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RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 3A2K_C
RNA: 3A2K_C
Rfam family:
tRNA
| GGACCUUUAGCUCAGUUGGUUAGAGCAGACGGCUCAUAACCGUCCGGCCGUAGGUUCGAGUCCUACAAGGUCCACCA | |||
| Reference structure (std) | [ sec struct ] | (((((((..((([.....(...]))).(((((.......))))).....(((((..)....)))))))))))).... | |
| Reference structure (ext) | [ sec struct ] |
((((((((.{{{)a...[(..A(}}}.(((((.......)))))..).(<<<<<(]).)).>>>>>))))))).... ( ) |
|
| Afold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | N/A |
| Alterna | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((..(.((((((((((.....)))).)))))).).))).(((((.......)))))))))))).... |
| Carnac(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((....................(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| CentroidAlifold(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.............................................................)))))).... |
| CentroidAlifold(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| CentroidFold (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((..(.((((((((((.....)))).)))))).).))).(((((.......)))))))))))).... |
| CentroidFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((..(.((((((((((.....)))).)))))).).))).(((((.......)))))))))))).... |
| Contrafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((..(.((((((((((.....)))).)))))).).))).(((((.......)))))))))))).... |
| HotKnots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...(((....((((((((((.....)))).))))))...))).(((((.......))))).)))))).... |
| MCFold (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((((((((((((((((...))))).)))))))))))))((((((...)..)))))))))))).... |
| MCFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(.((.(.((((((((((.....)))).)))))).).)).)(((((.......)))))))))))).... |
| MXScarna(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.........))))..((((.......))))......(((((.......)))))))))))).... |
| MXScarna(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.(((.......)))..(.(((((((.......))))))).)..((((.......)))).))))))).... |
| Mastr(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ............................................................................. |
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| MaxExpect | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...(((....((((((((((.....)))).))))))...))).(((((.......))))).)))))).... |
| McQFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| Murlet(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))...)). |
| PETfold_pre2.0(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.........)))).(((((.(...).))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| PETfold_pre2.0(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| Pknots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((....((((((((((.....)))).))))))...))).(((((.......)))))))))))).... |
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| RDfolder | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).... |
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| RNAsubopt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...(((....((((((((((.....)))).))))))...))).(((((.......))))).)))))).... |
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| RSpredict(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))...)). |
| Sfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...(((....((((((((((.....)))).))))))...))).(((((.......))))).)))))).... |
| UNAFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...(((....((((((((((.....)))).))))))...))).(((((.......))))).)))))).... |
| Vsfold4 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))).)))))).... |
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