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CACGCACAGGGCAAACCAUUCGAAAGAGUGGGACGCAAAGCCUCCGGCCUAAACGGCAUUGCACUCCGCCGUAGGUAGCGGGGUUACCGAUGG |
Reference structure (std) |
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[ sec struct ] |
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Reference structure (ext) |
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[ sec struct ] |
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Afold
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[ FASTA input ] |
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Alterna
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((......((((...((((((....))))))...))..((((((..(((((..((((..........)))))))))...)))))).))..)). |
CentroidFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..........((...((((((....))))))...))...(((.(((((((..(((((..........)))))))))..))))))......... |
CentroidFold
(ext)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..........((...((((((....))))))...))...(((.(((((((..(((((..........)))))))))..))))))......... |
Contrafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..........((...((((((....))))))...))...(((.(((((((..(((((..........)))))))))..))))))......... |
HotKnots
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[ FASTA input ] |
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....((..((((...((((((....))))))...))..(((((((.((((..(((((..........))))))))).).)))))).))..)). |
MCFold
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[ FASTA input ] |
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...((..((.((((.((((((....))))))(.((..(.(((...))).)...)).).)))).))..))(((.((((((...)))))).))). |
MCFold
(ext)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...(((((((((((((((((((..)))))))(((((((((((...))))))).))))))))))))))))((((((((((...)))))))))). |
MaxExpect
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[ FASTA input ] |
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....((..((((...((((((....))))))...))..((((.(((((((..(((((..........)))))))))..))))))).))..)). |
McQFold
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[ FASTA input ] |
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Pknots
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PknotsRG
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RDfolder
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[ FASTA input ] |
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.............((((....................................(((.........)))(((.......)))))))........ |
RNAfold
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[ FASTA input ] |
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....((..((((...((((((....))))))...))..(((((((.((((..(((((..........))))))))).).)))))).))..)). |
RNAshapes
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[ FASTA input ] |
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RNAsubopt
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[ FASTA input ] |
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....((..((((...((((((....))))))...))..(((((((.((((..(((((..........))))))))).).)))))).))..)). |
Sfold
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[ FASTA input ] |
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....((..((((...((((((....))))))...))..(((((((.((((..(((((..........))))))))).).)))))).))..)). |
UNAFold
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[ FASTA input ] |
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Vsfold4
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[ FASTA input ] |
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Vsfold5
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[ FASTA input ] |
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