2KDQ_B
|
[ FASTA input ]
|
GGCAGAUCUGAGCCUGGGAGCUCUCUGCC |
[ reference std structure ]
|
((((((...((((......))))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((([..(]((......)).))))))) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((...((((......))))))))))
|
2KE6_A
|
[ FASTA input ]
|
GGCUUGAUUGUAUUUUUAAAUUAAUUCUUAAAAACUACAAAUUAAGCC |
[ reference std structure ]
|
(((((.(((((((((((((........))))))).))).))).)))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((.(((((((((((((.(....).))))))).))).))).)))))
|
[ predicted structure ] |
..(((((((((((((((((........))))))).))).)))))))..
|
2KUR_A
|
[ FASTA input ]
|
GGCUUGAUUGUAUUAUUAAAUUAAUUCUUAAUAACUACAAAUUAAGCC |
[ reference std structure ]
|
(((((((((((((((((((........))))))).))).)))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((((((((((((((....))))))))).))).)))))))))
|
[ predicted structure ] |
..(((((((((((((((((........))))))).))).)))))))..
|
2KUU_A
|
[ FASTA input ]
|
GGCUUGAUUGUAUGUGUAAAUUAAUUCUUACACACUACAAAUUAAGCC |
[ reference std structure ]
|
(((((.(((((((((((((........))))))).))).))).)))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((.(((((((((((((((....))))))))).))).))).))))) ( )
|
[ predicted structure ] |
..(((((((((((((((((........))))))).))).)))))))..
|
2KUV_A
|
[ FASTA input ]
|
GGCUCGAUUGUAUUUUUAAAUUAAUUCUUAAAAACUACAAAUCGAGCC |
[ reference std structure ]
|
(((((((((((((((((((........))))))).))).)))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((((((((((((((....))))))))).))).))))))))) ( )
|
[ predicted structure ] |
..(((((((((((((((((........))))))).))).)))))))..
|
2KUW_A
|
[ FASTA input ]
|
GGGGUUGGUGUAUUUUUAAAUUAAUUCUUAAAAACUACAAUCAGCUCC |
[ reference std structure ]
|
(((((((((((.(((((((........)))))))..)).)))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((((((((((((.(....).))))))).))).))))))))) ( )
|
[ predicted structure ] |
..(((((((((((((((((........))))))).))).)))))))..
|
2L1F_A
|
[ FASTA input ]
|
GGCGGACCCGUGGUGGAACAGACGUGUUCGGAACACCCGGCCGCAACCCUGGGAGACGUCCCAGG |
[ reference std structure ]
|
.((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))...(((((((....)))))))
|
[ reference ext structure ]
|
.((((.()((.(((((((((....)))))....)))))).))))...(((((((....))))))) ( )
|
[ predicted structure ] |
.((((..........(((((....)))))...........))))...(((((((....)))))))
|
2L1F_B
|
[ FASTA input ]
|
GGCGGACCCGUGGUGGAACAGACGUGUUCGGAACACCCGGCCGCAACCCUGGGAGACGUCCCAGGG |
[ reference std structure ]
|
.((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
.((((.()((.(((((((((....)))))....)))))).))))..((((((((....)))))))) ( )
|
[ predicted structure ] |
.((((..........(((((....)))))...........))))..((((((((....))))))))
|
2L94_A
|
[ FASTA input ]
|
GGGAAGAUCUGGCCUUCCCACAAGGGAAGGCCAGGGAAUCUUCCC |
[ reference std structure ]
|
((((((((.((((((((((....))))))))))....))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((((((((((((((..))))))))))))...))))))))
|
[ predicted structure ] |
.......((((((((((((....))))))))))))..........
|
2LC8_A
|
[ FASTA input ]
|
GGUCAGGGUCAGGAGCCCCCCCCUGAACCCAGGAUAACCCUCAAAGUCGGGGGGCA |
[ reference std structure ]
|
.(((.((((((((.[[[[[[[)))).))))..))).............]]]]]]].
|
[ reference ext structure ]
|
.((((((((((((({{{{{.[)))).))))).))).............])}}}}}. ( )
|
[ predicted structure ] |
..(((((((.....)))).....)))...........(((........))).....
|
2MIY_A
|
[ FASTA input ]
|
GCUUGGUGCUUAGCUUCUUUCACCAAGCAUAUUACACGCGGAUAACCGCCAAAGGAGAA |
[ reference std structure ]
|
((((((((.....[[[[[[.)))))))).........(((......)))..]]]]]]..
