|
|
|
GUUUGACCUCAAACAGGUAGGAGUACCCGCUGAACUUAAGCAUAUCAAUAAGCGGAGGAAAAGAAACCAACCGGGAUUGCCUUAGUAACGGCGAGUGAAGCGGCAAAAGCUCAAAUUUGAAAUCUGGUACCUUCGGUGCCCGAGUUGUAAUUUGGAGAGGGCAACUUUGGGGCCGUUCCUUGUCUAUGUCCUUGGAACAGGACGUCAUAGGGGGUGAGAAUCCCGUGUGCGAGGAGUGCGGUUCUUUGUAAAGUGCCUUCGAAGAGUCGAGUUGUUUGGGAAUGCAGCUCUAAGUGGGUGGAAAUUCAUCUAAAGCUAAAUAUUGGCGAGAGACCGAUAGCGAACAAGUACAGUGAUGGAAAGAUGAAAAGAACUUUGAAAAGAGAGUGAAAAAGUACGUGAAAUUGUUGAAAGGGAAGGGCAUUUGAUCACAUGGUGUUUUGUGCCCUCUGCUCCUUGUGGGUAGGGGAAUCUCGCAUUUCACUGGGCCAGCAUCAGUUUUGGUGGCAGGAUAAACCCAUAGGAAUGUAGCUUGCCUCGGUAAGUAUUAUAGCCUGUGGGAAUACUGCCAGCUGGGACUGAGUGAAAUGACGUAAGUCAAGGAUGCUGGCAUAAUGGUUAUAUGCCGCCCGUCUUGAAACACGGACCAAGGAGUCUAACGUCUAUGCGAGUGUUUGGGUAAACCAUACGCGUAAUGAAAGUGAGCGUAGGUUGGGGCCUCGCAAGAGGUGCACAAUCGACCGAUCCUGAUGUCUUCGGAUGGAUUUGAGUAAGAGCAUAGCUGUUGGGACCCGAAAGAUGGUGAACUAUGCCUGAAUAGGGUGAAGCCAGAGGAAACUCUGGUGGAGGCUCGUAGCGGUUUGACGUGCAAAUCGAUCGUCGAAUUUGGGUAUAGGGGCGAAAGACUAAUCGAACCAUCUAGUAGCUGGUUCCUGCCGAAGUUUCCCUCAGGAUAGCACGAAGCUCGUUUUAUGAGGUAAGCAAUGAUUAGAGGUCGGGGUCGAAAGACCUUGACCUAUUCUCAAACUUUAAAUAUGUAAGAAGUCCUUGUUACUUAAUUGAACGUGGACAUUUGAAUGAGAGCUUUUAGUGGGCCAUUUUUGGUAAGCAGAACUGGCGAUGCGGGAUGAACCGAACGUAGAGUUAAGGUGCCGGAAUACACGCUCAUCAACAAAAGGUGUUAGUUCAUCUAGACAGCCGGACGGUGGCCAUGGAAGUCGGAAUCCGCUAAGGAGUGUGUAACAACUCACCGGCCGAAUGAACUAGCCCUGAAAAUGGAUGGCGCCAAGCGUGUUACCUAUACUCUACCGUCAGGGUGCCCUGACGAGUAGGCAGGCGUGGAGGUCGUGACGAAGCCUGACCGUAAGGUCGGGUCGAACGGCCUCUAGUGCAGAUCUUGGUGGUAGUAGCAAAUAUUCAAAUGAGAACUUUGAAGACUGAAGGGGGAAAGGUUCCACGUCAACAGCAGUUGGACGUGGGUUAGUCGAUCCUAAGAGAUGGGGAAGCUCCGUUUCAAAGGCCUGAUUUUAUGCAGGCCACCAUCGAAGGGAAUCCGGUUAAGAUUCCGGAACCUGGUGGUUCUUCACGGUAACGUAACUGAAUGUGGAGACGUCGCGAGCCCUGGGAGGAGUUAUCUUUUCUUCUUAACAGCUUAUCACCCGAAUUGGUUUAUCCGGAAUGGGGUCUUAUGGCUGGAAGAGGCCAGCACCUUUGCUGGCUCCGGUGCGCUUGACGGCCGUGAAAAUCCACAGGAAGGAAUAGUUUUCAUGCCAGGUCGUACUGAUAACCGCAGCAGGUCUCCAAGGUGAACAGCCUCUAGUUGAUAGAAUAAUGUGAUAAGGGAAGUCGGCAAAAUAGAUCCGUAACUUCGGGAUAAGGAUUGGCUCUAAGUUAGAACUGGUACGGACAAGGGGAAUCUGACUGUCUAAUUAAAACAUAGCAUUGCGAUGGUCAAAAGUGAUGUUGACGCAAUGUGAUUUCUGCCCAGUGCUCGAAUGUCAAAGUGAAGAAAUUCAACCAAGCGCGGGUAAACGGCGGGAGUAACUAUGACUCUCUUAAGGUAGCCAAAUGCCUCGUCAUCUAAUUAGUGACGCGCAUGAAUGGAUUAACGAGAUUCCCACUGUCCCUAUCUACUAUCUAGCGAAACCACAGCCAAGGGAACGGGCUUGGCAGAAUCAGCGGGGAAAGAAGACCCUGUUGAGCUUGACUCUAGUUUGACAUUGUGAAGAGACAUAGAGGGUGUAGAAUAAGUGGGAGCUUCGGCGCCAGUGAAAUACCACUACCUUUAUGUUUCUUUACUUAUUCAAUGAAGCGGAGCUGGAAUUAAUUUUCCACAUCCUUGUGUAUAGGGUCCCAUUCGGGGCUGAUCCGGGUUGAAGACAUUGUCAGGUGGGGAGUUUGGCUGGGGCGGCCAUCUGUUAAACGAUAACGCAGAUGUCCUAAGGGGGGCUCAUGGAGAACAGAAAUCUCCAGUAGAACAAAAGGGUAAAAGCCCCCUUGAUUUUGAUUUUCGUGUGAAUACAAACCAUGAAAGUGUGGCCUAUCGAUCCUUUAGCCUCGAAUUUGAGGCUAGAGGUGCCAGAAAAGUUACCACAGGGAUAACUGGCUUGUGGCAGUCAAGCGUUCAUAGCGACAUUGCUUUUUGAUUCUUCGAUGUCGGCUCUUCCUAUCAUACCGAAGCAGAAUUCGGUAAGCGUUGGAUUGUUCACCCACUAAUAGGGAACGUGAGCUGGGUUUAGACCGUCGUGAGACAGGUUAGUUUUACCCUACUGAUGAAUGUUACCGCAAUAGUAAUUGAACUUAGUACGAGAGGAACAGUUCAUUCGGAUAAUUGGUUUUUGCGGCUGUCUGAUCAGGCAUUGCCGCGAAGCUACAUCCGCUGGAUUAUGGCUGAACGCCUCUAAGUCAGAAUCCAUGCUAGAACGCGGUGAUUUCUUUGCUCCACACAAUAUGUACCUUUUGUAUAAUGGCGUCCUUGUGGCGUCUACCUUUUGUAUAAUGCUAGCAACGGUGCACUUGGCGGAAAGGCCUUGGGUGCUUGCUGGCGUGAAAUUGAACUAUUUUGCGUGGGGAAAAUCAUUUGUAUACGACUUAGAUGUACAAGGGGUAUUGUAAGCAGUAGAGUAGCCUUGUUGUUACGAUCUGCUGAGAUUACCUUUUGUCUGAUUUGU |
| Reference structure (std) |
