RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 3JYV_7

RNA: 3JYV_7
Rfam family: tRNA

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Reference structure (std)		[ sec struct ]	.((((((..((([.....(..]))).((((.........)))).....(((((..)....))))))))))).....
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	(((((((((aa.{)(<.[<..})A.(((((((.....)))))))A..)((((((]>.)>.))))))))))))....            (          )                                                               (              )                                                                         (                       )
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	N/A
Alterna	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.(((((.(((((....))))).))........)))(((((.......))))))))))))..........
Carnac(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((..................(((((.......)))))......((((.......))))))))))))....
CentroidAlifold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((............................................................))))))....
CentroidAlifold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
CentroidFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...((..........))..(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...((..........))..(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((....(((.(((((....))))).))).........((((((.......))))))))))))..........
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((..(((.(((((....))))).)))...((..((((.......))))..))))))))))..........
MCFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.(.(((((((.((.(..).)).)))))).).)(((..((((..(..)..))))..))))))))))....
MCFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.((((((((((((((..))))))))))).)))((((((((((((..)))))))))))))))))))....
MXScarna(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((........))))..((((.......))))......(((((.......))))))))))))....
MXScarna(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((........))))..((((.......))))......(((((.......))))))))))))....
Mastr(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	............................................................................
Mastr(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.....(((((..((......))..)))))....(.........((((.......))))).))))))....
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((...(((..(((((....))))).........))).((((((.......))))))))))))..........
Murlet(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((........))))..((((.......))))......(((((.......)))))))))...))).
PETfold_pre2.0(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((........)))).(((((.(...).))))).....(((((.......))))))))))))....
PETfold_pre2.0(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
Pknots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((..(((.(((((....))))).)))...((..((((.......))))..))))))))))..........
RDfolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((((...((((((((.......))).)))))........)))))).(((..(((..........))))))..
RNASampler(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
RNAalifold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((..(((.(((((....))))).)))...((..((((.......))))..))))))))))..........
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((.(((....))).((((.(((((..........))))).))))........))))))))..........
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((...((((.(((((....))))).))).).......((((((.......))))))))))))..........
RSpredict(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(..(..........................................(...........(..)........))..).
RSpredict(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))...).
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((..(((.(((((....))))).)))..........................))))))))..........
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.....(((((..((......))..)))))...((((..((((........))))..))))))))))....
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((......(((((....))))).....(((....))).(((.......))).))))))))..........
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((......(((((....))))).....(((....))).(((.......))).))))))))..........

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