predicted structure ]
((((((..((((.((((.....))))...))))...))))))
2KXM_A
[ FASTA input ]
GGCUGCUUGUCCUUUAAUGGUCCAGUC
[ reference std structure ]
(((((...(.((......)).))))))
[ reference ext structure ]
(((((...(((((....))))))))))
[ predicted structure ]
(((((.................)))))
2KZL_A
[ FASTA input ]
GGGAGUAAAGAUUGAGACAAGUAGGACUUCGGUCCGAAUACACUCAUGAACUCCC
[ reference std structure ]
.(((((......((((.......((((....)))).......))))...))))).
[ reference ext structure ]
((((((...((.((((...(.((((((....)))))))....)))).))))))))
[ predicted structure ]
((((((......((((....(((((((....))))...))).))))...))))))
2L1F_A
[ FASTA input ]
GGCGGACCCGUGGUGGAACAGACGUGUUCGGAACACCCGGCCGCAACCCUGGGAGACGUCCCAGG
[ reference std structure ]
.((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))...(((((((....)))))))
[ reference ext structure ]
.((((.()((.(((((((((....)))))....)))))).))))...(((((((....)))))))
( )
[ predicted structure ]
.............(((....(((((..........(((((........)))))..))))))))..
2L1F_B
[ FASTA input ]
GGCGGACCCGUGGUGGAACAGACGUGUUCGGAACACCCGGCCGCAACCCUGGGAGACGUCCCAGGG
[ reference std structure ]
.((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....))))))))
[ reference ext structure ]
.((((.()((.(((((((((....)))))....)))))).))))..((((((((....))))))))
( )
[ predicted structure ]
.((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....))))))))
2L2K_A
[ FASTA input ]
GGUAAGGUGGGUGGAAUCCUUCGGGAUCCCACCUACCCUGCC
[ reference std structure ]
((((.(((((((((.((((....)))).))))))))).))))
[ reference ext structure ]
((((((((((((((.(((((..))))).))))))))))))))
[ predicted structure ]
((((.(((((((((.((((....)))).))))))))).))))
2L3C_B
[ FASTA input ]
GGUAGUAUAACAAUAUCCGUGUUGUUAUAGUACC
[ reference std structure ]
((((.((((((((((....)))))))))).))))
[ reference ext structure ]
((((((((((((((((..))))))))))))))))
( )
[ predicted structure ]
((((.((((((((((....)))))))))).))))
2L3E_A
[ FASTA input ]
GGCUUUUGCUCCCCGUGCUUCGGCACGGAAAAGCC
[ reference std structure ]
(((((((......(((((....))))).)))))))
[ reference ext structure ]
(((((((......((((((..)))))).)))))))
[ predicted structure ]
(((((((.....((((((....)))))))))))))
2L3J_B
[ FASTA input ]
GGCAUUAAGGUGGGUGGAAUAGUAUAACAAUAUGCUAAAUGUUGUUAUAGUAUCCCACCUACCCUGAUGCC
[ reference std structure ]
(((((((.(((((((((.(((.(((((((((((.....))))))))))).))).))))))))).)))))))
[ reference ext structure ]
((((((((((((((((((((((((((((((((((...))))))))))))))))))))))))))))))))))
[ predicted structure ]
(((((((.(((((((((.(((.(((((((((((.....))))))))))).))).))))))))).)))))))
2L5Z_A
[ FASTA input ]
GAGCUGCAGCACGAAAGUGACGGCUC
[ reference std structure ]
((((((...(((....))).))))))
[ reference ext structure ]
(((((((.)((((..)))).))))))
( )
[ predicted structure ]
((((((...(((....))).))))))
2L94_A
[ FASTA input ]
GGGAAGAUCUGGCCUUCCCACAAGGGAAGGCCAGGGAAUCUUCCC
[ reference std structure ]
((((((((.((((((((((....))))))))))....))))))))
[ reference ext structure ]
((((((((((((((((((((..))))))))))))...))))))))
[ predicted structure ]
(((((((((((((((((((....)))))))))))...))))))))
2LA5_A
[ FASTA input ]
GCUGCGGUGUGGAAGGAGUGGCUGGGUUGCGCAGCG
[ reference std structure ]
(((((.((....................))))))).
[ reference ext structure ]
((((((<<).[(..{a.(.}A..]))..>>))))).
( )
( )
( )
( )
( )
( )
[ predicted structure ]
((((((.......................)))))).
2LBS_A
[ FASTA input ]
GGGAUACCAUGUUCAAGUGAACGUGGUAUCUC
[ reference std structure ]
((((((((((((((....))))))))))))))
[ reference ext structure ]
((((((((((((((....))))))))))))))
[ predicted structure ]
((((((((((((((....))))))))))))))
2LC8_A
[ FASTA input ]
GGUCAGGGUCAGGAGCCCCCCCCUGAACCCAGGAUAACCCUCAAAGUCGGGGGGCA
[ reference std structure ]
.(((.((((((((.[[[[[[[)))).))))..))).............]]]]]]].
[ reference ext structure ]
.((((((((((((({{{{{.[)))).))))).))).............])}}}}}.
( )
[ predicted structure ]
.....(((.......)))((((((((....(((.....))).....))))))))..
2LDL_A
[ FASTA input ]
GGAUCCAUUCGAUUAGUGAACGGAUCC
[ reference std structure ]
((((((.(((.......))).))))))
[ reference ext structure ]
((((((((((.......))))))))))
( )
[ predicted structure ]
((((((.(((.......))).))))))
2LDT_A
[ FASTA input ]
GGGGAGUACGGCCGCAAGGUUAAAACUCCCC
[ reference std structure ]
(((((((..((((....))))...)))))))
[ reference ext structure ]
((((((.(.(((((..))))).).).)))))
( )
( )
( )
[ predicted structure ]
(((((((.................)))))))
2LK3_A
[ FASTA input ]
GGCUUAGAUCAGAAAUGAUCAGCC
[ reference std structure ]
((((..(((((....)))))))))
[ reference ext structure ]
((((..((((((..))))))))))
[ predicted structure ]
((((..(((((....)))))))))
2LU0_A
[ FASTA input ]
GGAAUAUGCUCAACGAAAGUGAAUCAGCUUCGGCUGAGAGCUAAGUUCC
[ reference std structure ]
(((((..((((.((....))...(((((....)))))))))...)))))
[ reference ext structure ]
(((((..((((.((....))...(((((....)))))))))...)))))
[ predicted structure ]
.........................((((.........)))).......
2LUN_A
[ FASTA input ]
GGGCAGUGAUGCUUCGGCAUAUCAGCCC
[ reference std structure ]
((((.(...(((....)))...).))))
[ reference ext structure ]
((((.(.(((((....))))).).))))
[ predicted structure ]
((((..((((..........))))))))
2LV0_A
[ FASTA input ]
GGGCUAAUGUUGAAAAAUUAGCCC
[ reference std structure ]
(((((((..........)))))))
[ reference ext structure ]
(((((((.(......).)))))))
[ predicted structure ]
((((((((........))))))))
2M12_A
[ FASTA input ]
GGGUGUAUUGGAAAUGAGCACCC
[ reference std structure ]
((((((...........))))))
[ reference ext structure ]
((((((...........))))))
[ predicted structure ]
(((((.(((...)))...)))))
2M57_A
[ FASTA input ]
GGAGCCGUAUGCGGUAGUUCCGCACGUACGGAUCU
[ reference std structure ]
((..((((..((((.....))))....))))..))
[ reference ext structure ]
((..((((..((((.....))))....))))..))
[ predicted structure ]
.........(((((.....)))))...........
2M5U_A
[ FASTA input ]
GGCAGAUUCUGGUGAAUCUGCC
[ reference std structure ]
(((((((((....)))))))))
[ reference ext structure ]
(((((((((....)))))))))
( )
[ predicted structure ]
(((((((((....)))))))))
2M8K_A
[ FASTA input ]
GGUUUCUUUUUAGUGAUUUUUCCAAACCCCUUUGUGCAAAAAUCAUUA
[ reference std structure ]
(((((......[[[[[[[[[[[[))))).....].].]]]]]]]]]].
[ reference ext structure ]
((((([{<abcddddd......d))))).....D.].}>ABCDDDDD.
( )
( )
( )
( )
( )
( )
[ predicted structure ]
..........(((((((((((.((((....))))...)))))))))))
2MF0_G
[ FASTA input ]
UGUCGACGGAUAGACACAGCCAUCAAGGACGAUGGUCAGGACAUCGCAGGAAGCGAUUCAUCAGGACGAUGA
[ reference std structure ]
((((........))))..((((((......)))))).......((((.....))))..(((.......))).
[ reference ext structure ]
((((........))))..((((((......)))))).......((((.....))))..((((.....)))).
[ predicted structure ]
((((........)))).............(((((.......)))))...........(((((.....)))))
2MFC_D
[ FASTA input ]
GGGUGUCGACGGAUAGACACCC
[ reference std structure ]
(((((((........)))))))
[ reference ext structure ]
(((((((...()...)))))))
[ predicted structure ]
(((((((........)))))))
2MFE_D
[ FASTA input ]
GGGCCAUCAAGGACGAUGGUCC
[ reference std structure ]
((((((((......))))))))
