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GCCAACGACCAUACCACGCUGAAUACAUCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAAUUAAGCAGCGUCGCGGGCGGUUAGUACUUAGAUGGGGGACCGCUUGGGAACACCGCGUGUUGUUGGCCU |
| Reference structure (std) |
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[ sec struct ] |
(((((((((.....(((((((.....(.((((...(....)...))))...)....)))))).).(.(((((.....((.((..((....)).)).))....))))).))))))))))..
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| Reference structure (ext) |
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[ sec struct ] |
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CMfinder(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Carnac(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidAlifold(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidAlifold(20)
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[ FASTA input ] |
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CentroidFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......((((((......(((((..((....))..))))).......))))))(((((((((((...............)))))).........))))).))))))))).. |
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CentroidFold
(ext)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......((((((......((((((.((....)).)))))).......))))))(((((((((((...............))))))).........)))).))))))))).. |
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CentroidHomfold‑LAST
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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ContextFold
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[ FASTA input ] |
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(((((((((......((((((.....((((((............))))..))....)))))).....((((......((.((.(((....))))).)).....))))..))))))))).. |
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Contrafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......((((((......(((((..((....))..))))).......))))))(((((((((((....(((....))).)))))).........))))).))))))))).. |
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Fold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......((((((......(((((..((....))..))))).......))))))(((((((((((....((.....))..)))))).........))))).))))))))).. |
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HotKnots
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[ FASTA input ] |
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|
IPknot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
MCFold
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((.......(((((((..(((((((((((..)))))))))))))))))).).)))(((((((((..(((((((((((((..)))))))))))))))))))))).)))))).. |
|
MCFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((.......(((.(((...(((((..(((..)))..))))).))).))).).)))(((.(((((..((.(((((.(((....))).))))).))))))).))).)))))).. |
|
MXScarna(seed)
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[ FASTA input ] |
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|
MXScarna(20)
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[ FASTA input ] |
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Mastr(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
........................................................................................................................ |
|
Mastr(20)
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[ FASTA input ] |
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MaxExpect
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[ FASTA input ] |
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|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
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|
Multilign(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((......(((((............))))).......))))))...))(((((..((.(((((.(((....))).))))).)))))))..))))))))).. |
|
Murlet(20)
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[ FASTA input ] |
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|
NanoFolder
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[ FASTA input ] |
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PETfold_pre2.0(seed)
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[ FASTA input ] |
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PETfold_pre2.0(20)
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PPfold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
........................................................................................................................ |
|
PPfold(20)
|
[ FASTA input ] |
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Pknots
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PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......((((((......(((((..((....))..))))).......))))))(((((...(((....((.((.(((....))))).)).))).))))).))))))))).. |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RNASampler(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......((((((.......((((............))))........)))))).....(((((.....(((((.(((....))).)))))...)))))..))))))))).. |
|
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......((((((...((..((((((......))..))))..))....)))))).....(((((.....((.((.(((....))))).))....)))))..))))))))).. |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......((((((......(((((..((....))..))))).......))))))(((((...(((....((.((.(((....))))).)).))).))))).))))))))).. |
|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
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|
RNAwolf
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....(.((((((......(((((((......))..))))).......))))))(.(((((((((....(......)...)))))))))).......)...))))))))).. |
|
RSpredict(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
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|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......((((((......(((((..((....))..))))).......)))))).....(((((..((.(((((.(((....))).))))).)))))))..))))))))).. |
|
TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.......((((((......(((((....[[[[[...))))).......))))))..]]]]]........(((((..((....))..)))))..((.....)))))))))).. |