RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 2WWQ_V

RNA: 2WWQ_V
Rfam family: tRNA

			CGGCACGUAGCGCAGCCUGGUAGCGCACCGUCAUGGGGUGUCGGGGGUCGGAGGUUCAAAUCCUCUCGUGCCGACCA
Reference structure (std)		[ sec struct ]	(((((((..((((.........)))).(((.(.......).))).....((.((.......)).)))))))))....
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	((((((((.[[[[)(.......]]].((((.((....).).))))]..)((.(((...)..)).)))))))))....                                (        )                                                  (       )                                                                              (                       )                                        (               )
Alterna	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((.((...)).)))).(((.(((...))).))).....(((((.......))))))))))))....
CentroidAlifold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.............................................................))))))....
CentroidFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((.((...)).)))).(((.(.......).))).....(((((.......))))))))))))....
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((.((...)).)))).(((.(.......).))).....(((((.......))))))))))))....
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((.((...)).)))).(((.((.....)).))).....(((((.......))))))))))))....
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((.........)))).(((.(((...))).)))......((((.......)))).)))))))....
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((.((...)).)))).(((.(((...))).))).....(((((.......))))))))))))....
MCFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((..(((..((((.((...)).))))..)))..))((.((.((.(((..(((..(..)..))).))).)).)).)).
MCFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((((((...))))))))))))))))(((((((((((((.((((((..))))))))))))))))))).
MXScarna(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((.........))))..((((.......))))......(((((.......)))))))...))))).
Mastr(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.............................................................................
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((.........)))).(((.(((...))).)))......((((.......)))).)))))))....
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.............................................................................
PETfold_pre2.0(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((.........)))).(((((.(...).))))).....(((((.......))))))))))))....
Pknots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((...((((.........)))).((.....)).))))))..(((((((((.......)))(....))))))).
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((.((...)).)))).(((.(((...))).))).....(((((.......))))))))))))....
RDfolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((.........))))(((................)))..((((.......)))).)))))))....
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((.((...)).)))).(((.(((...))).))).....(((((.......))))))))))))....
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((.((...)).)))).(((.(((...))).))).....(((((.......))))))))))))....
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((.((...)).)))).(((.(((...))).))).....(((((.......))))))))))))....
RSpredict(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(.(..........................................((.........(..)....(.).).)).)..
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((.........)))).(((.((.....)).))).....(((((.......))))))))))))....
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((.........)))).(((.(((...))).))).....(((((.......))))))))))))....
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((.........))))(((.......)))...........((((.......)))).)))))))....
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((.........))))(((.......)))...........((((.......)))).)))))))....

---