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((.[{..<<<<...)))))))).........(((......)))..]}>>>>.. ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
.(((((((............)))))))..........((((....))))..........
|
2N1Q_A
|
[ FASTA input ]
|
GGUGCCCGUCUGUUGUGUGACUCUGGUGAGAGCCAGAGGAGAUCUCUCGACGCAGGACUCGGCUUGCUGGAGACGGCAAGAGGCGAGGGGCGGCGACUGGUGAGUACGCCAAAAAUUUUGACUAGCGGAGGCUAGAAGGAGAGAGAUGGGUGCCC |
[ reference std structure ]
|
(((((((((((...((((..(((((((....)))))))...(((..(((.(((....((((.(((((((....)))))))...))))..))).)))..)))....)))).......(((..(((((....)))))..)))...))))))))))).
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((((((((((((.(((((((((..)))))))))..((((((((((((((..(((((((((((((..)))))))))..))))))))))))))))))....)))).).....((((((((((....)))))))))).))))))))))))).
|
[ predicted structure ] |
......(((((...................................................(((((((....)))))))...............................................................))))).......
|
3A3A_A
|
[ FASTA input ]
|
GCCCGGAUGAUCCUCAGUGGUCUGGGGUGCAGGCUUCAAACCUGUAGCUGUCUAGCGACAGAGUGGUUCAAUUCCACCUUUCGGGC |
[ reference std structure ]
|
(((((((.(..((((([..(.])))))((((((.......)))))).(((((....))))).((((..)....))))).)))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((..(((((({[{.))))))(((((((..)...))))))((((((....))))))(((((]}.)}.))))))))))))) ()
|
[ predicted structure ] |
(((((((....................((((((.......)))))).(((((....)))))..................)))))))
|
3IVN_B
|
[ FASTA input ]
|
GGCCAGUAUAACCUCAAUGAUAUGGUUUGAGGGUGUCUACCAGGAACCGUAAAAUCCUGACUACUGGUC |
[ reference std structure ]
|
(((((((({..((((((......[[.))))))(.....})(((((.]]......)))))..))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((([(.(((((((.{{..{{)))))))).(...].(((((.}}().}}.))))).))))))))) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((((...((((((.........))))))........(((((.........)))))..))))))))
|
3J3E_8
|
[ FASTA input ]
|
AACUCUAAGCGGUGGAUCACUCGGCUCAUGGGUCGAUGAAGAACGCAGCAAACUGUGCGUCAUCGUGUGAACUGCAGGACACAUGAACAUCGACAUUUUGAACGCAUAUCGCAGUCCAUGCUG |
[ reference std structure ]
|
........................................((((((.[[.....))).....(.((((.....]]...........))))..)...)))....((.....))...........
|
[ reference ext structure ]
|
..................................().<((((((((.{{(.).{))).[.}(].(((..(((.}}).)......).).))....).))))>).((.....))........... ( ) ( ) ( ) ( ) () () ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
.......((((.(((.....))).........((((((.....(((((....)))))........((((...))))...........)))))).....(((.......))).......)))).
|
3J3F_8
|
[ FASTA input ]
|
CGACUCUUAGCGGUGGAUCACUCGGCUCGUGCGUCGAUGAAGAACGCAGCUAGCUGCGAGAAUUAAUGUGAAUUGCAGGACACAUUGAUCAUCGACACUUCGAACGCACUUGCGGCCCCGGGUUCCUCCCGGGGCUACGCCUGUCUGAGCGUCGCUU |
[ reference std structure ]
|
..........................................((.((.[[.....))......(.(((......]].............)))..)...)).....((....))(((((.((.......)).))))).....................
