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RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 2L1F_A
RNA: 2L1F_A
Rfam family:
Gammaretro_CES
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| Reference structure (ext) | [ sec struct ] |
.((((.()((.(((((((((....)))))....)))))).))))...(((((((....))))))) ( ) |
|
| Afold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | N/A |
| Alterna | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))...(((((((....))))))) |
| Carnac(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ................................................................. |
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| CentroidFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))...(((((((....))))))) |
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| Contrafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))...(((((((....))))))) |
| Cylofold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((......(((((((((....)))))....))))...))))...(((((((....))))))) |
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| MCFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((..(((.((((...(.(((..))).)...)))))))))))...(((((((....))))))) |
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| MXScarna(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ..(((..(((.(((((((((....)))))....))))))))))..(..((((((....))))))) |
| Mastr(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))...(((((((....))))))) |
| MaxExpect | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))...(((((((....))))))) |
| McQFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))...(((((((....))))))) |
| Murlet(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((.((.(.(((((((((....)))))....)))))))))))......((((....))))... |
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| Pknots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))...(((((((....))))))) |
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| ProbKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))...(((((((....))))))) |
| RDfolder | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .............(((....(((((..........(((((........)))))..)))))))).. |
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| RNAalifold(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((.((.(.(((((((((....)))))....))))))))))).......(....)...(...) |
| RNAfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))...(((((((....))))))) |
| RNAshapes | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((.((...(((((((((....)))))....)))).))))))...(((((((....))))))) |
| RNAsubopt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((..(((.((((((((......))))....)))))))))))...((((((......)))))) |
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| Sfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))...(((((((....))))))) |
| UNAFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))...(((((((....))))))) |
| Vsfold4 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((............(((....))).(((.....))).))))....((((((....)))))). |
| Vsfold5 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((............(((....))).(((.....))).))))...(((((((....))))))) |