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RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 2M8K_A



RNA: 2M8K_A
Rfam family: -

GGUUUCUUUUUAGUGAUUUUUCCAAACCCCUUUGUGCAAAAAUCAUUA
Reference structure (std) [ sec struct ] (((((......[[[[[[[[[[[[))))).....].].]]]]]]]]]].
Reference structure (ext) [ sec struct ] ((((([{<abcddddd......d))))).....D.].}>ABCDDDDD.
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                     (             )            
                   (                  )         
                 (                      )       
                    (                )          
CentroidFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ..........((((((((((((((((....))))..))))))))))))
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..........(((((((((((.((((....))))...)))))))))))
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] ..........(((((((((((.((((....))))...)))))))))))
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..........(((((((((((.((((....))))...)))))))))))
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..........(((((((((((.((((....))))...)))))))))))
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..........(((((((((((.(((......)))...)))))))))))
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] ..........(((((((((((((((......))).).)))))))))))
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] ..........(((((((((((.((((....))))...)))))))))))
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ..........(((((((((((((((((..))))).).)))))))))))
MCFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..........((((((((((((((((....)))).).)))))))))))
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ..........(((((((((((.((........))...)))))))))))
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..........(((((((((((................)))))))))))
NanoFolder [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.....[[[[[[[[[[[..))))).........]]]]]]]]]]]
Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] ..........((((((((((((((((....)))).).)))))))))))
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.....[[[[[[[[[[[..))))).........]]]]]]]]]]]
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ..........(((((((((((.(((......)))...)))))))))))
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] ..........(((((((((((.((((....))))...)))))))))))
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] ..........(((((((((((.((((....))))...)))))))))))
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..........((((((((((((((((....)))).).)))))))))))
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] ..........(((((((((((.((((....))))...)))))))))))
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ..........((((((((((((((((....)))).).)))))))))))
RNAwolf [ FASTA input ] [ sec struct ] ..........((.((((((((((((......))).).)))))))).))
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ..........(((((((((((((((......))).).)))))))))))
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..........(((((((((((((((......))).).)))))))))))
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..........(((((((((((.((..........)).)))))))))))
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ...........((((((((((.((((....))))...)))))))))).
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ...........((((((((((.((((....))))...)))))))))).