|
|
|
CACCGCCCGUCGCUUGUAGUAACGAAUGGUCUGGUGAACCUUCUGGACUGCGACAGCAAUGUUGCGGAAAAAUAAGUAAACCCUACCAUUUGGAACAACAAGAAGUCGUAA |
Reference structure (std) |
|
[ sec struct ] |
.......((.(.(((((.....((((((((..(((..((.(..(...((((((((....))))))))...)..).))..)))..)))))))).....)))))..).))...
|
Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
.....((((.(((((((....(((((((((((((((((((((((...((((((((....))))))))...)))))))))))))))))))))))....)))))).).)).)) ( )
|
Afold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(......((...(((((.((..((((((((..(((...((....)).((((((((....))))))))............)))..))))))))..)).)))))....))..) |
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......((...(((((.....((((((((..(((..((........((((((((....))))))))........))..)))..)))))))).....)))))....))... |
CentroidFold
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......((.(.(((((.((..((((((((..(((..(.(((.....((((((((....))))))))......))))..)))..))))))))..)).)))))..).))... |
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......((.(.(((((.((..((((((((..(((..(.(((.....((((((((....))))))))......))))..)))..))))))))..)).)))))..).))... |
CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......((.(.(((((.((..((((((((..(((....((......((((((((....)))))))).......))...)))..))))))))..)).)))))..).))... |
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......((...(((((.((..((((((((..(((..((.(......((((((((....))))))))......).))..)))..))))))))..)).)))))....))... |
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......((.(.(((((.((..((((((((..(((..(.(((.(...((((((((....))))))))....).))))..)))..))))))))..)).)))))..).))... |
Cylofold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.........(((((........[[[[[[[[..)))))..(((((...((((((((....)))))))).................]]]]]]]]........)))))...... |
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......((...(((((.((..((((((((..(((..((........((((((((....))))))))........))..)))..))))))))..)).)))))....))... |
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......((...(((((.((..((((((((..(((...((....)).((((((((....))))))))............)))..))))))))..)).)))))....))... |
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......((...(((((.((..((((((((..(((............((((((((....))))))))............)))..))))))))..)).)))))....))... |
MCFold
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((..)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))) |
MCFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......((.(.(((((.((..((((((((..(((..((.(..(...((((((((....))))))))...)..).))..)))..))))))))..)).)))))..).))... |
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......((...(((((.((..((((((((..(((..((........((((((((....))))))))........))..)))..))))))))..)).)))))....))... |
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
............(((((.....((((((((..(((..))).......((((((((....)))))))).................)))))))).....)))))......... |
Pknots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((.......[[[[[.[[..[[[[[[[[.)))))..((....)).((((((((....)))))))).......((......))]]]]]]]]..]].]]]]]......... |
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......((...(((((.((..((((((((..(((...((....)).((((((((....))))))))............)))..))))))))..)).)))))....))... |
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......(((..(((((.....((((((((..(((..((.((.....((((((((....))))))))......))))..)))..)))))))).....)))))..).))... |
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
............(((((.....((((((((.................((((((((....)))))))).................)))))))).....)))))......... |
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......((...(((((.((..((((((((..(((...((....)).((((((((....))))))))............)))..))))))))..)).)))))....))... |
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......((...(((((.((..((((((((..(((...((....)).((((((((....))))))))............)))..))))))))..)).)))))....))... |
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......((...(((((.((..((((((((..(((...((....)).((((((((....))))))))............)))..))))))))..)).)))))....))... |
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(.((((.(..(.(((((.((..((((((((......(((((..)))))....(((((...))))(..)...((((..)))).).))))))))..)).)))))))).)).)) |
RNAwolf
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...(((......(((((.((..((((((((........(((..))).......((((...))))....................))))))))..)).)))))..).))... |
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......((...(((((.((..((((((((..(((...((....)).((((((((....))))))))............)))..))))))))..)).)))))....))... |
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......((...(((((.((..((((((((..(((...((....)).((((((((....))))))))............)))..))))))))..)).)))))....))... |
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.............((((....)))).((((((((........)))).((((((((....)))))))).................)))).(((......))).......... |
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((.((((((..........)).))))..))))).........((((((((((....)))))).......................((((......)))).)))).... |