[ reference ext structure ]
((((((((......))))))))
[ predicted structure ]
((((((((......))))))))
2MFF_B
[ FASTA input ]
GGGAUCGCAGGAAGCGAUCCC
[ reference std structure ]
((((((((.....))))))))
[ reference ext structure ]
((((((((.....))))))))
[ predicted structure ]
((((((((.....))))))))
2MFG_B
[ FASTA input ]
GGGUCAUCAGGACGAUGACCC
[ reference std structure ]
((((((((.....))))))))
[ reference ext structure ]
((((((((.....))))))))
[ predicted structure ]
((((((((.....))))))))
2MHI_A
[ FASTA input ]
GGAAACGCCGCGGUCAGCUCGGCUGCUGCGAAGAGUUCGUCUCUGUUGUUUCC
[ reference std structure ]
((((((((...((.((((...))))))..(...((.....)).)).)))))))
[ reference ext structure ]
((((((((..(((.((((...))))))).(..(((.....))))).)))))))
[ predicted structure ]
....(((.(((((.((((...))))))))).......))).............
2MI0_B
[ FASTA input ]
GCGGCAGUUGACUACUGUCGC
[ reference std structure ]
(((((((.......)))))))
[ reference ext structure ]
(((((((.......)))))))
[ predicted structure ]
((((((((.....))))))))
2MI0_A
[ FASTA input ]
GAGCAGCAUCGUCGGCUGCUCA
[ reference std structure ]
((((((.........)))))).
[ reference ext structure ]
((((((.........)))))).
[ predicted structure ]
(((((((.......))))))).
2MIY_A
[ FASTA input ]
GCUUGGUGCUUAGCUUCUUUCACCAAGCAUAUUACACGCGGAUAACCGCCAAAGGAGAA
[ reference std structure ]
((((((((.....[[[[[[.)))))))).........(((......)))..]]]]]]..
[ reference ext structure ]
((((((((.[{..<<<<...)))))))).........(((......)))..]}>>>>..
( )
( )
[ predicted structure ]
((((((((............)))))))).........((((....))))..........
2MQT_A
[ FASTA input ]
GGGCGAGGGUCUCCUCUGAGUGAUUGACUACCCGUCAGCGGGGGUCUUUCAUUUGGGGGCUCGUGCCC
[ reference std structure ]
(((((.((((((((.....((((..((((.((((....))))))))..))))..)))))))).)))))
[ reference ext structure ]
(((((.((((((((.....((((((((((.(((((..)))))))))))))))..)))))))).)))))
( )
[ predicted structure ]
....(((((...((((((......((((.....)))).)))))).)))))......((((....))))
2MS1_B
[ FASTA input ]
GGCUCGUUGGUCUAGGGGUAUGAUUCUCGCUUAGGGUGCGAGAGGUCCCGGGUUCAAAUCCCGGACGAGCC
[ reference std structure ]
(((((....((...........))((((((.......)))))).....((((.......))))...)))))
[ reference ext structure ]
(((((....((((.[.....))))((((((.......))))))...]((((((...)..)))))..)))))
( )
[ predicted structure ]
(((((((.................((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))
2MXL_A
[ FASTA input ]
GGAUUUGCAGGCCUACCAGAAACGGAUGGGAGUGCAGAU
[ reference std structure ]
..(((((((..((((((......)).))))..)))))))
[ reference ext structure ]
..(((((((.(((((((.(..).)).))))).)))))))
()
( )
[ predicted structure ]
..(((((((..((((...........))))..)))))))
2N2O_A
[ FASTA input ]
GCAUGUUUUCUGUGAAAACGGUU
[ reference std structure ]
....((((((...))))))....
[ reference ext structure ]
....((((((...))))))....
[ predicted structure ]
.........((((....))))..
2N2P_A
[ FASTA input ]
GCAUGUUUAGUGUCUAAACGGUU
[ reference std structure ]
....((((((...))))))....
[ reference ext structure ]
....((((((...))))))....
[ predicted structure ]
....((((((...))))))....
2N4L_A
[ FASTA input ]
GGAAUAUUUUUGCUGUACUUUCUAUAGUGAAUAGAGUUAGGCAGGGAUAUUCC
[ reference std structure ]
(((((((((((((((.(((..((((.....)))))))).))))))))))))))
[ reference ext structure ]
(((((((((((((((.(((..((((.....)))))))).))))))))))))))
( )
[ predicted structure ]
(((((((((((((...(((((...........)))))...)))))))))))))
2N6Q_A
[ FASTA input ]
AACCUUCACCAAUUAGGUUCAAAUAAGUGGU
[ reference std structure ]
((((..[{{{{.{{{))))....}}}]}}}}
[ reference ext structure ]
((((.[{<<<<..<<))))....>>]}>>>>
( )
( )
( )
( )
[ predicted structure ]
(((((.........)))))............
2N7M_X
[ FASTA input ]
GGCCUUAUGCACGGGAAAUACGCAUAUCAGUGAGGAUUCGUCCGAGAUUGUGUUUUUGCUGGUGUAAAUCAGCAGUUCCCCUGCAUAAGGCU
[ reference std structure ]
(((((((((((.((((...(.(((...(.................)..))).)...((((((......))))))..)))).)))))))))))
[ reference ext structure ]
(((((((((((.(((((..(((((.(.(.....(((....)))..).))))))...(((((((....))))))).))))).)))))))))))
[ predicted structure ]
.((((((((((.(((((......(((((((((((((................)))))))))))))..........))))).)))))))))).
2N8V_X
[ FASTA input ]
GGAACAGCUGUACUGGGCAGUUACAGCAGUCGUAUGGUAACACAUGCGGCGUUCCGAAAUACCAUGCCUG
[ reference std structure ]
.((((..((((((.[[[.[).)))))...(((((((......))))))).))))..........].]]].
[ reference ext structure ]
(((((.(((((((.[[[[[).)))))).((((((((......))))))))))))).........]]]]].
( )
[ predicted structure ]
(((((.((((((.......(((((............)))))...)))))))))))...............
2RP0_A
[ FASTA input ]
UCCGGUCGACUCCGGAGAAACAAAGUC
[ reference std structure ]
(((((..[.[.)))))........].]
[ reference ext structure ]
((([{<a(....])))......}>A.)
( )
( )
( )
( )
[ predicted structure ]
(((((......)))))...........
2RPT_A
[ FASTA input ]
GGCCCGCCGAAAGGCCGGCC
[ reference std structure ]
((((.(((....))).))))
[ reference ext structure ]
((((.(((....))).))))
[ predicted structure ]
.....((((......)))).
2RRC_A
[ FASTA input ]
GGACCCACCACGGCGAGGUCCA
[ reference std structure ]
((((((.(....).).))))).
[ reference ext structure ]
(((((((((..)))).))))).
()
[ predicted structure ]
(((((...........))))).
2WRQ_Y
[ FASTA input ]
GCUGAUAUAGCUCAGUUGGUAGAGCGCACCCUUGGUGAGGGUGAGGUCGGCAGUUCGAAUCUGCCUAUCAGCACCA
[ reference std structure ]
.((...(..(..............)..((((.......)))).......(.............).)...)).....
[ reference ext structure ]
.((.(.({<(...}....(..(>.)..((((.......))))...)...[...[.).].....].)..))).....
( )
( )
[ predicted structure ]
(((((((..((((........)))).((((((.....)))))).....(((((.......))))))))))))....
2WW9_D
[ FASTA input ]
AGAACGCAGCGAAAUGCGAUACGUAAUGUGAAUUGCAGAAUUCCGUGAAUCAUCGAAUCUUUG
[ reference std structure ]
.((((............).....(.((....(((....)))..........))..)...))).
[ reference ext structure ]
(((({([<(.(.)..].}..)>((((((...(((..).))).......)..)).)).).))))
( )
( )
( )
( )
()
( )
()
[ predicted structure ]
....((((......)))).............................................
2WW9_F
[ FASTA input ]
CCACGUCAACAGCAGUUGGACGUGG
[ reference std structure ]
((((((...((.....)).))))))
[ reference ext structure ]
(((((((...(.....)).))))))
( )
( )
[ predicted structure ]
(((((((...........)))))))
2WW9_E
[ FASTA input ]
UGAAAAGAACUUUGAAAAGAGAGUGAAAAAGUAC
[ reference std structure ]
......(..((((....))))............)
[ reference ext structure ]
[(..])(.((((((..))))))({(..}.))..)
( )
( )
[ predicted structure ]
........(((((......)))))..........
2WWQ_V
[ FASTA input ]
CGGCACGUAGCGCAGCCUGGUAGCGCACCGUCAUGGGGUGUCGGGGGUCGGAGGUUCAAAUCCUCUCGUGCCGACCA
[ reference std structure ]
(((((((..((((.........)))).(((.(.......).))).....((.((.......)).)))))))))....
[ reference ext structure ]
((((((((.[[[[)(.......]]].((((.((....).).))))]..)((.(((...)..)).)))))))))....
( )
( )
( )
( )
[ predicted structure ]
(((((((..((((.........))))(((................)))..((((.......)))).)))))))....
