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RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 2ZZN_D



RNA: 2ZZN_D
Rfam family: tRNA

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Reference structure (std) [ sec struct ] (((((((..((([....(..]))).(((((.......))))).....(((((..)....))))))))))))
Reference structure (ext) [ sec struct ] ((((((((.[[[[)<.{(..]]]].((((((.....))))))....>((((((}).)..))))))))))))
Afold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((((...))))))..(((((....).))))......(((((.......))))))))))))
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((((...)))))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))
CentroidAlifold(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...........................................................))))))
CentroidFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((((...)))))).((((((....).))))).....(((((.......))))))))))))
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((((...)))))).((((((....).))))).....(((((.......))))))))))))
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((((...)))))).((((((....).))))).....(((((.......))))))))))))
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((((...)))))).((((((....).))))).....(((((.......))))))))))))
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MCFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((..))))))(..((((((((..)).)))).))..)(((((.......))))))))))))
MXScarna(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......))))..((((.......))))......(((((.......))))))))))))
Mastr(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] .......................................................................
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((((...)))))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))
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Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((((.....))))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))
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RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((((...)))))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))
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RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((..(((((....((((....))))....)).))).))(((((.......))))))))))))
RSpredict(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((................................................(...)..........))))
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((((...)))))).((((((....).))))).....(((((.......))))))))))))
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((((...)))))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((((.....))))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((((.....))))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))