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GUCUACGGCCAUACCACCCUGAACGCGCCCGAUCUCGUCUGAUCUCGGAAGCUAAGCAGGGUCGGGCCUGGUUAGUACUUGGAUGGGAGACCGCCUGGGAAUACCGGGUGCUGUAGGCUUU |
Reference structure (std) |
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[ sec struct ] |
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Reference structure (ext) |
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[ sec struct ] |
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|
CMfinder(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Carnac(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidAlifold(seed)
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[ FASTA input ] |
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(((((((((.........................................................(((........(.(((..((....)).))).).......))).)))))))))... |
CentroidAlifold(20)
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[ FASTA input ] |
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CentroidFold
(ext)
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[ FASTA input ] |
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CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidHomfold‑LAST
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[ FASTA input ] |
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ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((....((((((((.....((((((............))))..))....)))))).)).(((((......((.((.(((....))))).)).....))))).)))))))))... |
Contrafold
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[ FASTA input ] |
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Fold
|
[ FASTA input ] |
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(((((((((....((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).)).((((((.....((.((.(((....))))).))....)))))).)))))))))... |
HotKnots
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[ FASTA input ] |
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IPknot
|
[ FASTA input ] |
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(((((((((....((((((((...((..((((((......))..))))..))....)))))).))(((((((.....(((((.(((....))).)))))...))))))))))))))))... |
MCFold
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.(((((((((((((.(((((((((((((..))))))))))))))..)))))))))))((((((((.((((((((.(((..)))))))))))))))))))))))))))))... |
MCFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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MXScarna(seed)
|
[ FASTA input ] |
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(((((((((....((((((((..(((..((((((......))..))))..)))...)))))).))(((((((.....((((((.((....))))))))....))))))))))))))))... |
MXScarna(20)
|
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Mastr(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Mastr(20)
|
[ FASTA input ] |
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MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
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(((((((((....((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).)).((((((.....((.((.(((....))))).))....)))))).)))))))))... |
McQFold
|
[ FASTA input ] |
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((((((((((((((((..........(((((((((..(((((..))))).........))))))))).))))..........)))).....(((((((.....)))))))))))))))... |
Multilign(20)
|
[ FASTA input ] |
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(((((((((......((((.....................((((...............))))..............((.((.(((....))))).)).......)))))))))))))... |
Murlet(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((((((((....((.((((.....................................))))..))(((((.......((.((.(((....))))).))......))))))))))))).... |
NanoFolder
|
[ FASTA input ] |
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PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
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(((((((((....((((((((.....((((((...(....)...))))..))....)))))).))((((((....(.((((((.((....))))))))..)..)))))))))))))))... |
PETfold_pre2.0(20)
|
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PPfold(seed)
|
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......................................................................................................................... |
PPfold(20)
|
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Pknots
|
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PknotsRG
|
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(((((((((....((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).))(((((((.....((.((.(((....))))).))....))))))))))))))))... |
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
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RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
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((((((((((((......((((....(((((((((..((((....)))).........)))))))))....)))).......)))).....(((((((.....)))))))))))))))... |
RNASampler(20)
|
[ FASTA input ] |
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(((((((((......((((((.......((((............))))........))))))...(((((((.....(((((............)))))...))))))))))))))))... |
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
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(((((((((......(((((....((..((((............))))..)).....)))))...(((((.......((.((..((....)).)).))......))))))))))))))... |
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
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(((((((((....((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).))(((((((...(.((..(.(((....))).)..)))..))))))))))))))))... |
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
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(((((((((....((((((((......((.((((......))))..))........)))))).)).((((((.....((.((.(((....))))).))....)))))).)))))))))... |
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
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RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.(.(((((.(((........((((((......))))..))(((((((((((((...).)))))))))))).))).))))))..(((((.(((..))))))))))))))))... |
RNAwolf
|
[ FASTA input ] |
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RSpredict(seed)
|
[ FASTA input ] |
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......................................................................(...(................(.....)........(....)......)). |
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
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Sfold
|
[ FASTA input ] |
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TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
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(((((((((....((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).)).((((((.....((.((.(((....))))).))....)))))).)))))))))... |
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.................(((((((((..((((....)))).[[[.....)))))))))..((((]]]............)))).(((((.....))))).)))))))))... |