2XKV_B
[ FASTA input ]
CUCUGUUGGUUCUCUGUGCUCUGUGCUCUGUUUACCAGGUCAGGUCCGAAAGGAAGCAGCCAAGGCAGAGACGCAGAGCAGGCAGAUGUAGCUGGC
[ reference std structure ]
.........(....(....((.......(((......((.....((......)).....))...)))........).)......)....)......
[ reference ext structure ]
.........(...(((...(((.....((((......((....(((.(.)..)).)...))...))).).....)).).....)))...)......
( )
( )
( )
[ predicted structure ]
.((((......((((((((((((....((((((....................))))))......))))).)))))))....))))..........
2XQD_Y
[ FASTA input ]
AGGGGCGUAGUUCAAUUGGUAGAACACCGGUCUCCAAAACCGGGUGUUGGGAGUUCGAGUCUCUCCGCCCCUGCCA
[ reference std structure ]
((.((((..((((........))))((((((.......))))).)...(((((.......))))))))).))....
[ reference ext structure ]
((((((((({{.[)(......])}.(((((((.....))))))})..)(((((.......))))))))))))....
( )
( )
[ predicted structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
2Y8W_B
[ FASTA input ]
UCCCCACGCGUGUGGGGAUG
[ reference std structure ]
.((((((....))))))...
[ reference ext structure ]
.((((((....))))))...
[ predicted structure ]
(((((((....)))))))..
2Y9C_V
[ FASTA input ]
GCCGUGACGACUGAAAAGUCGGCAUUGGCAAUUUUUGACAGUCUCUAUGGGUAACCUAAGGAGACUGG
[ reference std structure ]
((..((.(((((....))))).))..).)..........(((((((..((....))...)))))))..
[ reference ext structure ]
(((.(((((((((..))))))))).)).)..........((((((((.(((..))))..)))))))..
( )
[ predicted structure ]
(((....(((((....))))).....))).........(((((((..((((...))))..))))))).
2YIE_Z
[ FASTA input ]
GAUUGAUUUGGUGAAAUUCCAAAACCGACAGUAGAGUCUGGAUGAGAGAAGAUUCG
[ reference std structure ]
......(((((.......))))).....(((......)))................
[ reference ext structure ]
....(.((((((...)..)))))..).(((((..)..))))...............
[ predicted structure ]
......(((((.......)))))..........((((((..........)))))).
2YIE_X
[ FASTA input ]
GAUCUUCGGGGCAGGGUGAAAUUCCCGACCGGUGGUAUAGUCCACGAAUCCAU
[ reference std structure ]
.............(((.......))).....((((......))))........
[ reference ext structure ]
.........(.(.((((...)..))))..).(((((..)..))))........
( )
[ predicted structure ]
.....(((((.............)))))...((((......))))........
2ZY6_A
[ FASTA input ]
GCCCGGAUAGUGUCCUUGGGAAACCGAGUCCGGGCACC
[ reference std structure ]
(((((((..(.(...........))...)))))))...
[ reference ext structure ]
((((((((((.(......).....))).)))))))...
( )
[ predicted structure ]
(((((((.......(((((....))))))))))))...
2ZZM_B
[ FASTA input ]
GCAGGGGUCGCCAAGCCUGGCCAAAGGCGCUGGGCCUAGGACCCAGUCCCGUAGGGGUUCCAGGGUUCAAAUCCCUGCCCCUGC
[ reference std structure ]
......(..(((.............)))((((((.......))))))(((....)))......((.......))...)......
[ reference ext structure ]
.(.(((((.[[[[){...<(.}a(]]]](((((((.....)))))))((((..))))A)...((((>).)..)))..))).).)
( )
( )
[ predicted structure ]
((((((((((((.............)))).((((((..((((((..........))))))...)))))).))))))))......
2ZZN_D
[ FASTA input ]
GCCGGGGUAGUCUAGGGGCUAGGCAGCGGACUGCAGAUCCGCCUUACGUGGGUUCAAAUCCCACCCCCGGC
[ reference std structure ]
(((((((..((([....(..]))).(((((.......))))).....(((((..)....))))))))))))
[ reference ext structure ]
((((((((.[[[[)<.{(..]]]].((((((.....))))))....>((((((}).)..))))))))))))
[ predicted structure ]
(((((((..((((((...)))))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))
3A2K_C
[ FASTA input ]
GGACCUUUAGCUCAGUUGGUUAGAGCAGACGGCUCAUAACCGUCCGGCCGUAGGUUCGAGUCCUACAAGGUCCACCA
[ reference std structure ]
(((((((..((([.....(...]))).(((((.......))))).....(((((..)....))))))))))))....
[ reference ext structure ]
((((((((.{{{)a...[(..A(}}}.(((((.......)))))..).(<<<<<(]).)).>>>>>)))))))....
( )
[ predicted structure ]
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
3A3A_A
[ FASTA input ]
GCCCGGAUGAUCCUCAGUGGUCUGGGGUGCAGGCUUCAAACCUGUAGCUGUCUAGCGACAGAGUGGUUCAAUUCCACCUUUCGGGC
[ reference std structure ]
(((((((.(..((((([..(.])))))((((((.......)))))).(((((....))))).((((..)....))))).)))))))
[ reference ext structure ]
(((((((((..(((((({[{.))))))(((((((..)...))))))((((((....))))))(((((]}.)}.)))))))))))))
()
[ predicted structure ]
.((((((.............)))))).((((((.......)))))).(((((....))))).((((.......)))).........
3ADB_C
[ FASTA input ]
GGCCGCCGCCACCGGGGUGGUCCCCGGGCCGGACUUCAGAUCCGGCGCGCCCCGAGUGGGGCGCGGGGUUCAAUUCCCCGCGGCGGCCGCCA
[ reference std structure ]
(((((((((..((((([..(.])))))((((((.......))))))(((((((....)))))))((((..)....)))))))))))))....
[ reference ext structure ]
(((((((((..(((((([[()))))))(((((((.....)))))))(((((((....)))))))(((((]..)].)))))))))))))....
( )
[ predicted structure ]
(((((((((....(((((...(((((.((((((.......)))))).(((.....))).....)))))....)))))..)))))))))....
3AKZ_H
[ FASTA input ]
UGGGAGGUCGUCUAACGGUAGGACGGCGGACUCUGGAUCCGCUGGUGGAGGUUCGAGUCCUCCCCUCCCAGCCA
[ reference std structure ]
.((((((..((((.......)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))).....
[ reference ext structure ]
((((((((.[[[[)(.....]]]].((((((.....))))))...)((((((...)..))))))))))))....
( )
( )
( )
[ predicted structure ]
(((((((.(((...)))...((((((((((.......)))))))..(((........)))))))))))))....
3AM1_B
[ FASTA input ]
GGCGCGGGGUACCGGGCUUGGUAGCCCGGGGCUUCGGCCGAGGGCGAGAGCCCUCGGGGUUCGAUUCCCCCCCUGCGCCGC
[ reference std structure ]
(((((((((..(((((((....)))))))(((....)))((((((....))))))((((.......)))))))))))))..
[ reference ext structure ]
(((((((((..((((((([[())))))))(((....)))(((((((..)))))))(((((]..)].)))))))))))))..
( )
[ predicted structure ]
(((((((((((((......))))....((((..(((.((((((((....))))))))....)))..)))))))))))))..
3AMU_B
[ FASTA input ]
GGGCCCGUAGCUUAGCCAGGUCAGAGCGCCCGGCUCAUAACCGGGCGGUCGAGGGUUCGAAUCCCUCCGGGCCCACCA
[ reference std structure ]
(((((.(..((((..........)))).((((.........)))).....(((((.......)))))).)))))....
[ reference ext structure ]
((((((((({{.[)<....(...])}}.((((.........))))....>((((((.).)..))))))))))))....
( )
( )
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[ predicted structure ]
.(((..........))).(((.....(((((((.......))))))).....(((((((........)))))))))).
3DW4_A
[ FASTA input ]
UGCUCCUAGUACGAGAGGACCGGAGUG
[ reference std structure ]
.(((((.....(....)....))))).
[ reference ext structure ]
.(((((..()(((..)))...))))).
( )
[ predicted structure ]
...((((........))))........
3GCA_A
[ FASTA input ]
CUGGGUCGCAGUAACCCCAGUUAACAAAACAAG
[ reference std structure ]
(((((...[.[....))))).........]..]
[ reference ext structure ]
((((<((({{)....>)))).......)..)}}
( )
()
( )
( )
( )
( )
( )
[ predicted structure ]
(((((..........))))).............
3GX2_A
[ FASTA input ]
GGCUUAUCAAGAGAGGUGGAGGGACUGGCCCGACGAAACCCGGCAACCAGAAAUGGUGCCAAUUCCUGCAGCGGAAACGUUGAAAGAUGAGCCG
[ reference std structure ]
((((((((......(((...(((...[[)))......))).(((..(((....))).)))...(]]..(((((....)))))..))))))))).
[ reference ext structure ]
((((((((..({(.((((.((((.<<<<.))...).)))))(})..((((..))))...).).(>>>>((((((..))))))..))))))))).
( )
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( )
( )
( )
[ predicted structure ]
((((((((...........(((((((((...........))))..((((....)))).....))))).(((((....)))))...)))))))).
