RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 2XKV_B

RNA: 2XKV_B
Rfam family: Bacteria_small_SRP

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Reference structure (std)		[ sec struct ]	.........(....(....((.......(((......((.....((......)).....))...)))........).)......)....)......
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	.........(...(((...(((.....((((......((....(((.(.)..)).)...))...))).).....)).).....)))...)......                                            (          )                                                                     (                                       )                                                                          (       )
Alterna	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....(((((((.((((((((((((.((((((((....(((...((((....))..)).))).))))))))..)))))))..)))))...)))))))
Carnac(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	................................................................................................
Carnac(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	............................................(((....)))..........................................
CentroidAlifold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....(((((.(((((((((((((..(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...)))))).)).)))))...))))).
CentroidAlifold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....................................(((((((((((....)))))))))))..................................
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....(((((((((((((((((((((((((((((....(((....(((....)))....))).)))))))).))))))))..))))).).)))))))
CentroidFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....(((((((((((((((((((((((((((((....(((....(((....)))....))).)))))))).))))))))..))))).).)))))))
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....(((((((((((((((((((((((((((((....(((....(((....)))....))).)))))))).))))))))..))))).).)))))))
Cylofold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((.........(((((((((((((((((.....[[[[[.(((....)))........)))))))).))))))))))))))).....]]]]]
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....(((((((.(((((((((((((((((((((....(((....(((....)))....))).)))))))).))))))))..)))))...)))))))
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....((..(((((((((((((((((((((((((....(((....(((....)))....))).)))))))).))))))))..))))).).)))..))
MCFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((((((((((((((((((((((((((((....))))))(((((..))))).(((((..))))))).)))))))))))))))))))))))).
MCFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((.((((..(((.(.((((((((((((((.((....)).))).(((....)))..(.(((..))).))).))))))))).).)))..)))).)).
MXScarna(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.......((((.((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..)))))).)))))).)).).)))..))))....
MXScarna(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....................................((((....(((....)))....))))..................................
Mastr(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	................................................................................................
Mastr(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....................................((((....(((....)))....))))..................................
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....(((((((.(((((((((((((((((((((....(((....(((....)))....))).)))))))).))))))))..)))))...)))))))
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....(((((((.((((((((((((((((((((((((......))).................)))))))).)))))))))..))))...)))))))
Murlet(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....................................(((.....(((....))).....)))..................................
Murlet(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....................................((((....(((....)))....))))..................................
PETfold_pre2.0(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	............((((((((((((..(((((.....(((.(.(.(((....)))..).))))..)))))...)))))).)).))))..........
PETfold_pre2.0(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....................................((((....(((....)))....))))..................................
Pknots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....((((((((((((((((((((((((((((((((......)))((....)))))).((....)))))).))))))))..))))).).)))))))
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....((..(((.(((((((((((((((((((((....(((....(((....)))....))).)))))))).))))))))..)))))...)))..))
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....(((((((.(((((((((((((((((((((....(((....(((....)))....))).)))))))).))))))))..)))))...)))))))
RDfolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((......((((((((((((....((((((....................))))))......))))).)))))))....))))..........
RNASampler(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....................................(((....(((....)))....)))...................................
RNAalifold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	............................(((.....(((.....(((....))).....)))..))).............................
RNAalifold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....................................((((....(((....)))....))))..................................
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....((..(((((((((((((((((((((((((....(((....(((....)))....))).)))))))).))))))))..))))).).)))..))
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....((..(((.(((((((((((((((((((((....(((....(((....)))....))).)))))))).))))))))..)))))...)))..))
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....((..(((((((((((((((((((((((((....(((....(((....)))....))).)))))))).))))))))..))))).).)))..))
RSpredict(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.........................(.((.((..(..(((....(((....)))....)))...................)..)))....)...).
RSpredict(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.................................................................(((..........(.....)......)))..
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....((..(((((((((((((((((((((((((....(((....(((....)))....))).)))))))).))))))))..))))).).)))..))
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....((..(((.((((((((((((((((((..(....(((....(((....)))....))).)..))))).))))))))..)))))...)))..))
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((....(((((((((((((...((((((.((...............)))))))).....)))))).)))))))..))))))..........
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((....(((((((((((((...((((((.((..[[[[[........)))))))).....)))))).)))))))..)))))).....]]]]]

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