RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 3LA5_A

RNA: 3LA5_A
Rfam family: Purine

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Reference structure (std)		[ sec struct ]	((((((((([..((((((......{{.))))))(.....])((((((}}.....))))))..)))))))))
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Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))))
Alterna	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))))
Carnac(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.......................................................................
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CentroidAlifold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((((...(((((((.......)))))))........((((((.......))))))..)))))))).
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CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))))
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Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))))
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))))
MCFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((...((.(.(...((.(((((.((.(....).)).).)))).))...).).)).)))))))))
MCFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((..((((((((((((((((((((((....)))))).))))))))))))))))))))))))))
MXScarna(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...((((((...(((((((.......)))))))........((((((.......))))))..))))))...
MXScarna(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((((...(((((((.......)))))))........((((((.......))))))..)))))))).
Mastr(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.......................................................................
Mastr(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))).
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))))
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))))
Murlet(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((((.....((((.........))))..(((........(((.......)))..))))))))))..
Murlet(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((((...(((((...........)))))........((((...........))))..)))))))..
PETfold_pre2.0(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((((((.(((((((.......)))))))(...))).((((((.......))))))..)))))))).
PETfold_pre2.0(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((((...(((((((.......)))))))((....))((((((.......))))))..)))))))..
Pknots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((...((((((.........))))))(......)((((((.......))))))..)))))))))
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))))
RDfolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))))
RNASampler(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))).
RNAalifold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((((.....((((.........))))..(((......(((((.......)))))))))))))))..
RNAalifold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))..
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))))
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((....(((((.........))))).........((((((.......))))))..)))))))))
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))))
RSpredict(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....(((((..((((((.........))))))......).((((((.......))))))..)))).....
RSpredict(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((((((..((((((.........))))))......).((((((.......))))))..)))))))..
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))))
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))))
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))))
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((.........)))...((((............))))..))))....(((((.......))))).

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