|
[ sec struct ] |
.........................((((((...................))))).).........((....))...((((......((.....)).....))))...((((.........(...((..(.....)..))....).............((.........(...((((((((.(....((((........))))(((...).{{{.....))}}}....).))))))..))...)............)).....)....((((..............)))).....(((..........)))..)))..................................((....))............(..((.(....).))............).....................((((....((.......((.........(..(((((.....))))).)..............)).............(((..(.((...((..........((((.......(((((....)))))........))))........))....)).)..))).........(((....)))..................))....))))...(((........)))..(((.............((......(.(...((.....))...).)..................(.......((((....))))........)...(..(((.(..(....)...))))...)...........)).........((.(...((((((.....(((((((((.....(....(((..........)))....).......(....((((........))))...)....)))))))))....(.......).......))))))......).))..((((......(.(.(....).).)((..(.(........(((......((.....(........((.((((....)))).))........)....))........))).....((..(.(...........).)..))...............))...))..((((.((((.......)))).))))....(((......)))...(((((.....(((......(..((((.(..........(....(((.(((.a.....(........(.....................)..........((......))...........A.))).)))...)..................))))).)))).....)))))((.(..........).))......))))(..((....(((......((((((........))))))...)))....))...).......)))........((.....((((((.......))))))..((....(..(..(...((((..(....(.....)..)..)))....(.bb..(.(.....(((..(....).)))......((((((........)))))).........))...(((............))).)((....(................................(((...((...(...((((.........))))..(.....................(.....).........................)...((.((....)).)).....).....))....)))(..)........................)......))..BB.).)................)..).(..(.....)..)..)).......(.....(.((((.((..(....(.......(.(((....[.(..].....))).).(.(((.....))).).(...).......(((((.(.....((.........))...((..((......(((....)))........))..)).)...(..((..((((....................................))..)))).(((((.........)))))........(.................................)....).........).)))))..).))).))))...).)...))..........(((((........)))))....(((....(((.((.......(((.((...(..(...(.((((((((......((((((...(.................(......................)........)...)))))).......(((((.....((((..(((((......)))))..................(((....))).....))))..))))).....))))))))..)...)...((.......))..(((...............))).(......((((((<.(.((..(.........)..))...).......(.......>))))))....((...((........))...))................)...........((................)).......).....).....))))).........(.(...(..((....((.......))....))..)....).)..........((.(...(.((..(.(((((((......))))))..).).(((.........))).....)).).......).).)......((((((....))).))).....))..)))...)))........(........(...(((........(....).......)))...(.......(.....((..(.(.((......)).)...)..))....).....).........((.......).........))........)..........)........................................................................((((((((..(.((....................)).))))))))).................................(..(.......)..)......(..(((..............(..(((((......)))))..).............)))..)..........
