RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 2XXA_G

RNA: 2XXA_G
Rfam family: Bacteria_small_SRP

			GCAUUGCUGGUGCAGCGCAGCGCGGACGCCCGAACCUGGUCAGAGCCGGAAGGCAGCAGCCAUAAGGGAUGCUUUGCGGGUGCCGUUGCCUUCCGGCAAUGC
Reference structure (std)		[ sec struct ]	(.((((((((.((((((((.(((((((((((.....((((....(((....)))....))))...))).)).))))))..)).))))))...)))))))).)
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	((((((((((.((((((((((((((((((((((...((((...(((((..)))))...))))).))).))).))))))).)).))))))...))))))))))                             (                                      )
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((...((.(((..((((.((((((............(((....))).(((.((.....)).)))....))))))))))))))).))))))))))
Carnac(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......................................................................................................
Carnac(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	............................................(((....)))................................................
CentroidAlifold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......(((((.(((((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))...)))))...)))))).)).)))))...)))))......
CentroidAlifold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....................................(((((((((((....)))))))))))........................................
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.......................................(((((((((((((.((..(((((....))))).....)).))))))))))))))))))
CentroidFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.......................................(((((((((((((.((..(((((....))))).....)).))))))))))))))))))
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.((((..(......(((....)))........).)))).(((((((((((((.(((.(((((....)))))..)..)).))))))))))))))))))
Cylofold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.[[[[))))....]]]].....((((((....((((....{{{{{{{{{{{{{.))))(((((....)))))))))))..}}}}}}}}}}}}}.....
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((.((((((((.(((((((((((.....((((....(((....)))....))))...))).)).))))))..)).))))))...))))))))))
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((...((.(((..((((.((((((............(((....))).(((.((.....)).)))....))))))))))))))).))))))))))
MCFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((...((.((((((.(..((((((...(((((....)))))((((((.(..((....))).)))))).))))))))))))))).))))))))))
MCFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((..((.((((((.(..(((((((..(((((....)))))((((((((..((....)))))))))))))))))))))))))))))))))))))
MXScarna(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...(((((((((.((((.(((.(((.(((((.....((((....(((....)))....))))...))).)).))).))..))..))).)..))))))))...
MXScarna(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...((((((((((((((((.(((((((((((.....((((....(((....)))....))))...))))))..)))))..)).)))))).).)))))))...
Mastr(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......................................................................................................
Mastr(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....................................((((....(((....)))....))))........................................
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((...((.(((..((((.((((((...(((((....)))))..(((....)))..((((....)))).))))))))))))))).))))))))))
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((......((((((....((((((........((((((.....(((....))).........)))))))))))).))))))...))))))))))
Multilign(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	............................................((((((((((((.............................)))))))))))).....
Murlet(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....................................(((.....(((....))).....)))........................................
Murlet(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....................................((((....(((....)))....))))........................................
PETfold_pre2.0(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.............((((((((((((.(((((.....(((.(.(.(((....)))..).))))...)))))...)))))).)).))))...............
PETfold_pre2.0(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....................................((((....(((....)))....))))........................................
Pknots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((...((.(((..((((.(((((((......)(((((((....))).(((.((.....)).)))))))))))))))))))))).))))))))))
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((...((.(((..((((.((((((............(((....))).(((.((.....)).)))....))))))))))))))).))))))))))
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((....(.(((....((.((((((...(((((....)))))..(((....))).(((((....)))))))))))))..))))..))))))))))
RNASampler(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....................................((((..................))))........................................
RNAalifold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	............................(((.....(((.....(((....))).....)))...)))..................................
RNAalifold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....................................((((....(((....)))....))))........................................
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((...((.(((..((((.((((((............(((....))).(((.((.....)).)))....))))))))))))))).))))))))))
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((.((((((((.(((((((((((.....((((....(((....)))....))))...))).)).))))))..)).))))))...))))))))))
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((.(((((((...))((.((((((............(((....)))((((.((.....)).))))...)))))))))))))...))))))))))
RSpredict(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..........................(((((.....((((......(.....).....))))...))).....................).....)......
RSpredict(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	............................((......((((....(((....)))....))))....))..................................
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((...((.(((...(((.((((((............(((....))).(((...........)))....))))))))).))))).))))))))))
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((...((.(((..((((.((((((............(((....))).(((.((.....)).)))....))))))))))))))).))))))))))
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....((((........)))).(((.((((((...(((((....))))).(((((....((.....)).)))))..))))))))).((((....))))....
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.[[[[))))....]]]].....((((((...(((((....))))).....(((..((.....))..)))...)))))).(((((((....))))))).

---