|
[ reference ext structure ]
|
....................................(.{(((((.((.[[....[))).(.].(((((.(((..]].)........)).)))).))...)))}))((....))(((((((((.....)))))))))..................... () ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
.........(((.(((.....))).........(((((((....(((((....)))))..............................)))))))..................(((((((((.....))))))))).....))).............
|
3JYX_4
|
[ FASTA input ]
|
AAACUUUCAACAACGGAUCUCUUGGUUCUCGCAUCGAUGAAGAACGCAGCGAAAUGCGAUACGUAAUGUAGGUUGCAGAAUUCCGUGAAUCAUCGAUCUUUGAACGCACAUUGCGCCCCUUGGUAUUCCAGGGGGCAUGCCUGUUUGAGCGUCAUUU |
[ reference std structure ]
|
..........................................(.(((........))).......(..........................)......)................(((((((....))))))).......................
|
[ reference ext structure ]
|
.(..)..............................().<((((({(([.....[.).}..)..(.(((.((..]].......))......))).)...))))>)...(....)...((((((((..))))))))....................... ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
...(((...........................(((((((....((((......))))...............................)))))))..................(((((((((....)))))))))..........)))........
|
3O58_3
|
[ FASTA input ]
|
AAACUUUCAACAACGGAUCUCUUGGUUCUCGCAUCGAUGAAGAACGCAGCGAAAUGCGAUACGUAAUGUGAAUUGCAGAAUUCCGUGAAUCAUCGAAUCUUUGAACGCACAUUGCGCCCCUUGGUAUUCCAGGGGGCAUGCCUGUUUGAGCGUCAUUU |
[ reference std structure ]
|
.........................................((((([..(.....]))....((..((.........)............))...).).)))....(((...))).((((((((....))))))))......................
|
[ reference ext structure ]
|
....................................(.{((((([((.<<....<).]..)>((.(.(.........>.>..........))...))..))))}))(((...)))(((((((((....)))))))))..................... () ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
........((((.....................(((((((....((((......))))...............................)))))))...................(((((((((....))))))))).....))))............
|
3RKF_A
|
[ FASTA input ]
|
GGCCAUAUAACUGCGUGGAUAUAGCACGCAGGUUUCUACCGGGCACUGUAAAUGUCCGACUAUGGUC |
[ reference std structure ]
|
((((((([..(((((((.....{{)))))))(.....])((((((}}.....))))))..)))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((.(((((((.[[[.[[)))))))).....).((((((]]()]]]))))))..))))))) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((...(((((((.......)))))))........((((((.......))))))..)))))))
|
3SD1_A
|
[ FASTA input ]
|
GGAGAGUAGAUGAUUCGCGUUAAGUGUGUGUGAAUGGGAUGUCGUCACACAACGAAGCGAGAGCGCGGUGAAUCAUUGCAUCCGCUCCA |
[ reference std structure ]
|
((((....((((((((((((......(((((((...[[[[....))))))).....((....))))).)))))))))..]]]].)))).
|
[ reference ext structure ]
|
((((((.({{{{{{{{{{{{..{{.{{{{{{{{.[.)((((].)}}}}}}}}.}}.(((..)))}}}.}}}}}}}}}.)))).))))). ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
........((((((((((........(((((((...........)))))))................))))))))))............
|
3W3S_B
|
[ FASTA input ]
|
GGGAGAGGUUGGCCGGCUGGUGCCGCCCCGGGACUUCAAAUCCCGUGGGAGGUCCCGCAAGGGAGCUCCGGAGGGUUCGAUUCCCUCCCUCUCCCGCC |
[ reference std structure ]
|
(((.((((..((.((([..(.])))))((((((.......))))).)((((.((((....)))).)))).(((((..)....))))))))).)))...
