RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 2LKR_A

RNA: 2LKR_A
Rfam family: -

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Reference structure (std)		[ sec struct ]	((...((.......(((((((..(((.(((.....)))..)))........((((((((((((....)))))))))))).......)))..))))........))....))
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	((((.(((.....((((((((.((((.((((...))))..)))).......((((((((.((((..))))).))))))).......)))..)))))......)))..))))                                                           (            )                                                                  (              )                                                                                                                                 (          )                                                                                            (                           )
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((.(..((((((((.((((.(((.....)))..)))).......((((((((((((....)))))))))))).......)))..)))))..).).)))).))))
CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......(((((..(((((.((((.....))))...........(((.....((((((((((((....)))))))))))).....)))....))))).........))))).
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((..(((.....(((((.((.((((.(((.....)))..)))).))....((((((((((((....))))))))))))((....))....)))))......)))...)).
CentroidFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((..(((.....(((((.((.((((.(((.....)))..)))).))....((((((((((((....))))))))))))((....))....)))))......)))...)).
CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...................((((.....))))...............................................................................
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((..........((.((((.(((.....)))..)))).)).....(((((((((((....)))))))))))(((....)))..........)))).....))))
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((.....((((((((.((((.(((.....)))..)))).)))...((((((((((((....))))))))))))((....))....)))))......)))).))))
Cylofold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......(((((..(((((.((((.[[[.))))....]]]............((((((((((((....))))))))))))............))))).........))))).
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((.....(((((.((.((((.(((.....)))..)))).))....((((((((((((....))))))))))))((....))....)))))......)))).))))
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((.(..((((((((.((((.(((.....)))..)))).......((((((((((((....)))))))))))).......)))..)))))..).).)))).))))
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((.....(((((.((([[[[.[[)))....]]..]]]].......((((((((((((....))))))))))))............)))))......)))).))))
MCFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((.(.(.((((((((.((((.(((.....)))..))))((.....(((((((((((((..))))))))))))).....)))))..)))))..).).)))).))))
MCFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((((((((.(((((((((...))))).))))((((((((((((((((((((..)))))))))))))))))))))))..)))))).)))))))).))))
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((((.....(((((.((.((((.(((.....)))..)))).)).....(((((((((((....)))))))))))(((....)))...)))))......)))).))).
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......(((((..(((((.((((.....))))..((((.............(((((((((((((..)))))))))))))))))........))))).........))))).
NanoFolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.{{{{{{(aaaaaaaa.aaaa))[[[[((((((((AAAA.))..<<((((((((((((()}))))))))))))))))))))AAA..AAAAA.]]]]))>>}}}}}.
Pknots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((..[[[[[..(((((.((((.....)))).((((..((((....))))((((((((((((....))))))))))))((....)))))))))))..)))....]]]]].
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((..[[[[[..((((((((.((((.(((.....)))..)))).......((((((((((((....)))))))))))).......)))..)))))..)))....]]]]].
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((.....(((((....((((.(((.....)))..))))........(((((((((((....)))))))))))(((....)))...)))))......)))).))))
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((.....(((((.((((.....))))..((((.............((((((((((((....))))))))))))))))........)))))......)))).))))
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((.(..((((((((.((((.(((.....)))..)))).......((((((((((((....)))))))))))).......)))..)))))..).).)))).))))
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((.....((((((((.((((.(((.....)))..)))).......((((((((((((....)))))))))))).......)))..)))))......)))).))))
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((.(..((((((((.((((.(((.....)))..)))).)))....(((((((((((....)))))))))))(((....)))...)))))..).).)))).))))
RNAwolf	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((....(((((....((((((........))..)))).......((((((((((((....))))))))))))((....))....)))))....).)))).))))
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((.(..((((((...((((((........))..)))).......(((((((((((((..)))))))))))))((....))..).)))))..).).)))).))))
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((.....(((((....((((.(((.....)))..)))).......((((((((((((....))))))))))))............)))))......)))).))))
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((.....((((((((.((((.(((.....)))..)))).......((((((((((((....)))))))))))).......)))..)))))......)))).))))
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......(((((........((((.....))))..((((.((((....)))).(((((((((((....))))))))))).))))...((((.....))))......))))).
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((...............((((.....))))...(((((.....)))))....(((((((((....))))))))).)))).....((((.....)))).((.....))..

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