RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 3J7A_7

RNA: 3J7A_7
Rfam family: tRNA

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Reference structure (std)		[ sec struct ]	.((......((...........))..(............)......(..(.........)..)....)).....
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	(((.((.([{{..)..<...<]}}..(.(........).)...>..aa.aa>......AA.AA.))).))....   (                                                                )                  (         )                                                        (                                                              )
CentroidAlifold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((...............................................(.......).....)))))).
CentroidFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((.........)))).((((.........))))((((((......))).)))...))))))).
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((.(((....)))))))(((.........)))(((((((......))).))))..))))))).
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((.........)))).((((.........)))).....(((((.......)))))))))))).
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.(((((.(((....)))))))(((.........)))(((((((......))).)))).)))))))).
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((.(((....)))))))....((((.......[[[[[[[))))..]]].]]]]..))))))).
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.(((((.(((....)))))))(((........))).(((((((......))).)))).)))))))).
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Mastr(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..........................................................................
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McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((.........)))).((((.........)))).....(((((.......)))))))))))).
NanoFolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((.[[[[[[[[)))).{{{{<<<))]]].}}}}>>>..<<<<<.]]]]].>>>>>))))))).
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PPfold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..........................................................................
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ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.(((((.(((....)))))))((((......)))).(((((((......))).)))).)))))))).
RDfolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((.........))))...((((((........))))))(((((.......)))))))))))).
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((.........)))).((((.........)))).(((((......))))).....))))))).
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RNAwolf	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.(((.((..))))).....((..))(((........)))...(((((.......)))))))))))).
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Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((.(........)))))(((........))).(((((((......))).))))..))))))).
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