|
[ reference ext structure ]
|
(((.((((..((.(((([[()))))))((((((.......))))).)((((((((((..)))))))))).((((((]..)].))))))))).)))... ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((((....................(((((.......)))))..........................................))))))))...
|
3ZEX_C
|
[ FASTA input ]
|
AACGUGUCGCGAUGGAUGACUUGGCUUCCUAUUUCGUUGAAGAACGCAGCAAAGUGCGAUAAGUGGUAUCAAUUGCAGAAUCAUUUCAUUGCCCAAUCUUUGAACGCAAACGGCGCAUGGGAGAAGCUCUCUCGAGCCAUCCCCGUGCAUGCCACAUUUCUCAGUGUCG |
[ reference std structure ]
|
.........................................((((((.[[.....)))....(((((((...(.]].).........).)))).).).)))....((.....))(((((.(.(..((((....))))..).).))))).....................
|
[ reference ext structure ]
|
...................................[(..(.(((.((.{.(.){.)))(..}((((((..((..}..).......).)..))).))..))))].)(((..).))(((((((((.(((((....))))).)))))))))..................... ( ) () ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
.((((................................(((....((((......))))....(((((....)))))............))).......................(((((((....................)))))))...............))))..
|
4A1C_2
|
[ FASTA input ]
|
AGAAAAUUUUCAACGGUGGAUAUCUAGGUUCCCGUGACGAUGAAGAACGCAGCGAAAUGCGAUACGCAAUGCGAAUUGCAGAACCGCGAGUCAUCAGAUCUUUGAACGCAAGUGGUGGAGGUGUAAAAACCUUCAUGUUUGUUUCAGUGUGGAA |
[ reference std structure ]
|
............................................((((((.[[.....))).....(.((((.....]]..........).)))..)...)))....((.....))(((((........)))))....................
|
[ reference ext structure ]
|
.......................................(.<((((({((.[[....[).}..)](((((((.((..]]...)....).).)))).))..))))>))((.....))(((((........))))).................... () ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
...........((((.(((....)))............(((((....((((......))))....(((((....)))))...........)))))....................(((((((......)))))))....))))...........
|
4BY9_A
|
[ FASTA input ]
|
GCGAGCAAUGAUGAGUGAUGGGCGAACUGAGCUCGAAAGAGCAAUGAUGAGUGAUGGGCGAACUGAGCUCGC |
[ reference std structure ]
|
((((((....................(...((((....))))......).................))))))
|
[ reference ext structure ]
|
((((((...((((.............(((((((((..)))))...)))).............)))))))))) ( )
|
[ predicted structure ] |
.............(((..............((((....))))...................)))........
|
4C4Q_N
|
[ FASTA input ]
|
GACUAGCCGUAGUGGCGAGCUCCCUGGGUGGUCUAAGUCCUGAGUACAGGACAGUCGUCAGUAGUUCGACGUGAGCACUAGCCCACCUCGAGAUGCUACGUGGACGAGGGCAUGCCCAAGACACACCUUAACCCUGGCGGGGGUCGCUAGGGUGAAAUCACAUUAUGUGAUGGGGGUACGACCUGAUAGGGUGCUGCAGAGGCCCACUAGCAGGCUAGUAUAAAAAUCUCUGC |
[ reference std structure ]
|
.(((((((.((((((((.((((((.(((((((((..((((((....))))))..(((((..((((((((.(((.((....)).))).))))...))))....)))))(((....))).)))).)))))..((((((((((...))))))))))....(((((...))))).)))))).)).(((....))).((..[[[[.))))))))...))))))).........]]]].
|
[ reference ext structure ]
|
.(((((((.((((((((.((((((.(((((((((..((((((....))))))..(((((.(((((((((.(((((((..))))))).))))...)))))...)))))(((....))).))))).))))..((((((((((...))))))))))....(((((...))))).)))))).))(((((..)))))((..[[[[[))))))))...)))))))........]]]]]. ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
.(((((((.((((((...((((((.(((((((((..((((((....))))))..(((((.(((((((((.(((..........))).))))...)))))...)))))(((....))).)))).)))))..((((((((((...))))))))))...((((((...))))))))))))...((((....))))...........))))))...)))))))..............
|
4JF2_A
|
[ FASTA input ]
|
GAACCGCGAAAGCGGUUCCACGACGAUACUUAUUUCCUUUGAUCGUCGUUAUUACUGGCUUCGGCCACAAAGGAGA |
[ reference std structure ]
|
(((((((....))))))).((((((((.......[[[[[..))))))))......((((....))))..]]]]]..