3HAY_E
[ FASTA input ]
GGCUGCCUGGGUCCGCCUUGAGUGCCCGGGUGAGAAGCAUGAUCCCGGGUAAUUAUGGCGGACCCACA
[ reference std structure ]
........(((((((.(.......((((((.............)))))).......).)))))))...
[ reference ext structure ]
........(((((((((.......(((((((((.......))))))))).......)))))))))...
[ predicted structure ]
.......((((((((((.(((.((((((((.............)))))))).))).))))))))))..
3HJW_D
[ FASTA input ]
GGGCCACGGAAACCGCGCGCGGUGAUCAAUGAGCCGCGUUCGCUCCCGUGGCCCACAA
[ reference std structure ]
(((((((((.......(((((((.........)))))))......)))))))))....
[ reference ext structure ]
(((((((((.......(((((((((.....)))))))))......)))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((((.....((((((((...........)))))..)))..)))))))))....
3IAB_R
[ FASTA input ]
GGACUCAGUAAUAUGCUUUGGAAACGAAGCUUACAAAAUGGAGUCC
[ reference std structure ]
((((((........((((((....))))))..........))))))
[ reference ext structure ]
((((((...(..).(((((((..)))))))..........))))))
[ predicted structure ]
((((((.((((...((((((....))))))))))......))))))
3ID5_D
[ FASTA input ]
GGGGCGCCCUCUGAGCGUUCGCGCUGUGAUGA
[ reference std structure ]
..........(...(((....)))......).
[ reference ext structure ]
..........(((((((....)))...)))).
( )
( )
[ predicted structure ]
.((((((.......))))))............
3IVN_B
[ FASTA input ]
GGCCAGUAUAACCUCAAUGAUAUGGUUUGAGGGUGUCUACCAGGAACCGUAAAAUCCUGACUACUGGUC
[ reference std structure ]
(((((((({..((((((......[[.))))))(.....})(((((.]]......)))))..))))))))
[ reference ext structure ]
(((((((([(.(((((((.{{..{{)))))))).(...].(((((.}}().}}.))))).)))))))))
( )
( )
( )
[ predicted structure ]
((((((((...((((((.........))))))........(((((.........)))))..))))))))
3IWN_A
[ FASTA input ]
CACGCACAGGGCAAACCAUUCGAAAGAGUGGGACGCAAAGCCUCCGGCCUAAACGGCAUUGCACUCCGCCGUAGGUAGCGGGGUUACCGAUGG
[ reference std structure ]
((((......([...((((((....))))))..(])...(((.((((((((..((((..........))))))))).)))))))...)).)).
[ reference ext structure ]
((((......({...(((((((..)))))))..(}).(.(((.([[(((((..((((..........)))))))))))]].))))..)).)).
( )
( )
( )
[ predicted structure ]
.............((((....................................(((.........)))(((.......)))))))........
3J0L_8
[ FASTA input ]
GACCGUCGUGAGACAGGUUA
[ reference std structure ]
(((((((....))).)))).
[ reference ext structure ]
((((((((..)))).)))).
[ predicted structure ]
.((((((....))).)))..
3J0L_7
[ FASTA input ]
GCUUGUGGCAGUCAAGCGUUCAUAGCGACAUUGCUUUUUGAUUCUUCGAU
[ reference std structure ]
(.(.(.((((.(...((.......))...).))))...)).)........
[ reference ext structure ]
(((.((((((.(.(((((.....)))))..)))))..)))))........
( )
( )
[ predicted structure ]
(((((.......))))).................................
3J0L_1
[ FASTA input ]
GAAUGAUUAGAGGUUCCGGGGUCGAAAUGACCUUGACCUAUUCUCAAACU
[ reference std structure ]
....((..(.(((.(.(.(.(((.....))).).))))).)..)).....
[ reference ext structure ]
.((((((((.(((.(.(.(((((.....))))).))))).))))))..))
( )
[ predicted structure ]
..........((((..(((((((.....)))))))))))...........
3J0L_g
[ FASTA input ]
GAACCUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGG
[ reference std structure ]
.................((........))..
[ reference ext structure ]
......(.........[[[......).]].]
[ predicted structure ]
....................(((.....)))
3J0L_a
[ FASTA input ]
GGAGGGCAAGUCAUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAAUA
[ reference std structure ]
.((((....[.[.[[[.....[[..))]].......]]]]])).....
[ reference ext structure ]
(([[[.())(.(.((((...(((..]])))...)..)))))].)....
( )
[ predicted structure ]
....((((........))))............................
3J16_L
[ FASTA input ]
UCCGUGAUAGUUUAAUGGUCAGAAUGGGCGCUUGUCGCGUGCCAGAUCGGGGUUCAAUUCCCCGUCGCGGAGCCA
[ reference std structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ reference ext structure ]
(((((((((<<.[)({.{...])>>((((((.(..)..))))))..)((((((}..)}.))))))))))))....
( )
( )
[ predicted structure ]
.((((.........))))........(((......((((........(((((.......))))).))))..))).
3J20_0
[ FASTA input ]
GCCGCCGUAGCUUAGCUGGUGGAGCGCCGGACUGUUAAUCCGGCGGUCCCCGGUUCGAAUCCGGGCGGCGGCGCCA
[ reference std structure ]
(((((((..((([.....(..]))).(((((.......))))).....((.((..)....)).)))))))))....
[ reference ext structure ]
((((((((.{{{{)<..[(..}}}}.((((((.....))))))....>((((((]).)..))))))))))))....
( )
( )
( )
[ predicted structure ]
(((((((.................(((((((.......)))))))...(((((.......))))))))))))....
3J3D_C
[ FASTA input ]
AGCAGAGUGGCGCAGCGGAAGCGUGCUGGGCCCAUAACCCAGAGGUCGAUGGAUCGAAACCAUCCUCUGCUACCA
[ reference std structure ]
(((((((..(([.....(...])).(((((.......))))).......(((..)....)))..)))))))....
[ reference ext structure ]
((((((((({{..)(<a<..()}}((((((.......)))))).).)(((((A.>..>.))))))))))))....
( )
[ predicted structure ]
(((((((.(((..............(((((.......)))))..)))(((((.......))))))))))))....
3J45_4
[ FASTA input ]
CGGUGCCGGAAGGUUAAUUGAUGGGGUUAGCGCAAGCGAAGCUCUUGAUCGAAGCCCCGGU
[ reference std structure ]
....(((((..(((........(((((..((....))...)))))........))))))))
( )
[ reference ext structure ]
....(((((..(((...(((((((((((((((..))))).))))))))))...))))))))
( )
[ predicted structure ]
......................((((((....((((.......)))).....))))))...
3J46_p
[ FASTA input ]
GCGGGAAUAGCUCAGUUGGUAGAGCACGACCUUGCCAAGGUCGGGGUCGCGAGUUCGAGUCUCGUUUCCCGCUCCA
[ reference std structure ]
(((((((...((..........)).....(.........)........((((.........)))))))))))....
[ reference ext structure ]
((((((((.[[[..{.<...)<]]](((.((.......)).))).>.}aaaaaa..>A..AAAAA)))))))....
( )
( )
[ predicted structure ]
(((((((..((((........))))((((.(((((.............)))))........)))))))))))....
3J46_1
[ FASTA input ]
AAGGACGUGCUAAUCUGCGAUAAGCGUCGGUAAGGUGAUAUGAACCGUUAUAACCGGCGAUUU
[ reference std structure ]
....((((.[..[[[.))).....{{{{{{...{{{]]]..].}}}.......}}}}}}...)
[ reference ext structure ]
....(((([{..{{.{)))...}<<<<<<<<<<<<<]}}..}.>>>>....>>>>>>>>>..)
( )
( )
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( )
[ predicted structure ]
........................(((((((..(((.......)))......)))))))....
3J46_2
[ FASTA input ]
AAGGGUUCCUGUCCAACGUUAAUCGGGGCAGGGUGA
[ reference std structure ]
.......((((((...((.....)).))))))....
[ reference ext structure ]
.....(.(((((((...(.....)).)))))).)..
( )
( )
[ predicted structure ]
.......(((((((...........)))))))....
3J5B_1
[ FASTA input ]
GGGUGAUUAGCUCAGCUGGGAGAGCACCUCCCUUACAAGGAGGGGGUCGGCGGUUCGAUCCCGUCAUCACCCACCA
[ reference std structure ]
(((((.(..((((........))))...(((.......))).......(((((.......)))))).)))))....
[ reference ext structure ]
(((((((([{{.{)<..ab..}]}}((((((.......))))))...>ccccccAB.C..CCCCC)))))))....
( )
( )
[ predicted structure ]
(((((((..((((........))))((((((..........)))))).(((((.......))))))))))))....
3J5N_W
[ FASTA input ]
GGCUACGUAGCUCAGUUGGUUAGAGCACAUCACUCAUAAUGAUGGGGUCACAGGUUCGAAUCCCGUCGUAGCCACCA
[ reference std structure ]
(((((((..(((...........))).(((((.......)))))......(.((.......)).).)))))))....
[ reference ext structure ]
(((((((([{{..)<..ab...b]}}((((((.......)))))).B.>cc.cccAB.C..CC.CC)))))))....
( )
( )
[ predicted structure ]
.........((((.........))))............((((((((((...........))))))))))........