|
| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
N/A
|
|
Afold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((.......((((.((((((((((((((((((..((((((((..(((.....(((.((........))..)))...(((((........))))).)))..((((......(((((((.....((.((((((...)))))).)).....))))))).(((((((.((((((((((((((((((...(((((((......)))))))((((.(((((....))))).))))))))))..))))))))....))))))))))).....))))...))))))))....))))....((((((((((.....((((((.(((......(((.(((((.((((((.(((.......((....)).........................(((((.((((((((((((((....((((((.(((..(((((.((((((...((((...((((.(((((((.((....))))))))).....))))...))))..((((((((((((((..(((((((......((((((((..((((((((((....))))))..)))).))))))))....)))))).)..)))))))......((((....))))....)))))))....)))))).))))).((((((((.((((((.(((......)))...(((....))).))))))(((..((((.(((((...((....))..)))))))))...(((((....))))).....((((((...((((...(((((((((...(((((((((...((((.((..(..(((((((..(((((((...(((((((..(((.((((...(((((((....)))))))....))))....(((((((.....)))))))........)))..))))))).(((....).))......)))))))....((..((((.(((....((((.((((((((((((.....))).))))..))))).)))).........(((((((((((....))))))))))).((((((..(((.........)))..((((.((((.(......))))).)))).......))))))..........((((....))))..)))))))..))....)))).....((....(((((((..(((((.......(((((((((((......(((.((((((((((...(...(((((..(((((((.........))...)))))...((((........)))).))))))..))))))))))))).......))))......))))))))))))..)))))))(((((((....)))))))....))...(((((((((((((..((..((((((((....)))))))))).)))))))))).)))...)))..)..)).)).))...)))))))))......)))))))))...))))........(((((((((((....))).))))))))...)))))))))..)))))))).....))).))))))..(((((........))))).((((((..(((...(((((........))))).)))))))))..))))))....(((...(((((((...(((((((((((((.(((((((((.......)))))))))....(((...(((((.((..((....((.(((((((..((((((((((..((((.((((..(((((((((((..((((((((((...(((.((((((((((.......)))....))))))))))))).)))))))...(((......))).(((...((..(((...((((.....))))....))).))...))).))))))))......((((......))))...))).))))))))..((((((...((((.(((((..((((((((....(((((.(((...(((((((((((....(((((.(....).)))))))))))..(((((((((...((((((..(((.....((((....)))).....)))))))))...)))))))))..))))).........(((((......)))))((((((.......))))))....))).))))).....))))))))..))))).)))).....)))))).......))))).(((((...(((((.((....(((((((((........))))))))).............((((....(((((((((((((((((..............((.((....)).)).(((......)))..)))))))))))))))))....))))....)).)))))((((......))))...)))))....)))))..))))))).))))..)).)))))..)))...(((((..((((....((((((..((((((.(((((((...........))))))).))..(((((((((..((((((.......)))))).....((......))...))))))))).......(((((((((.(........))))))))))...))))......((((((((((((....)))))))))))).)))))).......))))...)))))..)))))))))).)))..)))))))..)))....)))))))).)))))))).))))))))))).)))...(((((((......)))))))))).))))))..))))))))))....)))..(((.((..((((...(((((((....))).))))......))))..)).)))...((((((((..(((((..((((((..((.(....)..))))))))..(((((...(((((((.((((((((((....)))))..)))))))))))).)))))..(((((.(((((...........))))).))))).)))))....)))))))).....))))))..(((....((((((((((((((..((((.((....))))))......(((((((..((((((((....(((((..(.((.....)))..)))))))))))))........(((..(((((.(....).)))))..))).)))))))......)))))))))))))))))...((((((((((((......)))))..)))))))....)))))))))........)) |
|
CentroidFold
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(........)..............(((((...................)))))......((((.............................................(((((((((((((((((((((...))))))))))))))))))))).(((((((.(((((((((((((((((((..(((((((......))))))).(((.(((((....))))).))))))))))..))))))))....)))))))))))........(((((((........)))))))..(((((((((((....((((((((((.......((.(((((.(((((((((((.(......(((((............................................................(((((((.....((.....))....)))))))((((((.....)))))).......................((((((((((((((((((((((((...((((((((.(((((((((((....)))))))))))..)))))))).))))))))).))))))))))......((((....))))....)))))(((((.......)))))(((((..................................................((((.((((((((.......))))))))))))...(((((....)))))...............(((((((((((((.....................(((((((((((...((((((((((...(((((((((((.........(((((((....)))))))...............(((((((...........))))))))))))))))))................((((((.(.....).))))))...........(((((((......................)))))