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GGUGCCCGUCUGUUGUGUGACUCUGGUGAGAGCCAGAGGAGAUCUCUCGACGCAGGACUCGGCUUGCUGGAGACGGCAAGAGGCGAGGGGCGGCGACUGGUGAGUACGCCAAAAAUUUUGACUAGCGGAGGCUAGAAGGAGAGAGAUGGGUGCCC |
| Reference structure (std) |
|
[ sec struct ] |
(((((((((((...((((..(((((((....)))))))...(((..(((.(((....((((.(((((((....)))))))...))))..))).)))..)))....)))).......(((..(((((....)))))..)))...))))))))))).
|
| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((.(((((((((..)))))))))..((((((((((((((..(((((((((((((..)))))))))..))))))))))))))))))....)))).).....((((((((((....)))))))))).))))))))))))).
|
|
Afold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((..((((((..........(((((((....)))))))....((((((...((....((((.(((((((....)))))..)).))))..))......(((((....)))))..........(((((....)))))...))))))))))))..).) |
|
CMfinder(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.........................................................((((.(((((((....)))))))...)))).................................................................... |
|
Carnac(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..............................................................(((((((....)))))))........................................................................... |
|
Carnac(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..............................................................(((((((....)))))))........................................................................... |
|
CentroidAlifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.........................................................((((.(((((((....)))))))...)))).................................................................... |
|
CentroidAlifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.........................................................((((.(((((((....)))))))...)))).................................................................... |
|
CentroidFold
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((........((((((((....)))))))).....((.((.(((....((((.(((((((....)))))))...))))..))).))..(((((....)))))..........(((((....))))).....)).))))))))))). |
|
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((.........(((((((....))))))).....(((((..(((....((((.(((((((....)))))))...))))..))).....(((((....)))))..........(((((....)))))...)))))))))))))))). |
|
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..........(((((((....)))))))....((((((.........((((.(((((((....)))))))...)))).((((((.........)).))))...........(((((....)))))...)))))))))))))))). |
|
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((.........(((((((....))))))).....((((((.(((....((((.(((((((....)))))))...))))..))).)...(((((....)))))..........(((((....)))))...)))))))))))))))). |
|
DAFS(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((......................................................(((((((....)))))))..................................................................))))..... |
|
DAFS(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((......................................................(((((((....)))))))..................................................................))))..... |
|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((.........(((((((....))))))).....(((((....(((((((((.(((((((....)))))))...))))....(((((((....))).)))).....))))).(((((....)))))...)))))))))))))))). |
|
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((.((.((((.(((((((....)))))))(((....)))..)))).).((((.(((((((....)))))))...))))....(((((((....))).))))......(((..(((((....)))))..))).).))))))))))). |
|
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((..((((((..........(((((((....)))))))....((((((..(((....((((.(((((((....)))))..)).))))..))).....(((((....)))))..........(((((....)))))...))))))))))))..)). |
|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((.........(((((((....))))))).....(((((..(((....((((.(((((((....)))))))...))))..))).((((([[..))).))]]...........(((((....)))))...)))))))))))))))). |
|
MXScarna(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.........................................................((((.(((((((....)))))))...)))........................................................)............ |
|
MXScarna(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.........................................................((((.(((((((....)))))))...)))........................................................)............ |
|
Mastr(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
........................................................................................................................................................... |
|
Mastr(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...((((.(((((((..(....)..................................................)))))))...)))).................................................................... |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((.(.(((...(((((((....)))))))(((....)))..)))....((((.(((((((....)))))..)).))))....(((((((....))).))))......(((..(((((....)))))..))).).))))))))))). |
|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..........(((((((....)))))))....((((((..(((....((((.(((((((....)))))))...))))..))).....(((((....)))))..........(((((....)))))...)))))))))))))))). |
|
Multilign(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...............................(((((......(((((((.............(((((((....)))))))...)))))))......)))))...................................................... |
|
Multilign(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..............................................(((.(((....((((.(((((((....)))))))...))))..))).)))........................................................... |
|
Murlet(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
