RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 3KTW_C

RNA: 3KTW_C
Rfam family: -

			AGAUAGUCGUGGGUUCCCUUUCUGGAGGGAGAGGGAAUUCCACGUUGACCGGGGGAACCGGCCAGGCCCGGAAGGGAGCAACCGUGCCCGGCUAUC
Reference structure (std)		[ sec struct ]	.(((....((..((((.((((((....)))))).))))...))......((((.....(((.....(((....))).....)))..))))...)))
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	.((..((.(((<((((.((((([..{(]))))).))))(>))).)....(((((.(...((.(..(((....})))).)..))))))))))..).)                                                                      (  )                                                                                  (                        )                                                                            (              )                                                                                (                )                   (                                                                                           )                                                                      (    )                                                                       (                                         )         (                                                                                         )                                                         (                            )                                       (                                             )
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	N/A
Alterna	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((((((((((((((((((....)))))))))).))))...((.((((.....)))).))(((.(((..........))).)))))))))))
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((((((((((((((((((....))))))))))).)))))..(.((((.....)))).).(((.(((..........))).)))..))))))
CentroidFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((((((((((((((((((....))))))))))).)))))..(.((((.....)))).).(((.(((..........))).)))..))))))
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((((((((((((((((((....))))))))))).))))).((.((((.....)))).))(((.(((..(....)..))).)))..))))))
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((.((((((((((((((((....)))))))))).))))))....(((((.(...(((.....(((....))).....)))).))))))))))
MCFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((.((((((((((((((((....))))))))))).)))))(((((((((...))))))))).((((((((((.(..))))))))))))))))
MCFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((.((((((((((((((((....))))))))))).)))))(((.((((.....)))).))).((.((.(.((.....)).).)).)))))))
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((((((((((((((((((....))))))))))).))))).((.((((.....)))).))..(((....))).(........)...))))))
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((((.(((((((((((((....)))))))))))))((((....(((((.............)))))...........))))..))))))))
Pknots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((.((((((((((((((((....)))))))))).))))))....((((.....))))((.(((((....))).(((....))))))))))))
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((.((((((((((((((((....))))))))))).)))))....(((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))))))
RDfolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((((...((((((((((((((............))))......((((.....))))........)))))))))).........))))))))
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((.((((((((((((((((....)))))))))).))))))....(((((.(...(((.....(((....))).....)))).))))))))))
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((((.(((((((((((((....))))))))))))).(((.((.((((.....)))).)).((((....))..))...)))...))))))))
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((.((((((((((((((((....))))))))))).)))))....(((((.(...(((.....(((....))).....)))).))))))))))
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((.(((((.((((((((((....))))))))))..)))))....(((((.(...(((.....(((....))).....)))).))))))))))
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((.((((((((((((((((....))))))))))).)))))....(((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))))))
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.......(((((((((((((((......))))))))).))))))....((((.....))))...(((.(((................))))))...
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.......((((((((((((((((....)))))))))).))))))....((((.....))))...(((.(((................))))))...

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