 | ||||||||||||||
| ||||||||||||||
 | ||||||||||||||
RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 3J20_1
RNA: 3J20_1
Rfam family:
tRNA
| GGGGCGGUAGCUCAGCCUGGGAGAGCACCGGACUGAAGAUCCGGGUGUCGGGGGUUCAAAUCCCCCCCGCCCCACCA | |||
| Reference structure (std) | [ sec struct ] | ((((((...((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))).)))))).... | |
| Reference structure (ext) | [ sec struct ] | ((((((((.[[[[)........]]]].(((((.......))))).....((((((...)..)))))))))))).... | |
| Carnac(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((....................(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| CentroidAlifold(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.............................................................)))))).... |
| CentroidAlifold(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| CentroidFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.........))))((((((.......))))).)...(((((.......)))))))))))).... |
| CentroidFold (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((...(((.........)))(((((((.......))))).))..(((((.......)))))))))))).... |
| CentroidHomfold‑LAST | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| ContextFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| Contrafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((..((())).))))((((((.......))))).)...(((((.......)))))))))))).... |
| Cylofold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.[[[[[[[.)))).............]]]]]]]...(((((.......)))))))))))).... |
| Fold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| HotKnots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((..(....).)))).((((((....).))))).....(((((......))))).))))))).... |
| IPknot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| MXScarna(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.........))))..((((.......))))......(((((.......)))))))))))).... |
| MXScarna(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((...(((.........)))..(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| Mastr(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ............................................................................. |
| Mastr(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((....................(((((.......)))))........(((((.......)))))))))))). |
| MaxExpect | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((......))))).))))))).... |
| McQFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| Multilign(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| Murlet(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.........)))).......................(((((.......)))))))))...))). |
| NanoFolder | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.[[[[[[[.))))....((({{....]]]]]]])))(((((((..))))))).)))))))..}} |
| PETfold_pre2.0(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.........)))).(((((.(...).))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| PETfold_pre2.0(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| PPfold(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ............................................................................. |
| PPfold(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| Pknots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| PknotsRG | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| ProbKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.........))))((((((.......))))).)...((((((....)))))).))))))).... |
| RNASLOpt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| RNASampler(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| RNAalifold(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| RNAfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((..(....).)))).((((((....).))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| RNAshapes | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| RNAsubopt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((..(....).)))).((((((....).))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| RNAwolf (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((......(((((((((((.((((..)))).)))))))))))..(((((.((..)))))))))))))).... |
| RNAwolf | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((......((((((((....((......))....))))))))..(((((.......)))))))))))).... |
| RSpredict(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((.(..................................................(...).(.......)...).)). |
| RSpredict(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..........................................(((((.......)))))))))))...). |
| Sfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.........)))).((((((....).))))).....(((((......))))).))))))).... |
| TurboFold(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| UNAFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((......))))).))))))).... |
| Vsfold4 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....((((((....)))))).))))))).... |
| Vsfold5 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....((((((....)))))).))))))).... |