........((....(((((((((((....)))))))))))....))....................(((((((((.........)))))))))((((((((...............((((((((((.....))))))))))....(((......)))...((((((((((((((.......(((((((((((......(((.((((((((((.......(((((....(((...............(((.....)))............))))))))...))))))))))))).......))))......)))))))))))))))))))))(((((((....))))))).........(((((((((((((..((..((((((((....)))))))))).)))))))))).))).......................)))))))).......................)).....(((((((((((....))).))))))))..............(((((((((...)))))))))...((((((........))))))((((((...((...(((((........))))).)).))))))..................................................))))))))))..)))))))))))....((((((((((((....((.(((((((((((((((......((((((...((((((..((.((((((((.......((((((((((((((((.......))....))))))))....)))))).......)))))))).)).....))))))....))))))........................((((.(((..........)))...))))....................((((((...((((((((((((((((((((..................((((((((((...((((....)))).....))))))))))....(((((.(((((.............(((....))).....))))))))))......((((((.......)))))).............((((..((((((.......)))))).)))).............)))))))))))))))))))).....)))))).........((((((........))))))....(((((((((........))))))))).............(((((((((((((((((((((((((..........((((((.((....)).)..........))))).)))))))))))))))))))))))))...........(((((......)))))..........))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))...))))...............)))))(.(((((((...........))))))).)...(((((((((..((((((.......))))))..................)))))))))........((((((((...........))))))))...(((........((((((((((((....)))))))))))).)))..........((((((...........)))))).....................)))))........).)))))))))))))))))).....(((((((......)))))))))))))))))).))))))))))..................((....(((((((....))).)))).......)).............(((((((.........((((((...............))))))..(((((...((((.(((((((((((((....)))))..)))))))))))).))))).((((((((((((...........)))))))))))).........))))))).))))................................((((((.....)))))).............((((((((((....(((((((((......)))..))))))))))))))))...................................................((((((((((.....(((((...((((((......)))))..)))))).....))))))))))......... |
|
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((....))))).............((((...................))))(((..(((((((.............(..........)....................((((((.....((.((((((...)))))).)).....))))))..((((((.((((((((((((((((((((..(((((((......))))))).((..(((((....)))))..)))))))))..))))))))....)))))))))))........(((((((........)))))))..((((((((((((((((....(.(((.......((.(((((.((((((.((((........((((((...........................................................(((((((.....((.....))....)))))))((((.........)))).....................(((((((((((((((((((((((.(....((((((((..((((((((((....))))))..)))).))))))))..).))))).)))))))))))......((((....))))....)))))))(((.......)))(((((((.......(((((...........................)))))......((((.(((((.(.((....))).)))))))))(..(((((....)))))...)...........((((((((((((((.((((((...................((((((((.............(((((((((((..((((...(((((((....)))))))....)))).......(((((((...........))))))))))))))))))........(((((((..((((((((.(((((((((((..(((...................((((((((((..................(((....(((((((((((....)))))))))))....)))...................((((.((((.........)))).))))..........)))))))..)))..........))).....))))))))..))).)))).........(((((((..(((((.......(((((((((((......(((.((((((((((.......(((((....((.................((.....))(((........))))))))))...))))))))))))).......))))......))))))))))))..)))))))(((((((....))))))).........(((((((((((((..((..((((((((....)))))))))).))))))))).))))........................((((((.......))))))...............))))((((((((((....))).))))))))))))))...................(((((((((((..((((((........))))))((((((..(((...(((((........))))).))))))))).((((((................))))))................((((((....))))))..((...(((((....((((....(((.....))).....)))).....)))))..)).((((((((....))))))))..((........((((((((((((((((.......))....))))))))....))))))........))...............(((.....)))...........................((((.(((..........)))...))))....................((((((...((((.(((((.(((((((((....((((............((((((((...((((....)))).....))))))))......(((((.(((((.............(((....))).....))))))))))...(((((((((.......))))))