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RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 2WRQ_Y



RNA: 2WRQ_Y
Rfam family: tRNA

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Reference structure (std) [ sec struct ] .((...(..(..............)..((((.......)))).......(.............).)...)).....
Reference structure (ext) [ sec struct ] .((.(.({<(...}....(..(>.)..((((.......))))...)...[...[.).].....].)..))).....
           (          )                                                     
       (            )                                                       
Afold [ FASTA input ] [ sec struct ] N/A
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((((...))))))).....(((((.......))))))))))))....
Carnac(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((((...))))))).....(((((.......))))))))))))....
CentroidAlifold(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((............................................................))))))....
CentroidAlifold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
CentroidFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).((((((.....)))))).....(((((.......))))))))))))....
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).((((((.....)))))).....(((((.......))))))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((((...))))))).....(((((.......))))))))))))....
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((((...))))))).....(((((.......))))))))))))....
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((...)))).(((((((((((((((((((((...))))))))))))((((((...)..))))))))))))))..
MCFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((...))))...(((((((((.(.(((((((...))))))).).))(((((.......))))))))))))....
MXScarna(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
MXScarna(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((((...))))))).....(((((.......))))))))))))....
Mastr(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ............................................................................
Mastr(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).((((((.....)))))).....(((((.......))))))))))))....
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((........)))).(((((((...))))))).....(((((.......))))).))))))....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((((...))))))).....(((((.......))))))))))))....
Murlet(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((....((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))).....))))).
PETfold_pre2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.(...).))))).....(((((.......))))))))))))....
PETfold_pre2.0(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).((((((.....)))))).....(((((.......))))))))))))....
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((........)))).(((((((...))))))).....(((((.......))))).))))))....
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).((((((.....)))))).....(((((.......))))))))))))....
RNASampler(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((((...))))))).....(((((.......))))))))))))....
RNAalifold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((((...))))))).....(((((.......))))))))))))....
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((((...)))))))......((((.......)))).)))))))....
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).((((((.....)))))).....(((((.......))))))))))))....
RSpredict(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (.((...................................................................)).).
RSpredict(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))...).
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((........)))).(((((((...))))))).....(((((.......))))).))))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((((...))))))).....(((((.......))))))))))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((........)))).((((((.....)))))).....(((((.......))))).))))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((........)))).((((((.....)))))).....(((((.......))))).))))))....