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RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 2Y9C_V



RNA: 2Y9C_V
Rfam family: -

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Reference structure (std) [ sec struct ] ((..((.(((((....))))).))..).)..........(((((((..((....))...)))))))..
Reference structure (ext) [ sec struct ] (((.(((((((((..))))))))).)).)..........((((((((.(((..))))..)))))))..
                                              (           )         
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((.(((((....))))).)).)))).........((((((((.((((...)))).)))))))).
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((.(((((....))))).))).))).........((((((((.((((...)))).)))))))).
CentroidFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((.(((((....))))).))).))).........((((((((.((((...)))).)))))))).
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] ........(..........)................................................
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((.(((((....))))).))).))).........((((((((.((((...)))).)))))))).
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((...(((((....)))))....)))).........((((((((.((((...)))).)))))))).
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((.(((((....))))).)).)))).........((((((((.((((...)))).)))))))).
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((.(((((....))))).)).)))).........((((((((.((((...)))).)))))))).
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((((((((..))))))))).((((((...))))))(((((((((((...))))))))))))))
MCFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((.(((((....))))).)).((.(((...))).))((((((.((((...)))).)))))))))
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((.(((((....))))).)).)))).........((((((((.((((...)))).)))))))).
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((...(((((....)))))....)))).........((((((((.((((...)))).)))))))).
Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] .......(((((....)))))((....)).........((((((((.(((.....))).)))))))).
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((.(((((....))))).))).))).........((((((((.((((...)))).)))))))).
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((.(((((....))))).)).)))).........((((((((.((((...)))).)))))))).
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] (((....(((((....))))).....))).........(((((((..((((...))))..))))))).
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((.(((((....))))).)).)))).........((((((((.((((...)))).)))))))).
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((.(((((....))))).)).)))).........((((((((.((((...)))).)))))))).
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((.(((((....))))).))).))).........((((((((.((((...)))).)))))))).
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((.(((((....))))).)).)))).........((((((((.((((...)))).)))))))).
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((.(((((....))))).)).)))).........(((((((..((((...))))..))))))).
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((...(((((....)))))....)))..........((((((((.............)))))))).
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((...(((((....)))))....)))).........((((((((.(((.....))).)))))))).