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RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 2KRL_A
RNA: 2KRL_A
Rfam family:
-
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| Reference structure (std) | [ sec struct ] | .((((.((....)).)))).......((((((((.....[[....))))))))......(.(((((.....(...........)....))))).)...]].. | |
| Reference structure (ext) | [ sec struct ] |
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| CentroidFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((....))))))))......(((((((((.........)))))))))...((((.(((((......(((....)))......))))).)))).... |
| CentroidFold (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((....))))))))......(((((((((.........)))))))))...((((.(((((......(((....)))......))))).)))).... |
| Contrafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((....))))))))......(((((((((.........)))))))))...((((.(((((......(((....)))......))))).)))).... |
| Cylofold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((([[[.))))))))...]]](((((((((.........)))))))))...((((.(((((......(((....)))......))))).)))).... |
| Fold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((....))))))))......(((((((((.........)))))))))...((((.(((((......(((....)))......))))).)))).... |
| HotKnots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((....))))))))......(((((((((.........)))))))))...((((.(((((......(((....)))......))))).)))).... |
| MaxExpect | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((....))))))))......(((((((((.........)))))))))...((((.(((((......(((....)))......))))).)))).... |
| McQFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.[[[[[))))))).]]]]](((((((((.........)))))))))...((((.(((((......((((......))))..))))).)))).... |
| Pknots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((.[[[[[))))))..]]]]](((((((((.........)))))))))...((((.(((((......(((....)))......))))).)))).... |
| PknotsRG | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((.[[[))))))))..]]].(((((((((.........)))))))))...((((.(((((......(((....)))......))))).)))).... |
| ProbKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((([[[[))))))))..]]]](((((((((.........)))))))))...((((.(((((.(..(.(((....))))....)))))).)))).... |
| RNAfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((....))))))))......(((((((((.........)))))))))...((((.(((((......(((....)))......))))).)))).... |
| RNAshapes | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((....))))))))......(((((((((.........)))))))))...((((.(((((......(((....)))......))))).)))).... |
| RNAsubopt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((.....(((((........)))))(((((((((.........)))))))))...((((.(((((......(((....)))......))))).))))))). |
| Sfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((....))))))))......(((((((((.........)))))))))...((((.(((((......(((....)))......))))).)))).... |
| UNAFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((....))))))))......(((((((((.........)))))))))...((((.(((((......(((....)))......))))).)))).... |
| Vsfold4 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .(((((((....))))))).......(((((((((.........)))))))))...(((..(((((....((((.....)))).....)))))..))).... |
| Vsfold5 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .(((((((....))))))).(((...(((((((((.........))))))))).((((...[[[[)))).((((.....))))..))).]]]]......... |