RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 2L1F_B

RNA: 2L1F_B
Rfam family: Gammaretro_CES

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Reference structure (std)		[ sec struct ]	.((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....))))))))
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	.((((.()((.(((((((((....)))))....)))))).))))..((((((((....))))))))        (                               )
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	N/A
Alterna	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....))))))))
Carnac(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..................................................................
CentroidAlifold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....))))))))
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....))))))))
CentroidFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....))))))))
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....))))))))
Cylofold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((......(((((((((....)))))....))))...))))..((((((((....))))))))
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((.((.(.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....))))))))
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....))))))))
MCFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((..(((.((((((((((((..)))))))))))))))))))).((((((((....))))))))
MCFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((..(((.((((...(.(((..))).)...)))))))))))..((((((((....))))))))
MXScarna(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((..(((.(((((((((....)))))....))))))))))...((((((((....))))))))
Mastr(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....))))))))
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....))))))))
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....))))))))
Murlet(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((.((.(.(((((((((....)))))....)))))))))))......((((....))))....
PETfold_pre2.0(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....))))))))
Pknots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....))))))))
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....))))))))
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....))))))))
RDfolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....))))))))
RNASampler(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((..........(((((....)))))...........))))..((((((((....))))))))
RNAalifold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((.((.(.(((((((((....)))))....))))))))))).......(....)..((...))
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....))))))))
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))...(((((((....))))))).
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((..(((.((((((((......))))....)))))))))))..(((((((......)))))))
RSpredict(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((.((...((((.((((....)))).....)))).))))))..((((((((....))))))))
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....))))))))
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....))))))))
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((............(((....))).(((.....))).))))...(((((((....))))))).
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((............(((....))).(((.....))).))))..((((((((....))))))))

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