RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 3NKB_B

RNA: 3NKB_B
Rfam family: -

			GGUCCGCAGCCUCCUCGCGGCGCAAGCUGGGCAACAUUCCGAAAGGUAAUGGCGAAUGCGGACC
Reference structure (std)		[ sec struct ]	(((((((((((.[[....))).......]]....((((((....)).)))).....))))))))
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	(((((((((((({{..).))).......}..[}(.((((((..))).)))])....))))))))             (                )                                                                 ( )                                                                  (               )                                 (                                   )
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((......((((....)))))))..((((((....)).)))).....))))))))
Alterna	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((.(((.(((((....)))..))...........)))....)))...))))))))
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((......((((....))))......(((((....)).))))))...))))))))
CentroidFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((......((((....))))......(((((....)).))))))...))))))))
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((.((...((((....))))))....(((((....)).))))))...))))))))
Cylofold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((......((((....)))).....................)))...))))))))
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((.(((..(((.....((...))......)))..)))....)))...))))))))
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((......((((....)))))))..((((((....)).)))).....))))))))
MCFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((.((((((((..))))))).).(((((((..))).)))))))))))))))))
MCFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((..(.(.((.((((....)))).).).((((((....)).))))).)..))))))))
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((......((((....)))))))..((((((....)).)))).....))))))))
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((...(((((((....))))..........)))........)))...))))))))
Pknots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((......((((....))))(....)(((((....)).))))))...))))))))
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((......((((....)))))))..((((((....)).)))).....))))))))
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((......((((....)))))))..((((((....)).)))).....))))))))
RDfolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((.(((..(((..................)))..)))....)))...))))))))
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((......((((....)))))))..((((((....)).)))).....))))))))
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((.........((((....)))).((..((((((....)).))))))...))))))))
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.(((......((((....)))))))..((((((....)).))))......)))))))
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((.........((((....)))).....((((((....)).)))).....))))))))
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((......((((....)))))))..((((((....)).)))).....))))))))
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((......(((....)))))))..((((((....)).)))).....))))))))
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((......(((....)))))))..((((((....)).)))).....))))))))

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