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RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 3J45_4
RNA: 3J45_4
Rfam family:
-
| CGGUGCCGGAAGGUUAAUUGAUGGGGUUAGCGCAAGCGAAGCUCUUGAUCGAAGCCCCGGU | |||
| Reference structure (std) | [ sec struct ] |
....(((((..(((........(((((..((....))...)))))........)))))))) ( ) |
|
| Reference structure (ext) | [ sec struct ] |
....(((((..(((...(((((((((((((((..))))).))))))))))...)))))))) ( ) |
|
| CentroidFold (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ....(((...............((((((....((((.......)))).....))))))))) |
| CentroidFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ....(((((..((((..(((((((((((.((....))..))))))..)))))))))))))) |
| CentroidHomfold‑LAST | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ....(((((..((((...(((((((((..((....))...)))))..)))).))))))))) |
| ContextFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((.(((....)).........(((((..((....))...))))).........).))).. |
| Contrafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ....(((((..((((..(((((((((((.((....))..))))))..)))))))))))))) |
| DotKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ...........((((((....[[[[[[[(((.........))).))))))..]]]]]]].. |
| Fold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ....(((((..((((..(((((((((((.((....))..))))))..)))))))))))))) |
| HotKnots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ....(((((..((((..(((((((((((.((....))..))))))..)))))))))))))) |
| IPknot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ....(((((..((((..((((((((((..((....))...)))))..)))))))))))))) |
| MCFold (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((..)))(((((((((((((((((((..))))))))))))))))))).))))).. |
| MCFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((.(((....))((...(.(.(((.((.((....)).)).))).).)...)).).))).. |
| MaxExpect | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ....(((((..((((..(((((((((((.((....))..))))))..)))))))))))))) |
| McQFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((..))).............(((((((..(((..)))..............))))))).. |
| NanoFolder | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (([[[[))((.{{{{{{))..<<<<<<<.]]]].(((...))).}}}}}}..>>>>>>>.. |
| Pknots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((....)))..)))).(((((((.((....))((.........))..))))))).. |
| PknotsRG | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ....(((((..((((..(((((((((((.((....))..))))))..)))))))))))))) |
| ProbKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ....(((((..((((..(((((((((((...........))))))..)))))))))))))) |
| RDfolder | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ......................((((((....((((.......)))).....))))))... |
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| RNAfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ....(((((..((((..(((((((((((.((....))..))))))..)))))))))))))) |
| RNAshapes | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ....(((((..((((..(((((((((((.((....))..))))))..)))))))))))))) |
| RNAsubopt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ....(((((..((((..(((((((((((.((....))..))))))..)))))))))))))) |
| RNAwolf (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ....((((..))))...(..).(((((((((.((((.((..))))))).))).)))))... |
| RNAwolf | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ....(((....)))........(((((..(..((((.......))))..)...)))))... |
| Sfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ....(((((..((((..(((((((((((.((....))..))))))..)))))))))))))) |
| UNAFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ....(((((..((((..(((((((((((.((....))..))))))..)))))))))))))) |
| Vsfold4 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ....(((((..(((........((((((.((....))..))))))........)))))))) |
| Vsfold5 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((....)).)).)))..((((((.((....))..))))))..((((......)))) |