RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 3IVN_B

RNA: 3IVN_B
Rfam family: Purine

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Reference structure (std)		[ sec struct ]	(((((((({..((((((......[[.))))))(.....})(((((.]]......)))))..))))))))
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	(((((((([(.(((((((.{{..{{)))))))).(...].(((((.}}().}}.))))).)))))))))                                     (                        )                                        (      )                                                                (  )
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((...((((((.........))))))........(((((.........)))))..))))))))
Alterna	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((...((((((.........))))))..(((....((((.........)))))))))))))))
Carnac(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....................................................................
Carnac(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((...((((((.........))))))........(((((.........)))))..))))))))
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CentroidAlifold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((...(((((((.......)))))))........((((((.......))))))..))))))))
CentroidFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((...((((((.........))))))........(((((.........)))))..))))))))
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((...((((((.........))))))........(((((.........)))))..))))))))
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((...((((((.........))))))........(((((.........)))))..))))))))
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((...((((((.........))))))........(((((.........)))))..))))))))
MCFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((....(((((((((((((((.((((((..))))))))))))))))))..))))))))))))
MCFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((.....(((((..((((((((...((((..))))..))))))))..))..))).))))))))
MXScarna(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....(((....((((((.......)))))).........((((((.......))))))..))).....
MXScarna(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((((...(((((((.......)))))))........((((((.......))))))..))))))..
Mastr(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....................................................................
Mastr(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((...(((((((.......)))))))........((((((.......))))))..))))))))
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((...((((((.........))))))........(((((.........)))))..))))))))
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((...((((((.........))))))........(((((.........)))))..))))))))
Murlet(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((((.....((((.........))))..(((........(((.......)))..)))))))))..
Murlet(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...(((((...((((((.........))))))........((((...........))))..)))))...
PETfold_pre2.0(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((.(((((((.......)))))))(...))).((((((.......))))))..))))))))
PETfold_pre2.0(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((((...(((((((.......)))))))((....))((((((.......))))))..))))))).
Pknots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((...((((((.........))))))((....))(((((.........)))))..))))))))
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((...((((((.........))))))........(((((.........)))))..))))))))
RDfolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((...((((((.........))))))........(((((.........)))))..))))))))
RNASampler(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((...((((((.........))))))........(((((.........)))))..))))))))
RNASampler(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((...((((((.........))))))........(((((.........)))))..))))))))
RNAalifold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((((.....((((.........))))..(((......(((((.......))))))))))))))).
RNAalifold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..))))))).
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((...((((((.........))))))........(((((.........)))))..))))))))
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((...((((((.........))))))........(((((.........)))))..))))))))
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((...((((((.........))))))........((((...........))))..))))))))
RSpredict(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....((((((.((((((.........)))))).....)).(((((.........)))))..))))....
RSpredict(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((.((((((.........)))))).....)).(((((.........)))))..))))))))
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((...((((((.........))))))........(((((.........)))))..))))))))
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((...((((((.........))))))........(((((.........)))))..))))))))
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((...((((((.........))))))........(((((.........)))))..))))))))
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((....((((((.........))))))........(((((.........)))))...)))))))

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