........)))..((((..((((((.(....))))))).))))....)))).....)))))))).)))))).)))).....)))))).........((((((........))))))....(((((((((........)))))))))...............(.....(((((((((((((((((..........(((((..((....))............))))).))))))))))))))))).....)..)))))))))))(((((......)))))..............)))))))).........))))))..)))))))))...)))))...............)))))))(((((((...........))))))).....(((((((((..((((((.......))))))..................)))))))))........((((((((...........))))))))..........(...((((((((((((....)))))))))))).....)........(((((((.........)))))))....................))))))..........)))).))))))))))))).....(((((((......)))))))))).))))))).)))))))))).................((((...(((((((....))).))))......))))............(((((((.........((((((...............))))))..(((((....((((.((((((((((((....)))))..)))))))))))..)))))(((((((.(((((...........))))).)))))).).......)))))))))))))).)))..........................((((((.....)))))).............((((((((((....(((((((((......)))..))))))))))))))))(((((......)))))...................................((((((((((.....(((((...((((((......)))))..)))))).....))))))))))......... |
|
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((....))))).((((....))))((((...................))))(((..(((((((...........((((........))))......((.......))(((((((.....((.((((((...)))))).)).....))))))).((((((.((((((((((((((((((((..(((((((......))))))).(((.(((((....))))).))))))))))..))))))))....)))))))))))........(((((((.(....).)))))))((((((((((((((((((....(.(((.....(.((.(((((.((((((.((((.......(((((((..............(((((..............)))))..((((((.............(((((((..((.(((...))).)).)))))))((((((.....))))))............))))))...(((((((((((((((((((((((.((...((((((((..(((((((((((..)))))))..)))).)))))))).)).))))).)))))))))))......((((....))))....)))))))(((.......)))(((((((......((((((.(((......)))..............)))))).....((((.(((((.(.((....))).)))))))))((.(((((....))))).).)((.(..(((..((((((((((((((.((((((...(......)..(((((.((((((((.............(((((((((((..((((...(((((((....)))))))....)))).......(((((((...........))))))))))))))))))........(((((((..((((((((.((((((((((((((((((((...((..........((((((((((.............((...(((..(.(((((((((((....))))))))))).)..)))..))............((.((((.((((.........)))).)))).)).......)))))))..)))))....))))))).))..))))))))..))).)))).........(((((((..(((((.......((((((((((((.....(((.((((((((((...(...(((((....((.................((.....))(((........)))))))))))..))))))))))))).....).))))(())..))))))))))))..)))))))((((((((())))))))).........(((((((((((((..((..((((((((....)))))))))).))))))))).))))........................((((((.......))))))...............))))((((((((((....))).))))))))))))))...(((.......)))...(((((((((((..((((((........))))))((((((..(((...(((((........))))).)))))))))((((((((....)..........)))))))(.............(((((((....)))))))((((..(((((((..((((...((((.....))))....))))..)).))))).))))((((((((....)))))))).((((.......((((((((((((((((.......))....))))))))....)))))).......))))......)......((((.....))))(((.....)))...............((((((((..........)))..)))))............((......((((((...((((.(((((.(((((((((....(((((........((.((((((((..(((((....))))..)..)))))))).))...(((((.(((((.(..........((((....))))..).))))))))))...(((((((((.......))))))........)))..((((..((((((.((())))))))).))))...))))).....)))))))).)))))).)))).....))))))....)).(.((((((........)))))).)..(((((((((........))))))))).(.........).((((....(((((((((((((((((..........((((((.((....)).)..........))))).)))))))))))))))))....)))))))))))))))(((((......)))))..............))))))))..))..)))))))))..)))))))))...)))))).))..).)).....)))))))(((((((...........))))))).....((((((((((.((((((.......))))))).................))))))))).......(((((((((...........)))))))))..(((...(((..(((((((((((((())))))))))))))..)..))...))).(((((((.........))))))).......((.......))..))))))).........)))).))))))))))))).)...(((((((......)))))))))).))))))).))))))))))..)).............((((...(((((((....))).))))......))))............(((((((..(((....((((((..((.(....)..))))))))..(((((...(((((.(((((((((((((()))))))..)))))))))))).)))))(((((((.((((((.......)..))))).)))))).))))....)))))))))))))).)))(((.(......(((.....)))....((((((.....)))))).............((((((((((....(((((((((......)))..))))))))))))))))(((((......)))))).)))..............................((((((((((.....(((((...((((((......)))))..)))))).....))))))))))......... |
