RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 3AMU_B

RNA: 3AMU_B
Rfam family: tRNA

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Reference structure (std)		[ sec struct ]	(((((.(..((((..........)))).((((.........)))).....(((((.......)))))).)))))....
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	((((((((({{.[)<....(...])}}.((((.........))))....>((((((.).)..))))))))))))....            (            )                                                                             (                       )                                            (        )
Alterna	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((....))))..((.(((((((.......))))))).))(((((.......))))))))))))....
CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((....)))).....(((((((.......)))))))...(((((.......))))))))))))....
Carnac(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((................((((((((((.......))))))))))(((((.......))))))))))))....
CentroidAlifold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((..............................................................))))))....
CentroidAlifold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((..........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
CentroidFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((................((.(((((((.......))))))).))(((((.......))))))))))))....
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((................((.(((((((.......))))))).))(((((.......))))))))))))....
CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...(((..........)))(((((((.......)))))))...(((((.......))))))))))))....
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..(((......)))..((.(((((((.......))))))).))(((((.......))))))))))))....
Cylofold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((....)))).....(((((((.......)))))))...(((((.......))))))))))))....
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((....))))..((.(((((((.......))))))).))(((((.......))))))))))))....
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((................((.(((((((.......))))))).))(((((.......))))))))))))....
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((................((.(((((((.......))))))).))(((((.......))))))))))))....
MCFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..(..(.(((.(((.((((((..).)))).).))).))).).)(((((.......))))))))))))....
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MXScarna(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((..........))))..((((.......))))......(((((.......))))))))))))....
MXScarna(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((..........))))((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))....
Mastr(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..............................................................................
Mastr(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.....................(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((....))))..((.(((((((.......))))))).))(((((.......))))))))))))....
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...................(((((((.......)))))))...(((((.......))))))))))))....
Multilign(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((...((((....))))...(.(((((((.......))))))).).(((((.......))))).))))))....
Murlet(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((..........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))...)).
PETfold_pre2.0(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((..........)))).(((((.(...).))))).....(((((.......))))))))))))....
PETfold_pre2.0(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((..........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
PPfold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..............................................................................
PPfold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((..........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
Pknots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((..........))))((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))....
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((................((.(((((((.......))))))).))(((((.......))))))))))))....
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((....)))).....(((((((.......)))))))...((((((....).))))))))))))....
RDfolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((..........))).(((.....(((((((.......))))))).....(((((((........)))))))))).
RNASampler(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...(((..........)))(((((((.......)))))))...(((((.......))))))))))))....
RNAalifold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((..........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((................((.(((((((.......))))))).))(((((.......))))))))))))....
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((................((.(((((((.......))))))).))(((((.......))))))))))))....
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((................((.(((((((.......))))))).))(((((.......))))))))))))....
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((........))..((((((((((..(...)))))))))))((((((...)..))))))))))))....
RNAwolf	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((........))..((.(((((((.......))))))).))(((((.......))))))))))))....
RSpredict(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((.........................................................................)).
RSpredict(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...........................................(((((.......)))))))))))...).
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((................((.(((((((.......))))))).))(((((.......))))))))))))....
TurboFold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((................((.(((((((.......))))))).))(((((.......))))))))))))....
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((................((.(((((((.......))))))).))(((((.......))))))))))))....
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((...((((....)))).....(((((((.......)))))))...(((((.......))))).))))))....
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((....)))).....(((((((.......)))))))...(((((.......))))))))))))....

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