RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 3NDB_M

RNA: 3NDB_M
Rfam family: -

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Reference structure (std)		[ sec struct ]	.(((.(..(((((((((.(((((..(((((.(((((((((....)))))))))..)))))....((((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))).))))))).))))))).....).))).
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	.(((((.((((((((((.((((((((((([.((((((((({.(}))))))))).(])))))...((((((((....((((..((((...))))).).)))))))))))))))))))).)))))))....)))))).                                                                                (                )                                                                                   (                                              )                                                                                                                              (              )                                                                                                                    (                        )                                                                                                                          (  )                                                                                                     (                    )
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((((.(((((..(((((.(((((((((....)))))))))..)))))....((((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))).))))))).))))))))...)))))))
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((..((((((..(((((.(((((((((....)))))))))..)))))....((((((..(..(((.....(((....))).....)))).)))))).))))))..))))))))...)))))))
CentroidFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((..((((((..(((((.(((((((((....)))))))))..)))))....((((((..(..(((.....(((....))).....)))).)))))).))))))..))))))))...)))))))
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((((((.((((((..(((((.(((((((((....)))))))))..)))))....((((((..(..(((.....(((....))).....)))).)))))).))))))).))))))))...)))))))
Cylofold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((.......(((((((..((((((((...[[[)))))))).....]]]...{{{{{{...)))))))...(((....)))..........}}}}}}.........)))))))))...))))))
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((((.(((((..(((((.(((((((((....)))))))))..)))))....((((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))).))))))).))))))))...)))))))
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((((.(((((..(((((.(((((((((....)))))))))..)))))....((((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))).))))))).))))))))...)))))))
MCFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((.((((((.((((((((((((..(((((((((....)))))))))..))))....))).))))).))))))....((((..((.(..(.(((.(......).))).).).))..)))))).)))))))
MCFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((....)))))))))))))))....))).)))))))))))))...(((((((((((.(((((((((..)))))))))))))))))))))).)))))))
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((((.(((((..(((((.(((((((((....)))))))))..)))))....((((((..(((........(((....)))......))).)))))).))))))).))))))))...)))))))
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((..((((((..(((((.(((((((((....)))))))))..)))))....((((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))).))))))..)))))))))...))))))
Pknots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((((.(((((..(((((.(((((((((....)))))))))..)))))....((((((...((......))(((....))).((....)).)))))).))))))).))))))))...)))))))
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((((.(((((..(((((.(((((((((....)))))))))..)))))....((((((..(((..((....(((....))).))...))).)))))).))))))).))))))))...)))))))
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((((.(((((.((((((.(((((((((....)))))))))..)))))....((((((..(((........(((....)))......))).)))))))))))))).))))))))...)))))))
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((((.(((((..(((((.(((((((((....)))))))))..)))))....((((((..(((..((....(((....))).))...))).)))))).))))))).))))))))...)))))))
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((((((((.((((..(((((.(((((((((....)))))))))..)))))....((((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))).))))))).))))))))...)))))))
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((((.(((((..(((((.(((((((((....)))))))))..)))))....((((((..(((..((....(((....))).))...))).)))))).))))))).))))))))...)))))))
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((((.(((((..(((((.(((((((((....)))))))))..)))))....((((((.............(((....)))..........)))))).))))))).))))))))...)))))))
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((((.(((((..(((((.(((((((((....)))))))))..)))))....((((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))).))))))).))))))))...)))))))
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....((((....)))).((((((.(((((.(((((((((....)))))))))..))))).....))))))...(((((....((((.....((((..(((...........)))..)))).))))...)))))..
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....((((....)))).(((((({{{{(((..[[[)))...(((((.]]].....)))))....))))))...}}}}.....((((...........(((...........)))..((((....)))).))))..

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