3J7A_7
[ FASTA input ]
GGGUAAUUGGCGCAGUUGGUUAGCGCGCGGGUCUCAUAAUCCCGAGGUCGUGAGUUCGAUCCUCACAUUACCCA
[ reference std structure ]
.((......((...........))..(............)......(..(.........)..)....)).....
[ reference ext structure ]
(((.((.([{{..)..<...<]}}..(.(........).)...>..aa.aa>......AA.AA.))).))....
( )
( )
( )
[ predicted structure ]
(((((((..((((.........))))...((((((........))))))(((((.......)))))))))))).
3JB9_N
[ FASTA input ]
GAUCUUCGGAUCACUUUGGUCAAAUUGAAACGAUACAGAGAAGAUUAGCAUGGCCCCUGCACAAGGAUGACACUGCGACAUUGAGAGAAA
[ reference std structure ]
.(........)........................................(..((((.....)))..).)...................
[ reference ext structure ]
((((....))))...........................((.....))(.[[[.[(((.....))).)]]]]..................
[ predicted structure ]
.......................................................(((.....)))........................
3JYV_7
[ FASTA input ]
GCGGAUUUAGCUCAGUUGGGAGAGCGCCAGACUGAAGAUCUGGAGGUCCUGUGUUCGAUCCACAGAAUUCGCACCA
[ reference std structure ]
.((((((..((([.....(..]))).((((.........)))).....(((((..)....))))))))))).....
[ reference ext structure ]
(((((((((aa.{)(<.[<..})A.(((((((.....)))))))A..)((((((]>.)>.))))))))))))....
( )
( )
( )
[ predicted structure ]
..((((((...((((((((.......))).)))))........)))))).(((..(((..........))))))..
3KTW_C
[ FASTA input ]
AGAUAGUCGUGGGUUCCCUUUCUGGAGGGAGAGGGAAUUCCACGUUGACCGGGGGAACCGGCCAGGCCCGGAAGGGAGCAACCGUGCCCGGCUAUC
[ reference std structure ]
.(((....((..((((.((((((....)))))).))))...))......((((.....(((.....(((....))).....)))..))))...)))
[ reference ext structure ]
.((..((.(((<((((.((((([..{(]))))).))))(>))).)....(((((.(...((.(..(((....})))).)..))))))))))..).)
( )
( )
( )
( )
( )
( )
( )
( )
( )
( )
[ predicted structure ]
.((((((((...((((((((((((((............))))......((((.....))))........)))))))))).........))))))))
3LA5_A
[ FASTA input ]
GGCUUCAUAUAAUCCGAAUGAUAUGGUUUCGGAGCUUCCACCAAGAGCCUUAAACUCUUGACUAUGGAGUC
[ reference std structure ]
((((((((([..((((((......{{.))))))(.....])((((((}}.....))))))..)))))))))
[ reference ext structure ]
(((((((((((.(((((((.[[[.[[)))))))).....).((((((]]..]]]))))))..)))))))))
( )
( )
( )
( )
( )
[ predicted structure ]
(((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))))
3NKB_B
[ FASTA input ]
GGUCCGCAGCCUCCUCGCGGCGCAAGCUGGGCAACAUUCCGAAAGGUAAUGGCGAAUGCGGACC
[ reference std structure ]
(((((((((((.[[....))).......]]....((((((....)).)))).....))))))))
[ reference ext structure ]
(((((((((((({{..).))).......}..[}(.((((((..))).)))])....))))))))
( )
( )
( )
( )
[ predicted structure ]
(((((((((((.(((..(((..................)))..)))....)))...))))))))
3NMU_E
[ FASTA input ]
GCCGUUGAAGCUCUGACCGAAAGGCGUGAUGAGC
[ reference std structure ]
............(...((....))......)...
[ reference ext structure ]
............((((((....))...))))...
[ predicted structure ]
.........((((.................))))
3OVB_D
[ FASTA input ]
GGAAGUAGAUGGUUCAAGUCCAUUUACUUCCACCA
[ reference std structure ]
((((.(((((((.......))))))).))))....
[ reference ext structure ]
((((.(((((((.......))))))).))))....
[ predicted structure ]
((((((((((((.......))))))))))))....
3OVS_D
[ FASTA input ]
GGAAGUAGAUGGUUCAAGUCCAUUUACUUCCACC
[ reference std structure ]
((((((((((((.......))))))))))))...
[ reference ext structure ]
(((((((((((((...)..))))))))))))...
[ predicted structure ]
((((((((((((.......))))))))))))...
3P22_G
[ FASTA input ]
GCUGGGUUUUUCCUUCGAAAGAAGGUUUUUAUCCCAGUC
[ reference std structure ]
((((((.....(((((....))))).......)))))).
[ reference ext structure ]
((((((.....((((((..)))))).......)))))).
[ predicted structure ]
.(((((.....(((((....))))).......)))))..
3R4F_A
[ FASTA input ]
GGCGUGUAUGUGGGGAAACCCUGAUUGAGUUCAGCCCACAUACUUUGUUGAUGGUUGUCAAUCGCC
[ reference std structure ]
((((.((((((((.......((((......)))).))))))))...((((((....))))))))))
[ reference ext structure ]
((((((((((((((......(((((....)))))))))))))))..((((((....))))))))))
[ predicted structure ]
((((.(((((((((..(((.........)))...)))))))))....((((......)))).))))
3R9X_C
[ FASTA input ]
CAACCGUAGGGGAACCUGCGGUUGGAUCACCUCCU
[ reference std structure ]
(((((((.(......).)))))))...........
[ reference ext structure ]
(((((((.(.(...)).)))))))...........
( )
[ predicted structure ]
((((((((((....))))))))))...........
3RKF_A
[ FASTA input ]
GGCCAUAUAACUGCGUGGAUAUAGCACGCAGGUUUCUACCGGGCACUGUAAAUGUCCGACUAUGGUC
[ reference std structure ]
((((((([..(((((((.....{{)))))))(.....])((((((}}.....))))))..)))))))
[ reference ext structure ]
(((((((((.(((((((.[[[.[[)))))))).....).((((((]]()]]]))))))..)))))))
( )
( )
( )
( )
( )
( )
[ predicted structure ]
(((((((...(((((((.......)))))))........((((((.......))))))..)))))))
3SD1_A
[ FASTA input ]
GGAGAGUAGAUGAUUCGCGUUAAGUGUGUGUGAAUGGGAUGUCGUCACACAACGAAGCGAGAGCGCGGUGAAUCAUUGCAUCCGCUCCA
[ reference std structure ]
((((....((((((((((((......(((((((...[[[[....))))))).....((....))))).)))))))))..]]]].)))).
[ reference ext structure ]
((((((.({{{{{{{{{{{{..{{.{{{{{{{{.[.)((((].)}}}}}}}}.}}.(((..)))}}}.}}}}}}}}}.)))).))))).
( )
( )
( )
( )
( )
[ predicted structure ]
...............((((((.....(((((((...........)))))))..........))))))......................
3SIU_F
[ FASTA input ]
CUGUCCAAUGAGCGCAUAGUGAGGGCAG
[ reference std structure ]
((((((.....((.....))..))))))
[ reference ext structure ]
((((((...(((((..).))))))))))
[ predicted structure ]
((((((................))))))
3SN2_B
[ FASTA input ]
GAUUAUCGGAAGCAGUGCCUUCCAUAAUC
[ reference std structure ]
((((((.((((((...).)))))))))))
[ reference ext structure ]
((((((.((((((...).)))))))))))
[ predicted structure ]
((((((.(((((......)))))))))))
3TRZ_Z
[ FASTA input ]
GGGCAGGGAUUUUGCCCGGAG
[ reference std structure ]
(((((.......)))))....
[ reference ext structure ]
(((((.......)))))(.).
[ predicted structure ]
(((((.......)))))....
3TS0_U
[ FASTA input ]
GGGGUAGUGAUUUUACCCUGGAG
[ reference std structure ]
((((((.......))))))....
[ reference ext structure ]
((((((.......))))))....
[ predicted structure ]
.(((((.......))))).....
3TS2_V
[ FASTA input ]
GGGGUCUAUGAUACCACCCCGGAG
[ reference std structure ]
(((((..........)))))....
[ reference ext structure ]
(((((..........)))))....
[ predicted structure ]
(((((..........)))))....
3W3S_B
[ FASTA input ]
GGGAGAGGUUGGCCGGCUGGUGCCGCCCCGGGACUUCAAAUCCCGUGGGAGGUCCCGCAAGGGAGCUCCGGAGGGUUCGAUUCCCUCCCUCUCCCGCC
[ reference std structure ]
(((.((((..((.((([..(.])))))((((((.......))))).)((((.((((....)))).)))).(((((..)....))))))))).)))...
[ reference ext structure ]
(((.((((..((.(((([[()))))))((((((.......))))).)((((((((((..)))))))))).((((((]..)].))))))))).)))...
( )
( )
[ predicted structure ]
..........(((((((....))))...(((((((((...........)))))))))...(((((....((((((.......))))))..))))))))
3WC1_P
[ FASTA input ]
GCCAUCAUAGUAUAGUGGUCAUUAUAAAUCGUUGUGGCCGAUUAGACCCAAGUUCGAUUCUUGGUGAUGGCAC
[ reference std structure ]
.((((((..((............))..(..(.......)..).....(((((.......)))))))))))...
