CompaRNA - on-line benchmarks of RNA structure prediction methods
Home

Methods
Datasets
Rankings
RNA 2D Atlas

Help
FAQ

Contact us
RSS feeds
Twitter

RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 3HAY_E



RNA: 3HAY_E
Rfam family: -

GGCUGCCUGGGUCCGCCUUGAGUGCCCGGGUGAGAAGCAUGAUCCCGGGUAAUUAUGGCGGACCCACA
Reference structure (std) [ sec struct ] ........(((((((.(.......((((((.............)))))).......).)))))))...
Reference structure (ext) [ sec struct ] ........(((((((((.......(((((((((.......))))))))).......)))))))))...
Afold [ FASTA input ] [ sec struct ] (......((((((((((.(((.((((((((.............)))))))).))).)))))))))).)
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] ...((..((((((((((.(((.((((((((.............)))))))).))).))))))))))))
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] .......((((((((((.(((.((((((((.............)))))))).))).))))))))))..
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] .......((((((((((.(((.((((((((.............)))))))).))).))))))))))..
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ...((..(((((((((((((((((((((((((((.....)))))))))))))))))))))))))))))
MCFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ...((..((((((((((.(((.((((((((...(.....)...)))))))).))).))))))))))))
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .......((((((((((.....((((((((.............)))))))).....))))))))))..
Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] .......((((((((((.....((((((((((.....))....)))))))).....))))))))))..
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] .......((((((((((.(((.((((((((.............)))))))).))).))))))))))..
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] .......((((((((((.(((.((((((((.............)))))))).))).))))))))))..
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] .......((((((((((.(((.((((((((.............)))))))).))).))))))))))..
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] ((...)).(((((((((.....((((((((.............)))))))).....)))))))))...
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] .......((((((((((.....((((((((.............)))))))).....))))))))))..
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] .......((((((((((.(((.((((((((.............)))))))).))).))))))))))..
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .......((((((((((.(((.((((((((.............)))))))).))).))))))))))..
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] .......((((((((((.....((((((((.............)))))))).....))))))))))..
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] .......((((((((((.....((((((((.............)))))))).....))))))))))..