RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 3A3A_A

RNA: 3A3A_A
Rfam family: tRNA-Sec

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Reference structure (std)		[ sec struct ]	(((((((.(..((((([..(.])))))((((((.......)))))).(((((....))))).((((..)....))))).)))))))
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	(((((((((..(((((({[{.))))))(((((((..)...))))))((((((....))))))(((((]}.)}.)))))))))))))                    ()
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((....((((((....))))))..((((.......))))...(((((....))))).((((.......))))..)))))))
Alterna	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((......((((((....))))))((((((.......)))))).(((((....))))).((((.......))))....)))))
Carnac(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......................................................................................
CentroidAlifold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((....((((((....)))))).(((((.......)))))..(((((....))))).((((.......))))..)))))))
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CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((....((((((....))))))((((((.......)))))).(((((....))))).((((.......))))..)))))))
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((....((((((....))))))((((((.......)))))).(((((....))))).((((.......))))..)))))))
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((....((((((....))))))((((((.......)))))).(((((....))))).((((.......))))..)))))))
MCFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((..(((((((..)))))))((((((((...))))))))((((((....))))))(((((...)..)))))))))))))
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MXScarna(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((....(.(((....)).))..(((((.......)))))...(((((..))))).(((((.......)))))))))))))
Mastr(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......................................................................................
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((....((((((....))))))((((((.......)))))).(((((....))))).((((.......))))..)))))))
Murlet(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((........................(((((.......))))).................((((.......)))).....))).
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Pknots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((....((((((....))))))((((((.......)))))).(((((....))))).((((.......))))..)))))))
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RDfolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((.............)))))).((((((.......)))))).(((((....))))).((((.......)))).........
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RNAalifold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((......................((((.......))))....((((....))))..((((.......))))..)))))))
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((....((((((....))))))((((((.......)))))).(((((....))))).((((.......))))..)))))))
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RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((....((((((....))))))((((((.......)))))).(((((....))))).((((.......))))..)))))))
RSpredict(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....((.....(((.......(.))))..((((.......))))..................((((.......)))).))......
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((....((((((....))))))((((((.......)))))).(((((....))))).((((.......))))..)))))))
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((....((((((....))))))((((((.......)))))).(((((....))))).((((.......))))..)))))))
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((....((((((....)))))).(((((.......)))))..(((((....))))).((((.......))))..)))))))
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((....((((((....)))))).(((((.......)))))..(((((....))))).((((.......))))..)))))))

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