RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 2MS1_B

RNA: 2MS1_B
Rfam family: tRNA

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Reference structure (std)		[ sec struct ]	(((((....((...........))((((((.......)))))).....((((.......))))...)))))
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	(((((....((((.[.....))))((((((.......))))))...]((((((...)..)))))..)))))                     (                       )
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((.......(((.....(((((((.......)))))))..)))(((.......))).))))))))
CentroidAlifold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.............................................(.......).....))))))
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((.......(((.....(((((((.......))))))).)))((((.......))))))))))))
CentroidFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((.......(((.....(((((((.......))))))).)))((((.......))))))))))))
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((................(((((((.......)))))))...(((((.......))))))))))))
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((.......((((....(((((((.......)))))))))))((((.......))))))))))))
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((.......(((.....(((((((.......)))))))..)))(((.......))).))))))))
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.(.((...)).)..(((((((((.......)))))).)))(((((.......))))))))))))
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((.......(((.....(((((((.......)))))))..)))(((.......))).))))))))
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((...............(((((((.......)))))))....((((.......))))))))))))
MXScarna(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(.(((((..((((.......)))).((((.........)))).....(((((.......))))))))))).
Mastr(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.......................................................................
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..............(((((((((.......))))))).))(((((.......))))))))))))
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((................(((((((.......)))))))...(((((.......))))))))))))
NanoFolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((([[[.{{{{{.{{{{{{{{{{)).<<<.}}}}}}}..>>>]]].}}}.}}}}}.))))))))
PETfold_2.0(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((.......)))).(((((.(...).))))).....(((((.......))))))))))))
PETfold_pre2.0(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((.......)))).(((((.(...).))))).....(((((.......))))))))))))
PPfold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.......................................................................
Pknots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((.........)).(((((((((.......)))))).)))(((((.......))))))))))))
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((......((((.....(((((((.......))))))).))))(((.......))).))))))))
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..............(((((((((.......))))))).))((((((....).))))))))))))
RDfolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.................((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((................(((((((.......)))))))...(((((.......))))))))))))
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((.......(((.....(((((((.......)))))))..)))(((.......))).))))))))
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((.......(((.....(((((((.......)))))))..)))(((.......))).))))))))
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((.......(((.....(((((((.......)))))))..)))(((.......))).))))))))
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...(((......).)).((((((.......))))))....(((((.((..))))))))))))))
RNAwolf	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...((.........)).((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((........((.....(((((((.......)))))))..)).(((.......))).))))))))
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((.......(((.....(((((((.......)))))))..)))(((.......))).))))))))
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..(((.........)))((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..(((.........)))((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))

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