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((..)))))))).(((((((((.((...<<<...)))))))))....(.(((((..)))))).))>>>.. ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
.....................((((((..............))))))........((((....)))).........
|
4P5J_A
|
[ FASTA input ]
|
AGCUCGCCAGUUAGCGAGGUCUGUCUCGACACGACAGAUAAUCGGGUGCAACUCCCGCCCCUCUUCCGAGGGUCAUCGGAACC |
[ reference std structure ]
|
.((((((..[...)))))(((((((.......)))))))...{{{{..]....}}}}(((...{{{{{{))).).}}}}}}..
|
[ reference ext structure ]
|
.(((((([[()..)))))(((((((.......)))))))...{{{{{]..}].}}}}(((..{{{{{{{))).).}}}}}}.} () ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
..(((((......)))))(((((((.......)))))))...((((.......))))......((((((......))))))..
|
4P8Z_A
|
[ FASTA input ]
|
GGUUGGGUUGGGAAGUAUCAUGGCUAAUCACCAUGAUGCAAUCGGGUUGAACACUUAAUUGGGUUAAAACGGUGGGGGACGAUCCCGUAACAUCCGUCCUAACGGCGACAGACUGCACGGCCCUGCCUCUUAGGUGUGUCCAAUGAACAGUCGUUCCGAAAGGAAGCAUCCGGUAUCCCAAGACAAUC |
[ reference std structure ]
|
(((((..(((((..(((((((((...[[[.)))))))))..{{{{.{{{.{{{{......{{{{{...{{{{..{{{...]]]}}}.......}}}}((....)).....<<<<<...}}}}}.(((.....)))}}}}.}}}....>>>>>.((((....))))....}}}}...)))))..)))))
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((((((..(((((((((...[.[.))))))))).{<<<<<<<<<<<<<(..<)<<<<<<.<.<<<<a.aaa...]].AAA...>.A..>>>aa...>AA....aaaaaa.()>>>>>>a.(.....)>A>>>>>>>>>.}.AAAAA.(((((..)))))..A.>>>>...)))))))))))) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((..((((((.(((((((((.......)))))))))....(((((....((((....))))......................................................)))))..............................((((....))))..........))))))..)))))
|
4W24_8
|
[ FASTA input ]
|
CGACUCUUAGCGGUGGAUCACUCGGCUCGUGCGUCGAUGAAGAACGCAGCUAGCUGCGAGAAUUAAUGUGAAUUGCAGGACACAUUGAUCAUCGACACUUCGAACGCACUUGCGGCCCCGGGUUCCUCCCGGGGCUACGCCUGUCUGAGCGUCGCU |
[ reference std structure ]
|
............................................(((.[[....[)))...]...{{{......]].............}}}.............((....))(.....((.......)).....)....................
|
[ reference ext structure ]
|
....................................(..(.(.(.((.[[....[))).{.]...{{{{{{{..]]..}.......}}}}}}...}....))..)((....))(((...((((.)..)))...))).................... () ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
.(((.........(((.....))).........(((((((....(((((....)))))..............................)))))))..................(((((((((.....)))))))))..............)))...
|
5DI4_A
|
[ FASTA input ]
|
GGGUACUUAAGCCCACUGAUGAGUCGCUGGGAUGCGACGAAACGCCCA |
[ reference std structure ]
|
...............(....).(((((......)))))..........
|
[ reference ext structure ]
|
.........(.....(....)[[[[[[[)..].]]]]]].........
|
[ predicted structure ] |
................................................
|