RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 3J0L_2

RNA: 3J0L_2
Rfam family: -

			GCCCAGUGCUCUGAAUGUCAAAGUGAAGAAAUUCAACCAAGCGCGGGUAAACGGCGGGAGUAACUAUGACUCUCUUAAGGUAGCCAAAUGCCUCGUCAUCUAAUUAGUGACG
Reference structure (std)		[ sec struct ]	(((..((((((.(...((.....((((....)))).....)).)))))..))))).((((.........))).)....................(((((.......))))).
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	((([.(.((((.(...((....((((((..))))))....)).)))))..]))))(((((.(....)..))).))..........(...().).(((((.......))))).       (                                           )                                                                                                                       (              )
CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((.(((((..............)))))....))))))))).......((((((.......))))))...(((((......)))))((((((.......))))))
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((.(((((.((........)).)))))....)))))))))....(((((((((.......))))))........)))........((((((.(....)))))))
CentroidFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((.(((((.((........)).)))))....)))))))))....(((((((((.......))))))........)))........((((((.(....)))))))
CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.......................((((....))))...........................................................((((.........)))).
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((..((((.((...(((......(((....)))......))).))))..)))))((((((.......))))))...(((((......))))).(((((.......))))).
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((.(((((.((........)).)))))....)))))))))....(((((((((.......))))))........)))........((((((.((()))))))))
Cylofold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((.............((((....))))....))))))))).......((((((.......))))))...(((((......)))))((((((.......))))))
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((.(((((.((........)).)))))....))))))))).......((((((.......))))))...(((((......)))))((((((.......))))))
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((..[[[[[(....<<<<...((((....)))).........))))....(((.)]]]]]....>>>>.......{{{{{)))...}}}}}((((((.......))))))
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((.............((((....))))....))))))))).......((((((.......))))))...(((((......)))))((((((.......))))))
MCFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((..).))(..((..((((.((((((....)))(.((...(((.(.....).)))))..).))).))))..))..)(((((......)))))(((((.(((..))))))))
MCFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((..).))(((((((((((((((((((..))))((((...((((((...))))))))).).)))))))))))))))(((((((..)))))))(((((.(((..))))))))
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((.(((((.((........)).)))))....))))))))).......((((((.......))))))...(((((......)))))((((((.......))))))
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((.(((((..............)))))....)))))))))....(((((((((.......))))))...............))).((((((.......))))))
Pknots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((((.........))((((....))))....)))))))))....(((((((((.......))))))...[[[[[)))...]]]]]((((((.......))))))
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((.(((((.((........)).)))))....)))))))))....(((.(((((.......)))))....[[[[[)))...]]]]]((((((.......))))))
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((.(((((..............)))))....)))))))))....((.(((((((....).)))))))).(((((......)))))((((((.(....)))))))
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((.............((((....))))....))))))))).......((((((.......))))))...(((((......)))))((((((.......))))))
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((.(((((.((........)).)))))....))))))))).......((((((.......))))))...(((((......)))))((((((.......))))))
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((.((.....))...((((....))))....))))))))).......((((((.......))))))...(((((......)))))((((((.......))))))
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((.(((((.((........)).)))))....)))))))))....(((((((((.......))))))....((...))....))).((((((.......))))))
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((.((..(((((((......)))))))..)))))))))))...(......)(((.(..((.(((((...))).)).))).)))..(((((.(((..))))))))
RNAwolf	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((.((..(((..............)))..)))))))))))...........((.....((.((((.....)).)).))...))..(((((.(((..))))))))
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((..(.....).....(((....))).....))))))))).......((((((.......))))))...(((((......)))))((((((.......))))))
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((.(((((.((........)).)))))....))))))))).......((((((.......))))))...(((((......)))))((((((.......))))))
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((.(((((.((..........((((....))))..))))))))))........((((((.......))))))...(((((......))))).(((((.......))))).
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((.((..........((((....))))..))))))))))).......((((((.......))))))...(((((......))))).((((.((....)))))).

---