[ reference ext structure ]
.((((((.([[.(.({{<..)))]]..((.(..()...).)).....aaaaaa}>.A}.AAAAA))))))...
[ predicted structure ]
(((((((...((((((....))))))(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))..
3WQY_C
[ FASTA input ]
GGGCUCGUAGCUCAGCGGGAGAGCGCCGCCUUUGCGAGGCGGAGGCCGCGGGUUCAAAUCCCGCCGAGUCCACCA
[ reference std structure ]
(((((((..((((....[..)))).((((((.....)))))).....{{{{{..]....}}}}})))))))....
[ reference ext structure ]
(((((((([{{.{)<.ab..}]}}(((((((.....)))))))...>ccccccAB.C..CCCCC)))))))....
( )
( )
[ predicted structure ]
(((((((..((((.......)))).((((((.....)))))).....(((((.......))))))))))))....
4A4U_A
[ FASTA input ]
GGACCCGGCUGACGCUGGGUCC
[ reference std structure ]
(((((((((....)))))))))
[ reference ext structure ]
(((((((((....)))))))))
[ predicted structure ]
(((((((((....)))))))))
4AOB_A
[ FASTA input ]
GGCUUAUCAAGAGAGGGCAAGAGACUGGCUUGAUGACCCCCGGCAACCAAAAAUGGUGCCAAUUCCUGCAGAGGAAACGUUGAAAGAUGAGCCA
[ reference std structure ]
((((((((....(.(((...(((.[.[[)))......))))(((..(((....))).)))...(]].](((.(....).)))..))))))))).
[ reference ext structure ]
((((((((..({(.((((.((((.<<<..))...).)))))(})..((((..))))...)...()>>>((((((..))))))..))))))))).
( )
( )
( )
( )
( )
( )
( )
( )
[ predicted structure ]
((((((((......(((((((.......))))....)))..((((...........))))..(((((....))))).........)))))))).
4ATO_G
[ FASTA input ]
AAAUUGGUGUAACCUUACCGUAGUAGGUGCUAA
[ reference std structure ]
.....(((...[[[[.))).....]]]].....
[ reference ext structure ]
.....(((...[[[[[)))....]]]]].....
( )
()
[ predicted structure ]
...........((((.........)))).....
4BW0_A
[ FASTA input ]
GGGGGAGCCGAAAGGCGAAGAACCCA
[ reference std structure ]
(((...(((....)))......))).
[ reference ext structure ]
((((((((((..)))))...))))).
( )
[ predicted structure ]
..(((.(((....)))......))).
4BY9_A
[ FASTA input ]
GCGAGCAAUGAUGAGUGAUGGGCGAACUGAGCUCGAAAGAGCAAUGAUGAGUGAUGGGCGAACUGAGCUCGC
[ reference std structure ]
((((((....................(...((((....))))......).................))))))
[ reference ext structure ]
((((((...((((.............(((((((((..)))))...)))).............))))))))))
( )
[ predicted structure ]
.(((((.......(((.........)))..)))))......................((((.......))))
4BYQ_N
[ FASTA input ]
GUCGCGCCUGCGUAGGAUAGGUGGGAGCCUGUGAACCCCCGCCUCCGGGUGGGGGGGAGGCGCCGGUGAAAUACCACCCUGGCGCGG
[ reference std structure ]
.((.((((..(.....[..{{{.{..{{{......{..{.{.{...)}.}.}..}...}}}..........].}.}}}..)))).))
[ reference ext structure ]
.(((((((..(..(..[[){{{{{{.{{{...{{.{.{{{{.....)].}}}}.}.}}}}}.....(...)]}}}}}}..)))))))
( )
( )
( )
[ predicted structure ]
..((((((...........(((((..........(((..(((((((.........)))))))..)))......)))))..)))))).
4C4W_H
[ FASTA input ]
GAGCAAGAGCCAUUGCACUCCGGUUUGAUGACCUC
[ reference std structure ]
(((...(((((..........)))))......)))
[ reference ext structure ]
(((.(((((((..........))))))...).)))
( )
[ predicted structure ]
..((((......)))).....(((......)))..
4C7O_E
[ FASTA input ]
UGUUGGUUCUCCCGCAACGCGGAAGCGUGUGCCGGGAUGUAGCUGGCA
[ reference std structure ]
(((((((.((((((((((((....)))).))).)))).)..)))))))
[ reference ext structure ]
(((((((.(((((((((((((..))))).))).)))).)..)))))))
[ predicted structure ]
((((((((.(((((..(((((....)))))..)))))...))))))))
4CXG_a
[ FASTA input ]
ACAUCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAAUUACCCACUCCCGACCCGG
[ reference std structure ]
.(.((....)).)...........................(.....).
[ reference ext structure ]
((.(((..))).))..........(..)............(.....).
[ predicted structure ]
........(((..........................)))........
4CXG_2
[ FASTA input ]
UGGCUUGUGGCGGCCAAGCGUUCAUAGCGACGUCGCUUUUUGAUCCUUCG
[ reference std structure ]
.((.(.(.((((((...((.......))...))))))...)).).)....
[ reference ext structure ]
.((((.((((((((..(((.......)))..))))))..))))).)....
()
( )
[ predicted structure ]
..(((((.......)))))..(((.((((....))))...))).......
4CXG_Y
[ FASTA input ]
GCGGAUUUAGCUCAGUUGGGAGAGCGCCGGUCUCCAAAACCGGAGGUCCUGUGUUCGAUCCACAGAAUUCGCACCA
[ reference std structure ]
(((((((..((.(.....[..).)).(((((.......))))).....{{{{{..]....}}}}})))))))....
[ reference ext structure ]
(((((((([{{.{)<a.ab..}]}}.((((((.....))))))....>ccccccAB.CA.CCCCC)))))))....
( )
( )
[ predicted structure ]
(((((((..((((........))))...(((((((......)))))))(((((.......))))))))))))....
4ENB_A
[ FASTA input ]
GGCGAUGAGGCCCGCCCAAACUGCCCUGAAAAGGGCUGAUGGCCUCUACUG
[ reference std structure ]
((((..[[[[[[))))......(((((....)))))....]]]]]].....
[ reference ext structure ]
{((((.<<<<<<)).}...)..((((((..))))))).(.>>>>>>)....
( )
[ predicted structure ]
......((((((.((((...............))))....)))))).....
4ENC_A
[ FASTA input ]
GGGCGAUGAGGCCCGCCCAAACUGCCCUGAAAAGGGCUGAUGGCCUCUACUG
[ reference std structure ]
.((((..[[[[[[))))......(((((....)))))....]]]]]].....
[ reference ext structure ]
.{((((.<<<<<<)).}...)..((((((..))))))).(.>>>>>>)....
( )
[ predicted structure ]
.......((((((.((((...............))))....)))))).....
4HXH_A
[ FASTA input ]
CCAAAGGCUCUUUUCAGAGCCACCCA
[ reference std structure ]
.....((((((....)))))).....
[ reference ext structure ]
.....((((((....)))))).....
[ predicted structure ]
.....((((((....)))))).....
4JRC_A
[ FASTA input ]
GAACCCUCUCUUCCGAAGCGAGCCGGGGGCGGUGGGAGCCCGGUGAAGACGGUUCC
[ reference std structure ]
(((((...(((((.....(..[[[[[[..........)]]]]]]))))).))))).
[ reference ext structure ]
((((((...((((...[{(.]((((((.........})))))))))))).))))).
( )
( )
( )
( )
[ predicted structure ]
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4K27_U
[ FASTA input ]
GCCCCUGCCUGCCUGCAGCUAAGGAUGAAAGUCUAUGCUGCCUGCCUGCCUGGGC
[ reference std structure ]
((((..((..((..(((((...((((....))))..)))))..))..))..))))
[ reference ext structure ]
((((..((((((((((((((()(((((..)))))).)))))))))))))..))))
[ predicted structure ]
....((((......)))).........................(((......)))
4KR2_C
[ FASTA input ]
CGCCGCUGGUGUAGUGGUAUCAUGCAAGAUUCCCAUUCUUGCGACCCGGGUUCGAUUCCCGGGCGGCG
[ reference std structure ]
((((((..(((.....[...)))((((((.......))))))....{{{{..]....}}}}.))))))
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( )
( )
[ predicted structure ]
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4KR3_C
[ FASTA input ]
CGCCGCUGGUGUAGUGGUAUCAUGCAAGAUUCCCAUUCUUGCGACCCGGGUUCGAUUCCCGGGCGGCGC
[ reference std structure ]
((((((..(((.....[...)))((((((.......))))))...{{{{{..]....}}}}})))))).
( )
[ reference ext structure ]
(((((((.[[[[){<<a..]]]](((((((.....)))))))..}bbbbbb>A.B>.BBBBB)))))).
( )
( )
[ predicted structure ]
...(((((...............((((((.......))))))..((((((.......))))))))))).
4KR7_X
[ FASTA input ]
GCCCGGAUAGUGUCCUUGGGAAACCAAGUCCGGGCACCA
[ reference std structure ]
((((((((.......((((....))))))))))))....
[ reference ext structure ]
((((((((().(..)(((((..)))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((.......(((((....))))))))))))....