|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. |
|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((....))))).(((((((..(((((((..((....((((.((.....((.((((....((..((....))..)).)))).)).....(((..((..((((......(((((((.....((.((((((...)))))).)).....))))))).((((((.(((((((..((((((((((...(((((((......)))))))((((.(((((....))))).))))))))))..))))..))....))))))))))).....))))..))..))).))))))..(((((((((((((((.....((((((.(((......(((.(((((.((((((.(((.......((....)).........................(((((.((((((((((((((....((((((.(((..(((((.((((((...((((...((((.(((((((.((....))))))))).....))))...))))..(((((((((((((..((((((((......((((((((..((((((((((....))))))..)))).))))))))....)))))).))..))))))......((((....))))....)))))))....)))))).))))).((((((((..(((((.(((......)))...(((....))).)))))((((..((((.(((((...((....))..)))))))))...(((((....))))).....((((((...((((...(((((((((...(((((((((...((((.((..((((((((((..(((((((...(((((((..(((.((((...(((((((....)))))))....))))....(((((((.....)))))))........)))..)))))))...(((........))).)))))))....((..(((.((((....((((.(((((.((((((.....))).)))...))))).))))....((((((((((((((((....))))))))))..((((((..(((.........)))..((((.((((.........)))).)))).......))))))..))))))..((((....))))..)))))))..))....)))).....((....(((((((..(((((.......(((((((((((......(((.((((((((((.......(((((..(((((((.........))...)))))...((((........)))).)))))...))))))))))))).......))))......))))))))))))..)))))))(((((((....)))))))....))...(((((((((((((..((..((((((((....)))))))))).)))))))))).)))...))))))..)).)).))...)))))))))......)))))))))...))))........(((((((((((....)))).)))))))...)))))))))).)))))))).....))).)))))).((((((........)))))).(((((..(((...(((((........))))).))))))))...))))))....(((...(((((((...(((((((((((((.(((((((((.......)))))))))....(((...(((((.((..((....((.(((((((..((((((((((..(((.(((((..(((((((((((..((((((((((...((.(((((((((((.......)))....))))))))))))).)))))))...(((......))).(((...((..(((...((((.....))))....))).))...))).))))))))......((((......))))...))).))))))))..((((((...((((.(((((..((((((((((..(((.............((((((((...((((....)))).....)))))))).(((((((((...((((((...((.....((((....)))).....)).))))))...)))))))))......)))..)).........(((.((((..((((((.......)))))).))))...))).......))))))))..))))).)))).....)))))).......))))).(((((...(((((.((....(((((((((........))))))))).............((((....(((((((((((((((((..............((.((....)).)).(((......)))..)))))))))))))))))....))))....)).)))))((((......))))...)))))....)))))..))))))).))))..)).)))))..)))...(((((..((((....((((((..((((((.(((((((...........))))))).))..(((((((((..((((((.......)))))).....((......))...))))))))).......(((((((((...........)))))))))...))))......((((((((((((....)))))))))))).)))))).......))))...)))))..)))))))))).)))..)))))))..)))....)))))))).)))))))).))))))))))).)))...(((((((......)))))))))).))))))..))))))))))..)))))...)).))).))))...(((((((....))).))))..))))))).(((.(((((..((((((((..(((((..((((((...............))))))..(((((...(((.((((((((((((((....)))))..)))))))))))).)))))..(((((.(((((...........))))).))))).)))))....)))))))).......((((((.(((.(((......((((((((.((((.((....))))))......)))))))).((((((((....(((((.(((......)))...)))))))))))))............))).))).))))))....))))).))).((((.(((((....(((((((((.....(((((....(((((......)))))...))))).....)))))))))))))).)))) |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((....))))).(((((((.((.((.((((((((..((((.((.....((.((((....((..((....))..)).)))).)).....((((..(..((((......(((((((.....((.((((((...)))))).)).....))))))).(((((((.((((((((((((((((((...(((((((......)))))))((((.(((((....))))).))))))))))..))))))))....))))))))))).....))))..)..)))).)))))).((((..((((((((((.....((((((.(((......(((.(((((.((((((.(((.......((....)).........................(((((.((((((((((((((....((((((.(((..(((((.((((((...((((...((((.(((((((.((....))))))))).....))))...))))..((((((((((((((..(((((((......((((((((..((((((((((....))))))..)))).))))))))....)))))).)..)))))))......((((....))))....)))))))....)))))).))))).((((((((..(((((.(((......)))...(((....))).)))))((((..((((.(((((...((....))..))))))))).(.(((((....))))).)...((((((...((((...((((((((((..(((((((((...((((.((..(..(((((((..(((((((...(((((((..(((.((((...(((((((....)))))))....))))....(((((((.....)))))))........)))..))))))).(((....).))......)))))))....((..((((.(((....((((.(((((.((((((.....))).)))