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CGUCAAAGCACUUUGCAAAAGCUAACGUAUCUGUUUCUUGCCUUUUACCAGAAACAGCCGUUUGUAAGGUGUGCUAAUUUGACUGUAUAGUUUUUGUAAUCUUUU |
Reference structure (std) |
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[ sec struct ] |
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Reference structure (ext) |
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[ sec struct ] |
(((((((((((((((((((......((...((((((((((.......)))))))))).)))))))))))))).....)))))).).................... ()
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Afold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((((((((.((....))..((((((((.(.......).))))))))...)))))))))))).....)))))).....................) |
Carnac(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......................................................................................................... |
CentroidAlifold(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..((((..(((((((((((...........((((((((...........))))))))...))))))))))).......))))....................... |
CentroidFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((((((((((((((((((......((...((((((((.(.......).)))))))).)))))))))))))).....))))))...................... |
CentroidFold
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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ContextFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Contrafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((((((((((((((((((......((...((((((((.(.......).)))))))).)))))))))))))).....))))))...................... |
DAFS(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...((((.(((((((((((.......(...((((((((.(.......).)))))))).).)))))))))))......))))........................ |
DotKnot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Fold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((((((((((......(((...((((((((.(........))))))))).)))))))))))))).....))))))...................... |
HotKnots
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((((((((((((((((((.((....))..((((((((.(.......).))))))))...)))))))))))).....))))))...................... |
IPknot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((((((((((..((..[[))..((((((((...........))))))))..]]))))))))))).....))))))...................... |
MXScarna(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Mastr(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......................................................................................................... |
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((((((((((......(((...((((((((.(........))))))))).)))))))))))))).....))))))...................... |
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((((((((((((((((((...........((((((((...........))))))))...)))))))))))).....))))))...................... |
Multilign(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......(((((((((((......(((...(((((((.((........))))))))).)))))))))))))).............(((((...)))))....... |
Murlet(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..............................((((((((.(.......).))))))))................................................ |
NanoFolder
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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PETfold_2.0(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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PETfold_pre2.0(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..((((..(((((((((((......((...((((((((.(..(...)).)))))))).))))))))))))).......))))....................... |
PPfold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......................................................................................................... |
Pknots
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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PknotsRG
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((((((((((((((((((.((....))..((((((((...........))))))))...)))))))))))).....))))))...................... |
ProbKnot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((((((((((......(((...((((((((.(........))))))))).)))))))))))))).....)))))).((((((...))))).)..... |
RNASLOpt
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......................................................................................................... |
RNAalifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..((((.(.......)..............((((((((.(.......).)))))))).....................))))....................... |
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((((((((((((((((((.((....))..((((((((.(.......).))))))))...)))))))))))).....))))))...................... |
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((((((((((((((((((.((....))..((((((((...........))))))))...)))))))))))).....))))))...................... |
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((((((((((((((((((.((....))..((((((((.(.......).))))))))...)))))))))))).....))))))...................... |
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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RNAwolf
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...(((((..)))))(((((((((....(..((((((.((........))))))))(((........))).(......)....)...))))))))).((...)). |
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((((((((((((((((((.((....))..((((((((...........))))))))...)))))))))))).....))))))...................... |
TurboFold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((((((((((......(((...((((((((...........)))))))).)))))))))))))).....))))))...................... |
UNAFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((((((((((((((((((.((....))..((((((((...........))))))))...)))))))))))).....))))))...................... |
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......(((((.....((((((........[[[[[[[[.)).))))...]]]]]]]].............))))).....((((....))))............. |