4KZE_R
[ FASTA input ]
GACGCGACCGAAAUGGUGAAGGACGGGUCCAGUGCGAAACACGCACUGUUGAGUAGAGUGUGAGCUCCGUAACUGGUCGCGUC
[ reference std structure ]
((((((((((..((((.(.....(...(((((((((.....)))))))..)).........)..).))))..).)))))))))
[ reference ext structure ]
(((((((((((((((((((.([.{)].(((((((((.(..))))))))..))(..{.).}.}.)))))))))).)))))))))
( )
( )
( )
( )
[ predicted structure ]
(((((((((....................(((((((.....)))))))........(((............))))))))))))
4L81_A
[ FASTA input ]
GGAUCACGAGGGGGAGACCCCGGCAACCUGGGACGGACACCCAAGGUGCUCACACCGGAGACGGUGGAUCCGGCCCGAGAGGGCAACGAAGUCCGU
[ reference std structure ]
(((((....((((....))))(((..((((((.[[[[..))).))).)))..(((((....)))))))))).((((....)))).......]]]].
[ reference ext structure ]
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( )
( )
( )
( )
( )
( )
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[ predicted structure ]
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4M4O_B
[ FASTA input ]
GGGUUCAUCAGGGCUAAAGAGUGCAGAGUUACUUAGUUCACUGCAGACUUGACGAACCC
[ reference std structure ]
((((((.(((((.((.......((((.(.(.[..)]..).)))))).))))).))))))
[ reference ext structure ]
(((((((((((((((..(...)((((.(.(.[..)]..).)))))))))))))))))))
( )
( )
[ predicted structure ]
((((((.(((((.........(((((..............)))))..))))).))))))
4M6D_L
[ FASTA input ]
GGCGGCUAAAGAGUGCAGAGUUACUUAGUUCACUGCAGACGCC
[ reference std structure ]
.(((..(.......((...(.(.[..)]..)...)))..))).
[ reference ext structure ]
.((((.(..(...)((...(.(.[..)]..)...))).)))).
( )
( )
( )
( )
[ predicted structure ]
((((.........(((((..............)))))..))))
4M6D_D
[ FASTA input ]
GGCGGCUAAAGAGUGCAGAGUUACUUAGUUCACUGCAGACGC
[ reference std structure ]
.(((.((.......((((...(.[..)]....)))))).)))
[ reference ext structure ]
.((((((...(..)((((.(.(.[..)]..).))))))))))
( )
( )
[ predicted structure ]
.............(((((..............))))).....
4M6D_F
[ FASTA input ]
GCGGCUAAAGAGUGCAGAGUUACUUAGUUCACUGCAGACGC
[ reference std structure ]
..(.((.......((((.(.(.[..)]..).)))))).)..
[ reference ext structure ]
.(((((..(...)((((.(.(.[..)]..).)))))))).)
( )
( )
[ predicted structure ]
............(((((..............))))).....
4MGN_C
[ FASTA input ]
GAAUCAAUAGUAGUUAACCCUCUCUUCCGAAGCGAGCCGGGGGCGGUGGGAGCCCGGUGAAGACGGUUAAUGAAACGGCAGUUCC
[ reference std structure ]
(((.........(((((((...(((((.....(..[[[[[[..........)]]]]]]))))).)))))))..........))).
[ reference ext structure ]
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( )
[ predicted structure ]
.............((((((...(((((.........(((((...........))))).))))).))))))...............
4MGN_D
[ FASTA input ]
CGGAAGUAGUUCAGUGGUAGAACACCACCUUGCCAAGGUGGGGGUCGCGGGUUCGAGUCCCGUCUUCCGCUC
[ reference std structure ]
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[ reference ext structure ]
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( )
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( )
[ predicted structure ]
.............(((((.....)))))......((((((((..(((......)))..))))))))......
4MGN_B
[ FASTA input ]
CGGAAGUAGUUCAGUGGUAGAACACCACCUUGCCAAGGUGGGGGUCGCGGGUUCGAGUCCCGUCUUCCGCU
[ reference std structure ]
((((((..((((....[..)))).(((((.......))))).....{{{{{..]....}}}}}))))))..
[ reference ext structure ]
((((((([{{.{)<.a().}]}}((((((.......))))))...>bbbbbbA..B..BBBBB))))))..
( )
( )
( )
[ predicted structure ]
.............(((((.....))))).........(((((((...((((.......)))).))))))).
4OO8_B
[ FASTA input ]
GGAAAUUAGGUGCGCUUGGCGUUUUAGAGCUAGAAAUAGCAAGUUAAAAUAAGGCUAGUCCGUUAUCAACUUGAAAAAGUGGCACCGAGUCGGUGCU
[ reference std structure ]
....................((((((..((((....))))....))))))..(((..).)).......((((....)))).((((((...)))))).
[ reference ext structure ]
....................((((((..(((((..)))))....)))))).((((..).)))......(((((..))))).((((((.())))))).
[ predicted structure ]
.................................................................................((((((...)))))).
4OOG_D
[ FASTA input ]
CAUGUCAUGUCAUGAGUCCAUGGCAUGGCAUGGC
[ reference std structure ]
((((((((((((((....))))))))))))))..
[ reference ext structure ]
((((((((((((((....))))))))))))))..
[ predicted structure ]
((((((((((((((....))))))))))))))..
4OQU_A
[ FASTA input ]
GGAUCACGAGGGGGAGACCCCGGCAACCUGGGACGGACACCCAAGGUGCUCACACCGGAGACGGUGGAUCCGGCCCGAGAGGGCAACGAAGGUCCGA
[ reference std structure ]
(((((....((((....))))(((..((((((.[[[[[.))).))).)))..(((((....)))))))))).((((....)))).......]]]]].
[ reference ext structure ]
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( )
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[ predicted structure ]
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4P5J_A
[ FASTA input ]
AGCUCGCCAGUUAGCGAGGUCUGUCUCGACACGACAGAUAAUCGGGUGCAACUCCCGCCCCUCUUCCGAGGGUCAUCGGAACC
[ reference std structure ]
.((((((..[...)))))(((((((.......)))))))...{{{{..]....}}}}(((...{{{{{{))).).}}}}}}..
[ reference ext structure ]
.(((((([[()..)))))(((((((.......)))))))...{{{{{]..}].}}}}(((..{{{{{{{))).).}}}}}}.}
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[ predicted structure ]
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4PDB_I
[ FASTA input ]
GGGAUGCUCAGUGAUCCUUCGGGAUAUCAGGGCAUCCC
[ reference std structure ]
(((((((((...(((((....)))..)).)))))))))
[ reference ext structure ]
((((((((((.([)((((..))))...]))))))))))
( )
( )
[ predicted structure ]
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4PJO_4
[ FASTA input ]
GACUUACCUGGCAGUGAGGUGCACACACUGCAUAAUUUGUGGUAGUGG
[ reference std structure ]
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[ reference ext structure ]
..........(((((((.......))))))).................
[ predicted structure ]
.....((((.......))))...(((((((((.....)))))).))).
4PJO_2
[ FASTA input ]
GACUUACCUGGCAGUGAGGUGCACACACUGCAUAAUUUGUGGUAGUG
[ reference std structure ]
..........((((((.........))))))................
[ reference ext structure ]
..........(((((((.......)))))))................
[ predicted structure ]
....((((..((((((.........)))))).........))))...
4PKD_V
[ FASTA input ]
GAUCCAUUGCACUCCGGAUCCAGGAGAUACCAUGAUCACGAAGGUGGUUUUCCU
[ reference std structure ]
(((((..........))))).((((((..((((..........)))).))))))
[ reference ext structure ]
(((((..........))))).(((((((.((((.(()....).)))))))))))
[ predicted structure ]
(((((..........))))).((((((.((((............))))))))))
4PLX_A
[ FASTA input ]
GAAGGUUUUUCUUUUCCUGAGGCGAAAGUCUCAGGUUUUGCUUUUUGGCCUUUCUUAAAAAAAAAAAAAGCAAA
[ reference std structure ]
(((((..........((((((((....)))))))).[[[[[[[[[[..)))))...........]]]]]]]]]]
[ reference ext structure ]
((((([{<abcdef.(((((((((..)))))))))....f........)))))...........]}>ABCFDEF
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[ predicted structure ]
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4QJD_B
[ FASTA input ]
GUAAAUGAUAUAGCCGGUCCCAAGCCCGGAAAAAGGAGGAGGGUAUA
[ reference std structure ]
.............((((.[[[....))))...........]]]....
[ reference ext structure ]
.............((((([[[[)[.))))....].....]]]]....
[ predicted structure ]
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4QJD_F
[ FASTA input ]
UAAAUGAUAUAGCCGGUCCCAAGCCCGGAAAAAGGAGGAGGGUAUA
[ reference std structure ]
............((((.[[[....))))...........]]]....
[ reference ext structure ]
............((((([[[[)[.))))....].....]]]]....
[ predicted structure ]
.......((((.((((........))))..............))))
4QJD_D
[ FASTA input ]
UAAAUGAUAUAGCCGGUCCCAAGCCCGGAAAAAGGAGGAGGGUAUA
[ reference std structure ]
............((((.[[[....))))...........]]]....
