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RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 3J2C_O



RNA: 3J2C_O
Rfam family: -

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                  (                                                                                 )                                           
        (                                                                                                        )                              
Afold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((....((((.((.(((...((...)).((((((..((((.(..((((((.((((..((....)).))))))))))..)))))..))))))))).))))))..............((((((((((....))))))))))...))
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ...............(..((((.(((..((((((((((((.(..((((((.((((..((....)).))))))))))..)))))))))))))..))).))))).............((((((((((....)))))))))).....
CentroidFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ...............(..((((((((((((((((((((((.(.(((((((.((((..((...))..))))))))))).)))))))))))))))))))))))).............((((((((((....)))))))))).....
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] ................................................................................................................................................
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ........(.(..((...((((.(((..((((((((((((....((((((.((((..((....)).))))))))))...))))))))))))..))).))))....))...)..).((((((((((....)))))))))).....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] .........(...(((..((((.(((..((((((((((((.(..((((((.((((..((....)).))))))))))..)))))))))))))..))).)))))...))......).((((((((((....)))))))))).....
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] .........(((((..............[[[[[[[[[[[[..(((({{{{.)))).}}}}......)))))........]]]]]]]]]]]]((((.......)))).........((((((((((....)))))))))).....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((((.........(((..((((((((((((.(..((((((.((((..((...))..))))))))))..)))))))))))))..))))))))..)).))).)).((((((((((((....)))))))))..))).
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] ......((((.((.(((...(....)..((((((..((((.(..((((((.((((..((....)).))))))))))..)))))..))))))))).))))))..............((((((((((....)))))))))).....
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] .............((...((((.(((..((((((((((((....((((((.((((..((....)).))))))))))...))))))))))))..))).))))....))........((((((((((....)))))))))).....
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] .........(((........((..((..(((((((((((.((..((((((.((((..((...))..))))))))))..)))))))))))))..)).)))))..............((((((((((....)))))))))).....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ......((((.(((((......))))).((((((((((((....((((((.......(((((..))))).))))))...))))))))))))......))))..............((((((((((....)))))))))).....
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] .......((.((...((((.((.(((..((((((..((.(((..((((((.((((..((....)).))))))))))..)))))..))))))..))))))))).)).)).......((((((((((....)))))))))).....
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((........((((..(.(((..(((((((((((.((..((((((.((((...........))))))))))..)))))))))))))..)))).)))).)).))).))...((((((((((....)))))))))).....
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] ......((((.(((((......))))).((((((((((((....((((((.((((...........))))))))))...))))))))))))......))))..............((((((((((....)))))))))).....
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] .......((.((...((((.((.(((..((((((..((((.(..((((((.((((..((....)).))))))))))..)))))..))))))..))))))))).)).)).......((((((((((....)))))))))).....
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((..(((..(((((......))))).)))...))).((((..((((((.((((..((....)).))))))))))..))))..(((((..((((.......))))..........(((((((((....)))))))))))))).
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ........(((((..((((.((.(((..((((((..(.((((..((((((.((((..((....)).))))))))))..)))))..))))))..))))))))).((....))..)))(((((((((....)))))))))))....
RNAwolf [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((((((((((((........)))..(....)(((((((((.((((..((....)).))))))))))(((...))).))))))))..)))))..)).))).))....(((((((((....)))))))))......
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((((((((((((........)))..((..))(((((((((.((((.((((..))))))))))))))(((...))).))))))))..)))))..)).))).)).(..((((((((((..))))))))))..)...
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..............(((...........((((((..(((.((..((((((.((((..((....)).))))))))))..)))))..))))))))).....................((((((((((....)))))))))).....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((((((...((...)).(((..(..((((.(..((((((.(((...((....))..)))))))))..)))))..)..))))))..)))))..)).)).)))...((((((((((....)))))))))).....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ....((((...(((((......))))).((((.((((.......))))...((((..((....)).)))).....))))..))))....((((((.......)))))).......((((((((((....)))))))))).....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ....((((...(((((......))))).((((.((((.......))))...((((..((....)).)))).....))))..))))....((((((.......)))))).......((((((((((....)))))))))).....