...))))).))))....((((((((((((((((....))))))))))..((((((..(((.........)))..((((.((((.(......))))).)))).......))))))..))))))..((((....))))..)))))))..))....)))).....((....(((((((..(((((.......(((((((((((......(((.((((((((((...(...(((((..(((((((.........))...)))))...((((........)))).))))))..))))))))))))).......))))......))))))))))))..)))))))(((((((....)))))))....))...(((((((((((((..((..((((((((....)))))))))).)))))))))).)))...)))..)..)).)).))...)))))))))..)...)))))))))...))))........(((((((((((....))).))))))))...)))))))))).)))))))).....))).)))))).((((((........)))))).(((((..(((...(((((........))))).))))))))...))))))....(((...(((((((...(((((((((((((.(((((((((.......)))))))))....(((...(((((.((..((....((.(((((((..((((((((((..((((((...((((((.(((.(((.((((...(...(((((((((......))).((...(((.....)))...)).))))))...)...)))).))).)))....))))))....)))))).((((((((.....(.((((...(((.(((.........(((((....(....).....)))))))))))..)))).)...((((.(((((..((((((((((..(((.............(((((((....(((((.(....).)))))))))))).(((((((((...((((((...((.....((((....)))).....)).))))))...)))))))))......)))..)).........(((.((((..((((((.......)))))).))))...))).......))))))))..))))).))))..))))).))).......))))).(((((...(((((.((....(((((((((........))))))))).............((((....((((((((((((((((((((((.....(.(((..((....)).))).)....)).)))..)))))))))))))))))....))))....)).)))))((((......))))...)))))....)))))..))))))).))))..)).)))))..)))...(((((..((((....((((((..((((((.(((((((...........))))))).))..(((((((((..((((((.......)))))).....((......))...))))))))).......(((((((((.(........))))))))))...))))......((((((((((((....)))))))))))).)))))).......))))...)))))..)))))))))).)))..)))))))..)))....)))))))).)))))))).))))))))))).)))...(((((((......)))))))))).))))))..))))))))))....(....)..)))).))))))))...(((....))).)).)).))))))).(((.(((((..((((((((..(((((..((((((.....(....)....))))))..(((((...(((((((.((((((((((....)))))..)))))))))))).)))))..(((((.(((((...........))))).))))).)))))....)))))))).......((((((.(((.(((......((((((((.((((.((....))))))......)))))))).((((((((....(((((.(((......)))...)))))))))))))............))).))).))))))....))))).))).((((.(((((....(((((((((.....(((((....(((((......)))))...))))).....)))))))))))))).)))) |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((....)))))...................................................................................(..((((.......((((((.....((.((((((...)))))).)).....))))))..(((((((.((((((.(((((((((((...(((((((......)))))))((((.(((((....))))).))))))))))..))))).))....))))))))))).....))))..).............(((((..((((((((((.....((((((.(((.......((.(((((.((((((.(((.......((....)).........................(((((.((((((((((((((....((((((.(((..(((((.((((((...((((...((((.(((((((.((....))))))))).....))))...))))..((((((((((((((..(((((((......((((((((......((((((....)))))).......))))))))....)))))).)..)))))))......((((....))))....)))))))....)))))).))))).((((((((...((((...........................)))).......((((.(((((...((....))..))))))))).(.(((((....))))).)....(((((..........(((((((((....((((((((...((....(..(..((.......(((((((...(((((((..(((.((((...(((((((....)))))))....))))....(((((((.....)))))))........)))..)))))))...(....).........))))))).......................................................................(((((((((((....)))))))))))..........................((((.((((.(......))))).))))...................................................................(((((((...(((...............((((......(((.((((((((((.......(((((...((((................))))....((((........)))).)))))...))))))))))))).......))))..............)))...)))))))(((((((....))))))).........(((((((((((((..((..((((((((....)))))))))).)))))))))).)))....))..)..).....))...)))))))).......)))))))))...............(((((((((((....)))).)))))))...)))))......)))))))).....))).)))))).((((((........))))))((((((...((...(((((........))))).)).))))))..))))))....(((...(((((((...(((((((((((((.(((((((((.......)))))))))....((...((((((.((..((....((.(((((((..(((((.................................((((.(......(..(((((((.((.......)).....))))))).)...)..))))..................................................((((.(....((..(((.((......(((((....(....).....)))))........((((((...((((.(((((..((((((((....................((((((((....((((........)))))))))))).(((((((((...((((((...((.....((((....)))).....)).))))))...)))))))))......................((..