[ reference ext structure ]
............((((([[[[)[.))))....].....]]]]....
[ predicted structure ]
............((((........))))..................
4QJH_D
[ FASTA input ]
GCAAUAAAGCGGUUACAAGCCCGCAAAAAUAGCAGAGUAAUGUCGCG
[ reference std structure ]
........(((..[[......))).............]]........
[ reference ext structure ]
........(((((()[[)..))))...........]]........()
( )
( )
[ predicted structure ]
........((((........)))).......................
4QJH_F
[ FASTA input ]
GCAAUAAAGCGGUUACAAGCCCGCAAAAAUAGCAGAGUAAUGUCGCG
[ reference std structure ]
.........(((.[[[....))).............]]]........
[ reference ext structure ]
........((((([[[[)[.)))).(.)]......]]]]........
( )
[ predicted structure ]
........((((........)))).......................
4QJH_B
[ FASTA input ]
GCAAUAAAGCGGUUACAAGCCCGCAAAAAUAGCAGAGUAAUGUCGCG
[ reference std structure ]
.........(((..[[....))).............]].........
[ reference ext structure ]
.........(((.[[[[)[..)).....]......]]]]........
( )
( )
( )
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[ predicted structure ]
........((((........)))).......................
4RMO_P
[ FASTA input ]
AAGUUUACCACUGACCGAUAUGUGGUAUAUAAAUGGUCGGGUUG
[ reference std structure ]
......(((((...[[[[[..))))).........]]]]]....
[ reference ext structure ]
......((((((.[[[[[[).))))).........]]]]]]...
( )
[ predicted structure ]
.....((((((..........)))))).................
4TUW_C
[ FASTA input ]
GGCCAAAGGCCCUUUUCAGGGCCACCC
[ reference std structure ]
.......((((((....))))))....
[ reference ext structure ]
.......((((((....))))))....
[ predicted structure ]
.......((((((....))))))....
4TUX_D
[ FASTA input ]
GGCCAAAGGCCCUUUUCAGGGCCACC
[ reference std structure ]
.......((((((....))))))...
[ reference ext structure ]
.......((((((....))))))...
[ predicted structure ]
.......((((((....))))))...
4TVX_L
[ FASTA input ]
AUAAACCGACGGUAUUGUUCAGAUCCUGGCUUGCCAACAGGAGUUCCCCGCGCCAGCGGG
[ reference std structure ]
..............................................(((((....)))))
[ reference ext structure ]
..............................................((((((..))))))
[ predicted structure ]
...(((..........)))....(((((.........)))))....(((((....)))))
4TZY_X
[ FASTA input ]
GGGAAGAUAUAAUCCUAAUGAUAUGGUUUGGGAGUUUCUACCAAGAGCCUUAAACUCUUGAUUAUCUUCCC
[ reference std structure ]
((((((((((..((((((......[[.))))))[.....)]{{{{{{]].....}}}}}}..)))))))))
[ reference ext structure ]
(((((((((((.(((((((.[[..[[)))))))).....).{{{{{{]]...]]}}}}}}..)))))))))
( )
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[ predicted structure ]
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4U7U_X
[ FASTA input ]
AUAAACCGGGCUCCCUGUCGGUUGUAAUUGAUAAUGUUGAGAGUUCCCCGCGCCAGCGGGG
[ reference std structure ]
.............................................((((((....))))))
[ reference ext structure ]
.............................................(((((((..)))))))
[ predicted structure ]
...(((((..........)))))......................((((((....))))))
4UN5_A
[ FASTA input ]
AUAACUCAAUUUGUAAAAAAGUUUUAGAGCUAGAAAUAGCAAGUUAAAAUAAGGCUAGUCCGUUAUCAACUUGAAAAAGUG
[ reference std structure ]
....................((((((..((((....))))....))))))..(((..).)).......((((....)))).
[ reference ext structure ]
....................((((((..((((....))))....)))))).((((..).)))......((((....)))).
[ predicted structure ]
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4W28_6
[ FASTA input ]
UGCCCGGUAGCCCCGAAGGUAGAGCAGGGGAUUGAAAAUCCCCGUGUCCUUGGUUCGAUUCCGAGUCCGGGCACCA
[ reference std structure ]
.(.((((....(.(.[{....).)..((((.........)))).......<<.(...)]}.>.>..)))).)....
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[ reference ext structure ]
.(.((((....(.([{(.{).).).(((((.........)))))...]<.<<<<.}.>}.>>.>.>))))).....
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[ predicted structure ]
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4WJ4_B
[ FASTA input ]
UCCGCGAUAGCUCAGUCGGUAGAGCAAAUGACUGUUAAUCAUUGGGUCCCUGGUUCGAGUCCAGGUCGCGGAGCCA
[ reference std structure ]
(((((((..((((.....[..)))).(((((.......))))).....{{{{{..]....}}}}})))))))....
[ reference ext structure ]
(((((((([{{.{)<..ab..}]}}(((((((.....)))))))...>ccccccAB.C..CCCCC)))))))....
( )
( )
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(((((((.....(((((............)))))..............(((((.......))))))))))))....
4X0B_B
[ FASTA input ]
GGGCCAGGUAGCUCAGUUGGUAGAGCACUGGACUGAAAAUCCAGGUGUCGGCGGUUCGAUUCCGCCCCUGGCCCACC
[ reference std structure ]
.((((..(..((((........)))).(...............).....(((((.......))))))..))))....
[ reference ext structure ]
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( )
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((((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))))...
4X4P_B
[ FASTA input ]
GGCCGCGGCAGGUUCGAGUCCUGCCGCGAUCGCCAC
[ reference std structure ]
((((((((((((.......)))))))))...)))..
[ reference ext structure ]
((((((((((((.......)))))))))...)))..
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4XW7_A
[ FASTA input ]
GGGUCGUGACUGGCGAACAGGUGGGAAACCACCGGGGAGCGACCCUUGCCGCCCGCCUGGGCAA
[ reference std structure ]
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[ reference ext structure ]
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4Y1J_A
[ FASTA input ]
AAAGGGGAGUAGCGUCGGGAAACCGAAACAAAGUCGUCUAUUCGUGAGGAAACUCACCGGCUUUGUUGACAUACGAAAGUAUGUUUAGCAAGACCUUUCC
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( )
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4YAZ_R
[ FASTA input ]
GUACACGACAAUACUAAACCAUCCGCGAGGAUGGGGCGGAAAGCCUAAGGGUCUCCCUGAGACAGCCGGGCUGCCGAAAUAUC
[ reference std structure ]
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4ZNP_A
[ FASTA input ]
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( )
( )
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5A17_A
[ FASTA input ]
GACGAUAUCGAGCAUCAAGAGUGAAUAUCGUC
[ reference std structure ]
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5AXW_B
[ FASTA input ]
GGAAAUUAGGUGCGCUUGGCGUUUUAGUACUCUGGAAACAGAAUCUACUAAAACAAGGCAAAAUGCCGUGUU
[ reference std structure ]
....................(((((((((.((((....))))...)))))))))..(((.....))).....
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....................((((((((((((((....)))))..))))))))).(((((..).))))....
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5CCB_N
[ FASTA input ]
GGCCCGGAUAGCUCAGUCGGUAGAGCAUCAGACUUUUAAUCUGAGGGUCCAGGGUUCAAGUCCCUGUUCGGGCGCCA
[ reference std structure ]
.(((((((..((((........)))).(((((.(...).))))).....(((((.......))))))))))))....
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((((((((([{{.{).......}]}}((((((((...))))))))....(((((.......)))))))))))))...
( )
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( )
( )
( )
[ predicted structure ]
.((((((((((...(((((((.....))).))))...((((...........)))).......))))))))))....
5D3G_E
[ FASTA input ]
ACCCCCCCUUCGGUGCUUUGCACCGAAGGGGGGG
[ reference std structure ]
.(((((((((((((((...)))))))))))))))
[ reference ext structure ]
.(((((((((((((((...)))))))))))))))
[ predicted structure ]
.(((((((((((((((...)))))))))))))))
5DDR_A
[ FASTA input ]
CGUUGACCCAGGAAACUGGGCGGAAGUAAGGUCCAUUGCACUCCGGGCCUGAAGCAACGCG
[ reference std structure ]
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[ reference ext structure ]
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( )
( )
( )
[ predicted structure ]
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5DI4_A
[ FASTA input ]
GGGUACUUAAGCCCACUGAUGAGUCGCUGGGAUGCGACGAAACGCCCA
[ reference std structure ]
...............(....).(((((......)))))..........
[ reference ext structure ]
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5GAP_U
[ FASTA input ]
UUCUUGCCUUUUACCAGAAC
[ reference std structure ]
.(((...........)))..
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(((((.........))))).
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5HLF_E
[ FASTA input ]
UACCCCCCCUUCGGUGCUUUGCACCGAAGGGGGGG
[ reference std structure ]
..(((((((((((((((...)))))))))))))))
[ reference ext structure ]
..(((((((((((((((...)))))))))))))))
[ predicted structure ]
..(((((((((((((((...)))))))))))))))
N/A - RNA 2D structure in Vienna format could not have been generated (most likely due to difficult to represent pseudoknot structure). Check secondary structure file for details.
std - standard base pair definition
ext - extended base pair definition
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