RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 3J46_4

RNA: 3J46_4
Rfam family: -

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Reference structure (std)		[ sec struct ]	..(((((((((((.(.((.(...........(((...........(((.(((......))).)))..................)))..).)).).)))))))))))...
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	..(((((((((((.((((((.(.([.{.).<.<<<.(.(...).((((.(((.....).)).))))....).......).]}>>>>..)))))).)))))))))))...                                (                                                     )                                                                            (    )                                                                                                    (             )                                                                                                                           (   )                                                           (                                                       )                                                   (                                                )                                                                                                      ()                                                                                         (      )
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(.((((((..(((.((((.(.((.((.((...((..((((((...(((..(((....)))..)))))))))..))......)))))).).)))).)))..))))))..)
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((((((((.((((.(.(...(......((..((((((...((((((((....))))))))))))))..))........)..).).)))).)))))))))))...
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CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((((((((.((((..............((..((((((...((((((((....))))))))))))))..))...............)))).)))))))))))...
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((((((((......(.........(((((..(((......((((((((....))))))))...)))............))))))......)))))))))))...
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((((((((.((((.(.((.((......((..((((((...((((((((....))))))))))))))..))........)))).).)))).)))))))))))...
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((((....(((........)))...(((((..((((((...((((((((....))))))))))))))............)))))............))))))...
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((((((((.((((.(((((........((..((((((...((((((((....))))))))))))))..))......)).)))...)))).)))))))))))...
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((((..(((.((((.(.((.((.((...((..((((((...(((..(((....)))..)))))))))..))......)))))).).)))).)))..))))))...
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((((((((.((((...((.((......((..((((((...((((((((....))))))))))))))..))........))))...)))).)))))))))))...
MCFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((...(((((((((..)))))))))))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))..
MCFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((((((((.((((.(.((.(.((..(.((..((((((...((((((((....))))))))))))))..)).)...)).).)).).)))).)))))))))))...
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((((((((.((((.(((((........((..((((((...((((((((....))))))))))))))..))......)).)))...)))).)))))))))))...
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((((((((................(((((..((((((...((((((((....))))))))))))))............))))).......)))))))))))...
NanoFolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((((((((.((((.(([[[[[.{{{{{{{..{{{{{{...{{{{{{{{))<<}}}}}}}}}}}}}}..]]]>>..]].}}}}}..)))).)))))))))))}}.
Pknots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((((((((((((.....)))).(((((((..((((((...((((((((....))))))))))))))............)))))...))..)))))))))))...
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ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((((((((.((((.(((((...(.((.((..((((((...((((((((....))))))))))))))..)))))...)).)))...)))).))))))))))).).
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((((((((................(((((..((((((...((((((((....))))))))))))))............))))).......)))))))))))...
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((((..(((.((((.(.((.((.((...((..(((((....(((..(((....)))..))).)))))..))......)))))).).)))).)))..))))))...
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((((((((..(((...((.((.((...((..(((((....(((..(((....)))..))).)))))..))......))))))...)))..)))))))))))...
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((((..(((.((((.(.((.((.((...((..(((((....(((..(((....)))..))).)))))..))......)))))).).)))).)))..))))))...
RNAwolf	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((((.(..(((........)))..)(((((.....((..)).(((((((....)))))))...................)))))(..........)))))))...
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((((.((((((........))))))((((((..((((..)).(((((((....)))))))...(((..)))...))..))))))(..........)))))))...
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((((..(((.((((...((.((......((..((((((...(((..(((....)))..)))))))))..))........))))...)))).)))..))))))...
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((((..(((.((((...((.((.((...((..(((((....(((..(((....)))..))).)))))..))......))))))...)))).)))..))))))...
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....((((...........))))......(((((..((((((...((((((((....))))))))))))))............)))))....(((.......)))....
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....((((..[[[[[[...))))......{{{{.]]]]]].......<<<<<}}}}..>>>>>.((((((................................)))))).

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