RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 2LDT_A

RNA: 2LDT_A
Rfam family: -

			GGGGAGUACGGCCGCAAGGUUAAAACUCCCC
Reference structure (std)		[ sec struct ]	(((((((..((((....))))...)))))))
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	((((((.(.(((((..))))).).).)))))      (                   )                  (     )                   (                 )
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((....))))...)))))))
Alterna	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((....))))...)))))))
CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((....))))...)))))))
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((....))))...)))))))
CentroidFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((....))))...)))))))
CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...((((..((((....))))...))))...
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((....))))...)))))))
Cylofold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((....))))...)))))))
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((....))))...)))))))
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((....))))...)))))))
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((....))))...)))))))
MCFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((((..)))).))))))))))
MCFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...(((....)))....)))))))
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((....))))...)))))))
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.................)))))))
Pknots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((....))))...)))))))
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((....))))...)))))))
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((....))))...)))))))
RDfolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.................)))))))
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((....))))...)))))))
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((....))))...)))))))
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((....))))...)))))))
RNAwolf	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((....))))...)))))))
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.((((((..))))).).)))))))
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((....))))...)))))))
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...(((....)))....)))))))
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((....))))...)))))))
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((....))))...)))))))

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