RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 3AKZ_H

RNA: 3AKZ_H
Rfam family: tRNA

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Reference structure (std)		[ sec struct ]	.((((((..((((.......)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))).....
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	((((((((.[[[[)(.....]]]].((((((.....))))))...)((((((...)..))))))))))))....              (     )                                                              (                                    )                                                  (                       )
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((..((.(((((.......)))))..((((((..(.((((....))))..)..)))))).......))..)))
Alterna	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((.......)))))).((((((.(((((((....)))..))))))))))...)))))))....
CentroidAlifold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((..........................................................))))))....
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CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((.......)))))).((((((....((((....)))).....))))))...)))))))....
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((.......)))))).((((((.((((((((())))))..)))))))))...)))))))....
Cylofold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...((((....)))).((((((.........))))))..(((((.......))))))))))))....
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.(((((.......)))))(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.(((((.......)))))..((((((..(.((((....))))..)..))))))...)))))))....
MCFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.(((((.(...).)))))(.((((((..((.((.((...)).)).)))))))).).)))))))....
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MXScarna(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((.......)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
Mastr(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..........................................................................
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McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((...)))).....(((((((.......)))))))..(((((.......))))))))))))....
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Pknots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.(((((.......)))))(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
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RDfolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.(((...)))...((((((((((.......)))))))..(((........)))))))))))))....
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RSpredict(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(............................................(...................)....)..
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.(((((.......)))))..((((((....((((....)))).....))))))...)))))))....
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.(((((.......)))))..((((((..(.((((....))))..)..))))))...)))))))....
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.(((.....))).....(((((((.......)))))))..(((((.......))))).))))))....
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((...((((.......)))).(((((.......)))))....(((((.......))))).))))))....

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