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CUCUGUUGGUUCUCUGUGCUCUGUGCUCUGUUUACCAGGUCAGGUCCGAAAGGAAGCAGCCAAGGCAGAGACGCAGAGCAGGCAGAUGUAGCUGGC |
Reference structure (std) |
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[ sec struct ] |
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Reference structure (ext) |
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[ sec struct ] |
.........(...(((...(((.....((((......((....(((.(.)..)).)...))...))).).....)).).....)))...)...... ( ) ( ) ( )
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Alterna
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Carnac(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
................................................................................................ |
Carnac(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
............................................(((....))).......................................... |
CentroidAlifold(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.....(((((.(((((((((((((..(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...)))))).)).)))))...))))). |
CentroidAlifold(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....(((((((((((((((((((((((((((((....(((....(((....)))....))).)))))))).))))))))..))))).).))))))) |
CentroidFold
(ext)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Contrafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Cylofold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Fold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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HotKnots
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((..(((((((((((((((((((((((((....(((....(((....)))....))).)))))))).))))))))..))))).).)))..)) |
MCFold
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((((((((((((((((((((((((((((((((....))))))(((((..))))).(((((..))))))).)))))))))))))))))))))))). |
MCFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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MXScarna(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......((((.((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..)))))).)))))).)).).)))..)))).... |
MXScarna(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....................................((((....(((....)))....)))).................................. |
Mastr(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
................................................................................................ |
Mastr(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....................................((((....(((....)))....)))).................................. |
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....(((((((.(((((((((((((((((((((....(((....(((....)))....))).)))))))).))))))))..)))))...))))))) |
McQFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....(((((((.((((((((((((((((((((((((......))).................)))))))).)))))))))..))))...))))))) |
Murlet(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....................................(((.....(((....))).....))).................................. |
Murlet(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....................................((((....(((....)))....)))).................................. |
PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
............((((((((((((..(((((.....(((.(.(.(((....)))..).))))..)))))...)))))).)).)))).......... |
PETfold_pre2.0(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....................................((((....(((....)))....)))).................................. |
Pknots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((((((((((((((((((((((((((((......)))((....)))))).((....)))))).))))))))..))))).).))))))) |
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((..(((.(((((((((((((((((((((....(((....(((....)))....))).)))))))).))))))))..)))))...)))..)) |
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....(((((((.(((((((((((((((((((((....(((....(((....)))....))).)))))))).))))))))..)))))...))))))) |
RDfolder
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((((......((((((((((((....((((((....................))))))......))))).)))))))....)))).......... |
RNASampler(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.....................................(((....(((....)))....)))................................... |
RNAalifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
............................(((.....(((.....(((....))).....)))..)))............................. |
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....................................((((....(((....)))....)))).................................. |
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((..(((((((((((((((((((((((((....(((....(((....)))....))).)))))))).))))))))..))))).).)))..)) |
RNAshapes
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((..(((((((((((((((((((((((((....(((....(((....)))....))).)))))))).))))))))..))))).).)))..)) |
RSpredict(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.........................(.((.((..(..(((....(((....)))....)))...................)..)))....)...). |
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.................................................................(((..........(.....)......))).. |
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((..(((((((((((((((((((((((((....(((....(((....)))....))).)))))))).))))))))..))))).).)))..)) |
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((..(((.((((((((((((((((((..(....(((....(((....)))....))).)..))))).))))))))..)))))...)))..)) |
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((((((....(((((((((((((...((((((.((..[[[[[........)))))))).....)))))).)))))))..)))))).....]]]]] |