........................................................................................................................................................... |
|
Murlet(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.........................................................(((...((((((.....................................))))))...............)))......................... |
|
NanoFolder
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((.((((((..(((((((....)))))))....[[[[[[[)))))).{{{{{.(((((((<<<<)))))))...]]]]]]]...}}}.<<<<<.}}.>>>>>....>>>>..(((((....)))))........))))))))))). |
|
PETfold_2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.........................................................((((.((((((((..))))))))...)))).................................................................... |
|
PETfold_2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.........................................................((((.((((((((..))))))))...)))).................................................................... |
|
PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.........................................................((((.((((((((..))))))))...)))).................................................................... |
|
PETfold_pre2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.........................................................((((.((((((((..))))))))...)))).................................................................... |
|
PPfold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.........................................................((((.((((((((..))))))))...)))).................................................................... |
|
PPfold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.........................................................((((.(((((((....)))))))...)))).................................................................... |
|
Pknots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..((....))(((((((....)))))))....((((((..(((....((((.(((((((....)))))))...))))..)))((((((....))).)))(((.....))).(((((....)))))...)))))))))))))))). |
|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((..((((((..........(((((((....)))))))....((((((..(((....((((.(((((((....)))))))...))))..))).....(((((....)))))..........(((((....)))))...))))))))))))..)). |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((..(((((..(((((((....)))))))(((....))).)))))...((((...(((((....))))).....))))....(((((((....))).)))).....((((..(((((....)))))..))))..))))))))))). |
|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..........(((((((....)))))))....((((((....(((((((((.(((((((....)))))))...)))).((((..............)))).....))))).(((((....)))))...)))))))))))))))). |
|
RNASampler(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......(((((...................................................(((((((....)))))))...............................................................)))))....... |
|
RNASampler(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......((((...................................................(((((((....)))))))...............................................................))))........ |
|
RNAalifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..............................................................((((((......))))))........................................................................... |
|
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.........................................................((((.(((((((....)))))))...)))).................................................................... |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((..((((((..........(((((((....)))))))....((((((..(((....((((.(((((((....)))))))...))))..))).....(((((....)))))..........(((((....)))))...))))))))))))..)). |
|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..........(((((((....)))))))....((((((....(((((((((.(((((((....)))))))...))))....(((((((....))).)))).....))))).(((((....)))))...)))))))))))))).)) |
|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((..((((((..........(((((((....)))))))....((((((...((....((((.(((((((....)))))))...))))..))(((((((....))).))))...........(((((....)))))...))))))))))))..)). |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((..))....(((((((((..)))))))))..((((((((.(.(.(.((((((((((((((..)))))))))..))))).((((((.......))).)))((((...)))).(((((..)..))))))).))))))))))))))). |
|
RNAwolf
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((..))....((((((((....))))))))..(((((((..(......((((.(((((((....)))))))...))))...((((.........)).)).((((...)))).((((......))))..)..)))))))))))))). |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((..((((((..........(((((((....))))))).....(((((...((....((((.(((((((....)))))..)).))))..)).......(((......)))...........(((((....)))))...))))).))))))..)). |
|
TurboFold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((.(.......(((((((....))))))).......(((..(((....((((.(((((((....)))))..)).))))..)))..)).(((((....)))))..........(((((....))))).....)).))))))))))). |
|
TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((.(.......(((((((....))))))).......(((..(((....((((.(((((((....)))))..)).))))..)))..)).(((((....)))))..........(((((....))))).....)).))))))))))). |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((..((((((..........(((((((....)))))))....((((((..(((....((((.(((((((....)))))..)).))))..))).....(((((....)))))..........(((((....)))))...))))))))))))..)). |
|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((..(((((......(((....))).((((.....)))).)))))...((((.(((((((....)))))))...)))).((((((.........)).)))).....((((..(((((....)))))..))))..))))))))))). |
|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((.........(((((((....)))))))....(((((.....((((.((((.(((((((....)))))))...)))).((((((.........)).))))......)))).(((((....)))))..))))).))))))))))). |