((((..(((((.........))))).))))....)).......))))))))..))))).)))).....)))))).........((((((........))))))....(((((((((........)))))))))))..))).))....).)))).(((((((((((((((((((.((.....(.(((..((....)).))).)....))..))..)))))))))))))))))...................(((((......)))))...........)))))..))))))).))))..)).))))).).))...(((((..((((..(..(((((...(((...(((((((...........))))))).....(((((((((..((((((.......))))))..................))))))))).......(((((((((...........)))))))))...))).......((((((((((((....)))))))))))).))))).....)..))))...)))))..)))))))))).)))..)))))))..)))....)))))))).)))))))).))))))))))).))....(((((((......)))))))))).))))))..))))))))))....(....)..))))).......(((((((....))).))))...............((((..((((((((..(((((..((((((.....(....)....))))))..(((((...(((((.((((((((((((....)))))..)))))))))))).))))).((((((.(((((...........))))).)))))))))))....)))))))).......((((((.(((...................((((.........)))).............((((((((((....(((((.(((......)))...)))))))))))))))..............))).))))))....))))......((((.(((((....(((((((((.....(((((....(((((......)))))...))))).....)))))))))))))).)))) |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((....))))).((((((...(((((((..((....((((.((.....((..(((........((....)).....)))..)).....((((..(..((((......(((((((.....((.((((((...)))))).)).....))))))).(((((((.((((((..((((((((((...(((((((......)))))))((((.(((((....))))).))))))))))..))))..))....))))))))))).....))))..)..)))).))))))..(((((((((((((((.....((((((.(((.......((.(((((.((((((.(((.......((....)).........................(((((.((((((((((((((....((((((.(((..(((((.((((((...((((...((((.(((((((.((....))))))))).....))))...))))..(((((((((((((..((((((((......((((((((..((((((((((....))))))..)))).))))))))....)))))).))..))))))......((((....))))....)))))))....)))))).))))).((((((((..(((((.(((......)))...(((....))).)))))((((..((((.(((((...((....))..)))))))))...(((((....))))).....((((((...((((...((((((..(...(((((((((...((((..(..(..(((((((..(((((((...(((((((..(((.((((...(((((((....)))))))....))))....(((((((.....)))))))........)))..)))))))...(((........))).)))))))....((..((((.(((.......(((....)))...((((((((((..((((....((..((..(((....(((((..((((....))))..)))))....)))...(((((.((.((((.((....)).)))).)).))))).))..))...))))...)))))))..))).((((....))))..)))))))..))....)))).....((....(((((((..(((((.......(((((((((((......(((.((((((((((.......(((....)))((((.....((.(((...)))))...((((........))))...))))..))))))))))))).......))))......))))))))))))..)))))))(((((((....)))))))....))...(((((((((((((..((..((((((((....)))))))))).)))))))))).)))...)))..)..)..)).))...)))))))))......)..))))))...))))........(((((((((((....))).))))))))...)))))))))).)))))))).....))).)))))).((((((........)))))).(((((..(((...(((((........))))).))))))))...))))))....(((...(((((((...(((((((((((((..((((((((......))))))))......(((...(((((.((..((....((.(((((((..(((((((((((......)))))...(((((((((..((((((((((...(((.((((((((((.......)))....))))))))))))).)))))))...(((......))).(((...((..(((...((((.....))))....))).))...))).)))))))))......(((......))).((((((((.((((((..((((((.((((...(((((..((((((((..((..((........((((((((((((...((((....)))).....)))))))..(((((((((...((((((..(((.....((((....)))).....)))))))))...)))))))))..))))).........))..))(((.((((..((((((.......)))))).))))...))).......))))))))..)))))..........((.(((.........((((((........))))))....(((((((((........)))))))))))).))..))))))))))...(((((((((((((((((..............((.((....)).)).(((......)))..)))))))))))))))))..............))))))((((......))))..)))))))).))))))..))))))).))))..)).)))))..)))...(((((..((((....((((((..((((((.(((((((...........))))))).))..(((((((((..((((((.......)))))).....((......))...))))))))).......(((((((((...........)))))))))...))))......((((((((((((....)))))))))))).)))))).......))))...)))))..)))))))))).)))..)))))))..)))....)))))))).)))))))).))))))))))))).....(((((((......)))))))))).))))))..))))))))))..)))))...)).))).))))...(((((((....))).))))........))))))(((((..((((((((..(((((..((((((...............))))))..(((((...(((((((.((((((((((....)))))..)))))))))))).)))))..(((((.(((((...........))))).))))).)))))....)))))))).......((((((.(((..(((((.....)))))..((((.((....)))))).............((((((((((....(((((..(.((.....)))..)))))))))))))))..............))).))))))....))))).....((((.(((((....(((..((((.....(((((....(((((......)))))...))))).....))))..)))))))).)))) |
