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RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 3J46_p
RNA: 3J46_p
Rfam family:
tRNA
| GCGGGAAUAGCUCAGUUGGUAGAGCACGACCUUGCCAAGGUCGGGGUCGCGAGUUCGAGUCUCGUUUCCCGCUCCA | |||
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| Reference structure (ext) | [ sec struct ] |
((((((((.[[[..{.<...)<]]](((.((.......)).))).>.}aaaaaa..>A..AAAAA))))))).... ( ) ( ) |
|
| CMfinder(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ..((.((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))).))...... |
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| CentroidAlifold(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| CentroidFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).((((((.....)))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| CentroidFold (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((((...)))))))......((((.......)))).))))))).... |
| CentroidHomfold‑LAST | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((((((....).))))))))((((.......)))).))))))).... |
| ContextFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| Contrafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((((...))))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| DAFS(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| DotKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((((...))))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| Fold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((((((....).))))))))((((.......)))).))))))).... |
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| IPknot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).((((((((.......))))))))((((.......)))).))))))).... |
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| MXScarna(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........))))..((((((...))))))......(((((.......)))))))))))).... |
| Mastr(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ............................................................................ |
| Mastr(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).((((((.....)))))).....(((((.......)))))))))))).... |
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| McQFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).((((((((.......))))))))((((.......)))).))))))).... |
| Multilign(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((((((....).))))))))((((.......)))).))))))).... |
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| NanoFolder | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((([[[[..{{{{))]]]].<<<<<<<<}}}}aa.>>>>>>>>((((((..)).)))).))))))).AA. |
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| PETfold_pre2.0(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).... |
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| RSpredict(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (.((.((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))....)).). |
| Sfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........))))..((((((((....).))))))).((((.......)))).))))))).... |
| TurboFold(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...((((........)))).(((((((...))))))).....(((((.......))))).)))))).... |
| UNAFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((((...))))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| Vsfold4 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...((((........)))).((((((.....)))))).....(((((.......))))).)))))).... |
| Vsfold5 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...((((...[[[[[)))).{{{{{{]]]]]}}}}}}.....(((((.......))))).)))))).... |